More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2723 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2723  threonine dehydratase  100 
 
 		 331 aa  653    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6145  threonine dehydratase  54.89 
 
 		 323 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000638  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme beta subunit  54.29 
 
 		 324 aa  302  5.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3864  threonine dehydratase  55.67 
 
 		 330 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0056  threonine dehydratase  52.8 
 
 		 344 aa  298  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.595  hitchhiker  0.00751641 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6018  threonine dehydratase  53.33 
 
 		 323 aa  295  7e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5774  threonine dehydratase  52.38 
 
 		 323 aa  289  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5805  threonine dehydratase  55.38 
 
 		 323 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6169  threonine dehydratase  55.38 
 
 		 323 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0794807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3469  threonine dehydratase  56.37 
 
 		 324 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6650  threonine dehydratase  55.38 
 
 		 323 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.987033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2151  threonine dehydratase  53.67 
 
 		 319 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.232832  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4430  threonine dehydratase  48.12 
 
 		 330 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000773933 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4376  ectoine utilization protein EutB  54.55 
 
 		 325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5519  threonine dehydratase  52 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0114285 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5240  threonine dehydratase  50.15 
 
 		 333 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3695  threonine dehydratase  50 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0285  threonine dehydratase  52.1 
 
 		 318 aa  241  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.832074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  40.48 
 
 		 405 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3175  threonine dehydratase  55.6 
 
 		 318 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.465407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  35.83 
 
 		 403 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  33.94 
 
 		 403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  42.45 
 
 		 412 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  38.63 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  35.51 
 
 		 403 aa  192  8e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1924  threonine dehydratase  36.12 
 
 		 418 aa  192  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14942  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  38.37 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4405  hypothetical protein  42.47 
 
 		 321 aa  189  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  34.89 
 
 		 403 aa  189  8e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2925  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  42.36 
 
 		 318 aa  187  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.412032 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  34.58 
 
 		 403 aa  186  3e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0748  hypothetical protein  41.28 
 
 		 321 aa  186  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0137711  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  34.06 
 
 		 403 aa  186  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  40.19 
 
 		 403 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  39.18 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  35.11 
 
 		 403 aa  182  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  38.61 
 
 		 506 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  38.94 
 
 		 403 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  38.61 
 
 		 506 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  42.53 
 
 		 406 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  40.06 
 
 		 399 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  32.91 
 
 		 402 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  35 
 
 		 404 aa  179  4.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  37.85 
 
 		 514 aa  179  7e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  36.77 
 
 		 509 aa  177  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  42.01 
 
 		 416 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  38.91 
 
 		 408 aa  177  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  38.44 
 
 		 402 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  39.25 
 
 		 411 aa  176  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  39.76 
 
 		 402 aa  176  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  38.01 
 
 		 403 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  38.85 
 
 		 409 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  40.99 
 
 		 403 aa  176  7e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  37.95 
 
 		 418 aa  175  9e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0227  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.89 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  34.38 
 
 		 400 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1720  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.94 
 
 		 330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  31.65 
 
 		 402 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1447  threonine dehydratase  33.74 
 
 		 420 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.102012  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  37.82 
 
 		 400 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  37.5 
 
 		 402 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1892  threonine dehydratase  33.13 
 
 		 420 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1718  threonine dehydratase  33.13 
 
 		 420 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1695  threonine dehydratase  33.13 
 
 		 420 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1854  threonine dehydratase  33.13 
 
 		 420 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1711  threonine dehydratase  33.43 
 
 		 420 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  35.22 
 
 		 503 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1670  threonine dehydratase  33.13 
 
 		 420 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0405  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.75 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0956264  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  37.17 
 
 		 403 aa  170  3e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1003  threonine dehydratase  34.28 
 
 		 415 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000180707  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  34.47 
 
 		 402 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  36.39 
 
 		 402 aa  169  4e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  35.85 
 
 		 401 aa  170  4e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  31.66 
 
 		 437 aa  170  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  35.85 
 
 		 401 aa  170  4e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  38.65 
 
 		 402 aa  169  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1938  threonine dehydratase  32.83 
 
 		 412 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  37.8 
 
 		 414 aa  169  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3487  threonine dehydratase  32.83 
 
 		 420 aa  169  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  34.17 
 
 		 401 aa  169  7e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  32.49 
 
 		 511 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3564  threonine dehydratase  36.42 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5911  threonine dehydratase  32.8 
 
 		 424 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  38.02 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2586  threonine dehydratase  34.65 
 
 		 423 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5685  threonine dehydratase  34.47 
 
 		 517 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000112731  normal  0.257645 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  32.49 
 
 		 511 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1855  threonine dehydratase  32.52 
 
 		 420 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4146  hypothetical protein  37.42 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  40.06 
 
 		 402 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1584  threonine dehydratase  33.63 
 
 		 423 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000192202  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3798  hypothetical protein  37.42 
 
 		 320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0008  hypothetical protein  37.42 
 
 		 320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1970  threonine dehydratase  32.83 
 
 		 420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  31.96 
 
 		 511 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  36.71 
 
 		 400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0951  threonine dehydratase  33.43 
 
 		 517 aa  166  4e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  35.6 
 
 		 501 aa  166  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  33.97 
 
 		 402 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>