220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3467 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3443  K potassium transporter  47.98 
 
 
646 aa  668    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3467  K potassium transporter  100 
 
 
651 aa  1320    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0767221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4676  K potassium transporter  49.54 
 
 
648 aa  678    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3426  low affinity potassium transport system  49.54 
 
 
655 aa  657    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0884  K potassium transporter  46.06 
 
 
650 aa  635    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.011338 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6986  K potassium transporter  48.13 
 
 
661 aa  666    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.571387  hitchhiker  0.00000436362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0061  K potassium transporter  53.26 
 
 
655 aa  703    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.685026 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2974  K potassium transporter  49.84 
 
 
650 aa  642    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4780  K+ potassium transporter  48.77 
 
 
657 aa  633  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2024  K potassium transporter  48.08 
 
 
650 aa  608  9.999999999999999e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00348692  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1235  potassium transporter  44.1 
 
 
665 aa  585  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000105426  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1046  potassium transporter family protein  44.55 
 
 
657 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000334828  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0643  K+ transporter  41.73 
 
 
673 aa  516  1.0000000000000001e-145  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0152538  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0153  K+ transporter  39.38 
 
 
682 aa  484  1e-135  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000510146  unclonable  2.5551699999999998e-27 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1090  potassium uptake protein, putative  39.57 
 
 
666 aa  481  1e-134  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00180767  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0644  K+ transporter  39.44 
 
 
671 aa  471  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00948742  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1011  K+ transporter  38.82 
 
 
677 aa  471  1.0000000000000001e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0760728  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1015  K potassium transporter  38.5 
 
 
760 aa  465  9.999999999999999e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.020253  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1553  K+ transporter  37.2 
 
 
834 aa  465  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0403456  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1247  K+ potassium transporter  36.56 
 
 
877 aa  444  1e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801309 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1885  K potassium transporter  42.54 
 
 
622 aa  335  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.508127  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1857  K potassium transporter  39.21 
 
 
637 aa  333  7.000000000000001e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000427943  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1777  K+ potassium transporter  39.28 
 
 
637 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150032  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  39.33 
 
 
621 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3417  K potassium transporter  42.27 
 
 
634 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120836  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2018  Kup system potassium uptake protein  39.03 
 
 
643 aa  325  1e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1537  K potassium transporter  36.41 
 
 
637 aa  325  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  40.77 
 
 
626 aa  325  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  37.98 
 
 
630 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0976  potassium uptake protein, Kup system  37.33 
 
 
626 aa  323  4e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2547  K potassium transporter  40.04 
 
 
625 aa  321  3e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  39.16 
 
 
636 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1383  potassium uptake protein  35.19 
 
 
651 aa  318  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601106  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  35.29 
 
 
651 aa  318  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1372  K potassium transporter  35.5 
 
 
649 aa  317  4e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.560989  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2054  hypothetical protein  35.7 
 
 
624 aa  317  5e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2692  K+ potassium transporter  37.73 
 
 
634 aa  317  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0189185  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2064  hypothetical protein  35.6 
 
 
625 aa  316  7e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1339  potassium uptake protein  36.93 
 
 
651 aa  315  1.9999999999999998e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1232  K potassium transporter  37.83 
 
 
636 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  42.61 
 
 
647 aa  313  5.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  37.41 
 
 
647 aa  313  5.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3979  potassium transport protein Kup  41 
 
 
622 aa  313  5.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356267  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  35.83 
 
 
630 aa  313  6.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  35.47 
 
 
624 aa  312  1e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0308  K potassium transporter  36.83 
 
 
637 aa  312  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.938116  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1808  K+ potassium transporter  41.07 
 
 
661 aa  312  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223984  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  37.55 
 
 
620 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  37.59 
 
 
622 aa  311  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4117  potassium transport protein Kup  37.41 
 
 
622 aa  310  5.9999999999999995e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0495643 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  41.45 
 
 
633 aa  309  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  36.45 
 
 
631 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  37.05 
 
 
622 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  38.88 
 
 
631 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2446  hypothetical protein  35.6 
 
 
629 aa  308  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  39.49 
 
 
620 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2302  hypothetical protein  36.73 
 
 
629 aa  307  4.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0179  K potassium transporter  37.9 
 
 
637 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  38.01 
 
 
620 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  42.17 
 
 
627 aa  306  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  39.96 
 
 
656 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1621  potassium uptake transmembrane protein  38.73 
 
 
633 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  41.23 
 
 
633 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0985  K potassium transporter  41.61 
 
 
680 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3512  Kup family low affinity potassium transporter  36.13 
 
 
632 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4173  potassium transport protein Kup  37.32 
 
 
622 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1262  K potassium transporter  37.12 
 
 
643 aa  305  3.0000000000000004e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0285347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3454  Kup family low affinity potassium transporter  41.23 
 
 
611 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  36.35 
 
 
632 aa  304  4.0000000000000003e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03631  potassium transporter  37.32 
 
 
622 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4220  potassium uptake protein  37.32 
 
 
622 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3963  potassium transport protein Kup  37.32 
 
 
622 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1190  hypothetical protein  35.97 
 
 
624 aa  303  6.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4115  potassium transport protein Kup  37.32 
 
 
622 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.133962 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5183  potassium transport protein Kup  37.32 
 
 
622 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.594597 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4247  potassium transport protein Kup  37.32 
 
 
622 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4263  potassium transport protein Kup  37.32 
 
 
622 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.704108  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03575  hypothetical protein  37.32 
 
 
622 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  37.34 
 
 
631 aa  303  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4582  K+ potassium transporter  41.34 
 
 
622 aa  303  8.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4179  potassium transport protein Kup  35.78 
 
 
622 aa  303  9e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.418392  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  41.57 
 
 
622 aa  302  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  37.62 
 
 
620 aa  301  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  40.55 
 
 
622 aa  301  3e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2175  potassium uptake protein  36.92 
 
 
630 aa  301  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2213  potassium uptake protein  36.92 
 
 
630 aa  301  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  40.55 
 
 
622 aa  301  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2771  K potassium transporter  39.07 
 
 
637 aa  301  3e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2341  kup system potassium uptake protein  36.92 
 
 
660 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.357755  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01558  potassium uptake protein  35.92 
 
 
614 aa  300  5e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.509274  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1710  K potassium transporter  40.44 
 
 
637 aa  300  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00353606  normal  0.989137 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1643  K potassium transporter  39.06 
 
 
670 aa  300  5e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1341  K+ transporter  39.58 
 
 
454 aa  300  7e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4092  potassium transport protein Kup  37.68 
 
 
622 aa  300  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4272  potassium transport protein Kup  37.68 
 
 
622 aa  300  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.461844  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4163  potassium transport protein Kup  37.68 
 
 
622 aa  300  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.134372  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4213  potassium transport protein Kup  37.68 
 
 
622 aa  300  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.681675  normal  0.819116 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4107  potassium transport protein Kup  37.68 
 
 
622 aa  300  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382302  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2247  potassium uptake protein  36.85 
 
 
660 aa  300  8e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438776  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1331  potassium uptake protein  36.74 
 
 
630 aa  299  9e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00641911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>