More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2384 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2384  Na+/solute symporter  100 
 
 
481 aa  945    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1079  Na+/solute symporter  38.46 
 
 
501 aa  310  4e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  27.56 
 
 
492 aa  107  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  27.53 
 
 
483 aa  106  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2227  sodium/panthothenate symporter  27.13 
 
 
477 aa  99.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0585956  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  26.61 
 
 
483 aa  99  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  27.77 
 
 
483 aa  98.6  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  27.66 
 
 
477 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1657  sodium/panthothenate symporter  28.25 
 
 
477 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343419 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1677  sodium/panthothenate symporter  26.01 
 
 
479 aa  96.3  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3346  sodium/panthothenate symporter  28.01 
 
 
479 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000197319  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  28.38 
 
 
484 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3607  sodium/panthothenate symporter  28.01 
 
 
479 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.258245  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3660  sodium/panthothenate symporter  28 
 
 
477 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  28.38 
 
 
484 aa  95.1  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  28.38 
 
 
484 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  26.92 
 
 
487 aa  95.1  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3570  sodium/panthothenate symporter  28.26 
 
 
477 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3255  sodium/panthothenate symporter  27.75 
 
 
477 aa  95.9  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.344037  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  27.52 
 
 
483 aa  95.1  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  28.01 
 
 
479 aa  94.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2877  sodium/panthothenate symporter  26.21 
 
 
481 aa  94.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510653 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  28.38 
 
 
483 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3560  sodium/panthothenate symporter  28.01 
 
 
479 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000874922 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  28.01 
 
 
479 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  28.38 
 
 
483 aa  94.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  28.38 
 
 
483 aa  94.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  28.15 
 
 
483 aa  94  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  28.15 
 
 
483 aa  94  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2874  sodium/panthothenate symporter  28.29 
 
 
495 aa  94  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  27.83 
 
 
481 aa  93.2  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  27.27 
 
 
483 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  27.27 
 
 
483 aa  92  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  27.5 
 
 
483 aa  92  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  28.15 
 
 
495 aa  91.7  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  27.27 
 
 
483 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  27.27 
 
 
483 aa  92  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  27.27 
 
 
483 aa  92  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  27.27 
 
 
483 aa  92  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  27.27 
 
 
483 aa  92  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  27.27 
 
 
483 aa  92  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  24.9 
 
 
500 aa  91.3  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  27.6 
 
 
484 aa  91.3  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  25 
 
 
527 aa  88.6  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0567  sodium/panthothenate symporter  27.09 
 
 
480 aa  88.2  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.868181  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2974  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.04 
 
 
478 aa  87.8  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  27.67 
 
 
491 aa  86.7  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  28.08 
 
 
485 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  27.7 
 
 
497 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1600  Na+/solute symporter  25.28 
 
 
473 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0101485  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  23.66 
 
 
510 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1229  sodium/proline symporter  27.75 
 
 
504 aa  84.7  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  27.59 
 
 
492 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  26.65 
 
 
492 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  26.65 
 
 
492 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1901  sodium/panthothenate symporter  27.67 
 
 
512 aa  81.6  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000150828 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  25.55 
 
 
518 aa  81.3  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  26.42 
 
 
492 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  26.42 
 
 
488 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  26.65 
 
 
492 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  26.45 
 
 
493 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  27.22 
 
 
498 aa  79.7  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  26.22 
 
 
494 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  26.45 
 
 
492 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1576  Sodium/proline symporter  27.67 
 
 
499 aa  79.7  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84214  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  24 
 
 
524 aa  79.7  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  27.08 
 
 
492 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  26.45 
 
 
487 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  26.45 
 
 
493 aa  79  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  26.45 
 
 
493 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  27.67 
 
 
499 aa  79  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2279  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.54 
 
 
504 aa  79  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.257788  hitchhiker  0.0000218485 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  26.45 
 
 
492 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  25.58 
 
 
483 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  26.45 
 
 
492 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  27.49 
 
 
492 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  25.35 
 
 
483 aa  77.8  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0494  SSS sodium solute transporter superfamily  27.06 
 
 
562 aa  77.8  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  28 
 
 
496 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  24.9 
 
 
492 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  26.08 
 
 
492 aa  77.4  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  25.88 
 
 
492 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  25.99 
 
 
492 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  22.4 
 
 
489 aa  77  0.0000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  26.05 
 
 
492 aa  77  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.05 
 
 
492 aa  77  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.47 
 
 
492 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  26.05 
 
 
492 aa  77  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  22.4 
 
 
489 aa  77  0.0000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  26.05 
 
 
492 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  26.05 
 
 
492 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  26.05 
 
 
492 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1113  SSS sodium solute transporter superfamily  23.8 
 
 
529 aa  76.6  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00736856  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04170  sodium/proline symporter  28.45 
 
 
499 aa  75.9  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0302673 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  23.04 
 
 
482 aa  75.9  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  26.03 
 
 
492 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1334  sodium/proline symporter  26.34 
 
 
499 aa  75.1  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  26.54 
 
 
452 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  24.27 
 
 
493 aa  75.9  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  26.24 
 
 
492 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>