278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1796 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  100 
 
 
365 aa  735    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  55.22 
 
 
366 aa  418  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2539  prephenate dehydrogenase  43.47 
 
 
369 aa  285  8e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213601  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  38.59 
 
 
367 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  35.81 
 
 
378 aa  246  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  36.09 
 
 
366 aa  246  6e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  37.93 
 
 
367 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  35.81 
 
 
366 aa  245  8e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  35.54 
 
 
366 aa  245  8e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  35.81 
 
 
366 aa  245  9e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  35.54 
 
 
366 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  35.54 
 
 
378 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  35.54 
 
 
366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  35.81 
 
 
366 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  33.61 
 
 
367 aa  238  9e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  35.26 
 
 
369 aa  237  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  35.81 
 
 
364 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1349  prephenate dehydrogenase  36.09 
 
 
334 aa  228  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000774575  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  44.24 
 
 
280 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0936  prephenate dehydrogenase  39.77 
 
 
362 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  42.91 
 
 
280 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  31.58 
 
 
364 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  32.7 
 
 
373 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  30.64 
 
 
370 aa  209  9e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  36.17 
 
 
287 aa  206  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  34.4 
 
 
290 aa  205  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  34.91 
 
 
363 aa  204  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  34.91 
 
 
363 aa  204  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  31.76 
 
 
375 aa  202  7e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  35.46 
 
 
286 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  32.61 
 
 
379 aa  199  7.999999999999999e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  32.76 
 
 
360 aa  195  8.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  33.82 
 
 
368 aa  194  3e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  28.8 
 
 
356 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  34.03 
 
 
297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  33.21 
 
 
286 aa  189  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  34.75 
 
 
286 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  33.21 
 
 
286 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2103  Prephenate dehydrogenase  31.61 
 
 
360 aa  185  9e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  30.5 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  30 
 
 
291 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  33.92 
 
 
299 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 
288 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  32.7 
 
 
328 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1331  Prephenate dehydrogenase  30.54 
 
 
390 aa  180  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.762233  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.83 
 
 
748 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.97 
 
 
312 aa  176  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1908  prephenate dehydrogenase  35.02 
 
 
354 aa  176  8e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.86 
 
 
742 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  32.39 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3393  Prephenate dehydrogenase  34.51 
 
 
303 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  32.75 
 
 
286 aa  172  6.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.86 
 
 
298 aa  170  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1206  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.57 
 
 
780 aa  169  5e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.610993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  28.87 
 
 
309 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.94 
 
 
770 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  30.89 
 
 
322 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  31.47 
 
 
292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  31.1 
 
 
293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  31.1 
 
 
293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  31.67 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0393  arogenate dehydrogenase  31.1 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0833829  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  28.23 
 
 
307 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.9 
 
 
312 aa  162  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.04 
 
 
311 aa  162  8.000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1184  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.1 
 
 
778 aa  161  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  28.92 
 
 
319 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.43 
 
 
746 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.77 
 
 
735 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.63 
 
 
311 aa  159  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.63 
 
 
313 aa  158  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  32.86 
 
 
318 aa  159  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.29 
 
 
301 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.67 
 
 
746 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  31.53 
 
 
339 aa  157  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1163  prephenate dehydrogenase  33.45 
 
 
283 aa  156  5.0000000000000005e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.83 
 
 
311 aa  156  6e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.34 
 
 
310 aa  156  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  36.65 
 
 
280 aa  156  7e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2146  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.9 
 
 
745 aa  155  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.470632  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.74 
 
 
313 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.08 
 
 
311 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.08 
 
 
311 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.99 
 
 
321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  32.14 
 
 
293 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.99 
 
 
321 aa  153  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.93 
 
 
319 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1647  Prephenate dehydrogenase  30.2 
 
 
312 aa  153  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  32.62 
 
 
293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  27.89 
 
 
746 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.72 
 
 
314 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.79 
 
 
746 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.02 
 
 
746 aa  152  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.21 
 
 
308 aa  152  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.89 
 
 
314 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.1 
 
 
307 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  29.27 
 
 
286 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.43 
 
 
752 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4079  prephenate dehydrogenase  31.76 
 
 
330 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  31.56 
 
 
285 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>