185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0394 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  570  1.0000000000000001e-162  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.72 
 
 
294 aa  268  8e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  60.14 
 
 
294 aa  267  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  55.82 
 
 
294 aa  262  6e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  57.85 
 
 
290 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  55.36 
 
 
290 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  53.74 
 
 
288 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  52.8 
 
 
284 aa  241  7.999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  49.15 
 
 
296 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  50.55 
 
 
296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.92 
 
 
295 aa  232  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  53.99 
 
 
304 aa  232  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  52.85 
 
 
288 aa  231  8.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7612  hypothetical protein  54.23 
 
 
290 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.110479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0534  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.98 
 
 
288 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  48.29 
 
 
294 aa  225  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0507  hypothetical protein  56.7 
 
 
289 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402835  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  49.46 
 
 
300 aa  218  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.56 
 
 
296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  43.93 
 
 
307 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  43.93 
 
 
307 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1798  hypothetical protein  42.24 
 
 
314 aa  182  9.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3738  hypothetical protein  50 
 
 
303 aa  168  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4887  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.24 
 
 
283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0311  hypothetical protein  43.31 
 
 
314 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.012738  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0240  hypothetical protein  42.39 
 
 
280 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0343  hypothetical protein  41.06 
 
 
289 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.99772  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1560  hypothetical protein  45.9 
 
 
282 aa  129  7.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112464 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5668  hypothetical protein  37.97 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0186  hypothetical protein  33.33 
 
 
293 aa  89  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1646  hypothetical protein  31.7 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.866595  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.8 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000163961  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3219  hypothetical protein  42.86 
 
 
273 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.759716  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0872  hypothetical protein  29.48 
 
 
306 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 
310 aa  65.5  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  26.86 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  35 
 
 
319 aa  63.5  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.16 
 
 
293 aa  62  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.233434  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3856  hypothetical protein  24.58 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01431  predicted methyl viologen efflux pump  28.16 
 
 
274 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2184  hypothetical protein  28.16 
 
 
274 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.733406  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2084  hypothetical protein  28.16 
 
 
293 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  26.89 
 
 
302 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01443  hypothetical protein  28.16 
 
 
274 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1556  hypothetical protein  28.16 
 
 
293 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.137384  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1653  hypothetical protein  28.16 
 
 
293 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1701  hypothetical protein  28.16 
 
 
293 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138708  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1771  hypothetical protein  30.54 
 
 
307 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.860733 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1593  hypothetical protein  30.54 
 
 
307 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1897  hypothetical protein  23.53 
 
 
295 aa  60.5  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1686  hypothetical protein  30.54 
 
 
293 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.605003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1749  hypothetical protein  30.54 
 
 
307 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.880774  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1688  hypothetical protein  30.54 
 
 
293 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.68 
 
 
292 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  22.41 
 
 
294 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  22.41 
 
 
294 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1367  hypothetical protein  26.87 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1951  hypothetical protein  29.84 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0393459  normal  0.0245996 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3357  hypothetical protein  30.15 
 
 
295 aa  57  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000721544  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3969  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.4 
 
 
299 aa  56.6  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2045  hypothetical protein  24 
 
 
295 aa  56.2  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000341344  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1026  hypothetical protein  29.78 
 
 
295 aa  56.2  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.715879  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3485  hypothetical protein  30.15 
 
 
295 aa  55.8  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000551734  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  24.68 
 
 
305 aa  55.8  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0557  hypothetical protein  34.24 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  31.65 
 
 
289 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2056  hypothetical protein  26.14 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  21.3 
 
 
294 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  31.71 
 
 
341 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  21.3 
 
 
294 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  31.28 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2190  hypothetical protein  23.62 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  21.3 
 
 
294 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  25.19 
 
 
303 aa  53.5  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32 
 
 
292 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  30.48 
 
 
309 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  31.82 
 
 
302 aa  52.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  26.24 
 
 
302 aa  52.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3097  hypothetical protein  22.55 
 
 
295 aa  52.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27047  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  30.48 
 
 
309 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  29.18 
 
 
319 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  30.89 
 
 
301 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  25.41 
 
 
299 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  22.55 
 
 
294 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  24.43 
 
 
302 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001475  permease  22.68 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.310077  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1021  hypothetical protein  25.71 
 
 
277 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.83 
 
 
325 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  29.8 
 
 
330 aa  50.4  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2058  hypothetical protein  28.25 
 
 
303 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0938431  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  26.59 
 
 
297 aa  50.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  24.59 
 
 
299 aa  49.7  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.69 
 
 
311 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  29.18 
 
 
294 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  29.18 
 
 
294 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4623  hypothetical protein  25.12 
 
 
328 aa  49.3  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  31.02 
 
 
309 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  27.7 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  22.59 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05416  hypothetical protein  23.16 
 
 
300 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>