More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2843 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2843  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 459 aa  948    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0145799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3177  AMP-dependent synthetase and ligase  49.01 
 
 		 471 aa  453  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.733678  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1979  AMP-dependent synthetase and ligase  42.44 
 
 		 830 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.10033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2025  AMP-dependent synthetase and ligase  42.44 
 
 		 830 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1959  AMP-dependent synthetase and ligase  42.15 
 
 		 830 aa  266  7e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2121  AMP-dependent synthetase and ligase  40.29 
 
 		 868 aa  262  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2621  AMP-dependent synthetase and ligase  40.78 
 
 		 453 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5341  AMP-dependent synthetase and ligase  43.18 
 
 		 915 aa  259  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2512  AMP-dependent synthetase and ligase  36.58 
 
 		 460 aa  256  5e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.280527  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5747  AMP-dependent synthetase and ligase  42.9 
 
 		 831 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2855  AMP-dependent synthetase and ligase  43.66 
 
 		 829 aa  249  7e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4142  AMP-dependent synthetase and ligase  43.69 
 
 		 860 aa  248  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  42.48 
 
 		 862 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0560008  normal  0.885424 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1889  AMP-dependent synthetase and ligase  40.12 
 
 		 860 aa  243  6e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0471823  normal  0.0591915 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0772  AMP-dependent synthetase and ligase  41.3 
 
 		 887 aa  242  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0989084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2019  AMP-dependent synthetase and ligase  40.52 
 
 		 841 aa  242  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00459182  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  40.69 
 
 		 889 aa  238  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.813754 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1742  AMP-dependent synthetase and ligase  35.78 
 
 		 497 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3111  AMP-dependent synthetase and ligase  34.16 
 
 		 418 aa  179  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0188419 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1082  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 		 526 aa  164  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  32.38 
 
 		 517 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3179  AMP-dependent synthetase and ligase  31.93 
 
 		 520 aa  163  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 		 490 aa  160  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2785  AMP-dependent synthetase and ligase  31.85 
 
 		 534 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 		 520 aa  158  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2866  AMP-dependent synthetase and ligase  30.49 
 
 		 523 aa  156  9e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2958  AMP-dependent synthetase and ligase  32.56 
 
 		 523 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1249  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 		 530 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0267  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.33 
 
 		 492 aa  127  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.250834 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5320  AMP-dependent synthetase and ligase  29.05 
 
 		 521 aa  126  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1564  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 		 529 aa  124  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1292  AMP-dependent synthetase and ligase  29.18 
 
 		 523 aa  119  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28 
 
 		 514 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2020  AMP-dependent synthetase and ligase  28.49 
 
 		 523 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.256098 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1956  AMP-dependent synthetase and ligase  30.87 
 
 		 538 aa  117  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.536259  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2670  AMP-dependent synthetase and ligase  30.6 
 
 		 531 aa  117  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  27.7 
 
 		 512 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7014  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  27.76 
 
 		 529 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188129 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.57 
 
 		 510 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.08 
 
 		 512 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0125  AMP-dependent synthetase and ligase  29.28 
 
 		 533 aa  114  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2338  AMP-dependent synthetase and ligase  28.84 
 
 		 509 aa  112  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  31.38 
 
 		 812 aa  113  9e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  29.86 
 
 		 505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531462  normal  0.0257473 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4273  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  27.65 
 
 		 536 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000408842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  27.17 
 
 		 499 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7423  AMP-dependent synthetase and ligase  29.33 
 
 		 524 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  26.68 
 
 		 553 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1393  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  30.57 
 
 		 530 aa  111  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0696312  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  27.97 
 
 		 515 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  28.49 
 
 		 522 aa  110  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2529  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  30.33 
 
 		 532 aa  110  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437982 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6138  AMP-dependent synthetase and ligase  28.49 
 
 		 524 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623044  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  28.45 
 
 		 492 aa  109  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3059  AMP-dependent synthetase and ligase  28.37 
 
 		 491 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000983491 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0707  AMP-binding domain-containing protein  27.01 
 
 		 522 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28 
 
 		 510 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  28.84 
 
 		 553 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  27.48 
 
 		 508 aa  108  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0523  AMP-binding domain-containing protein  27.59 
 
 		 522 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28 
 
 		 510 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0096  AMP-dependent synthetase and ligase  27.04 
 
 		 527 aa  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0541  AMP-binding domain-containing protein  27.32 
 
 		 522 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  26.15 
 
 		 513 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3426  AMP-dependent synthetase and ligase  29.01 
 
 		 505 aa  107  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.872115 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0699  AMP-dependent synthetase and ligase  29.26 
 
 		 545 aa  106  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  25.68 
 
 		 843 aa  106  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3735  AMP-dependent synthetase and ligase  29.01 
 
 		 505 aa  106  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.71 
 
 		 510 aa  106  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.71 
 
 		 510 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.71 
 
 		 510 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.71 
 
 		 510 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.71 
 
 		 510 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.71 
 
 		 510 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2202  AMP-dependent synthetase and ligase  27.27 
 
 		 525 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  28.53 
 
 		 511 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  28.21 
 
 		 503 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.24 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  27.17 
 
 		 526 aa  104  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6505  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  28.49 
 
 		 527 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679628 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.71 
 
 		 510 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0049  AMP-dependent synthetase and ligase  28.21 
 
 		 510 aa  104  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.541922  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  28.12 
 
 		 532 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  27.75 
 
 		 487 aa  103  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3158  AMP-binding domain-containing protein  26.78 
 
 		 522 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  28.77 
 
 		 509 aa  103  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5649  AMP-dependent synthetase and ligase  28.49 
 
 		 531 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0472962  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1460  AMP-binding domain-containing protein  26.78 
 
 		 522 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6014  AMP-dependent synthetase and ligase  28.49 
 
 		 531 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.010036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2888  AMP-binding domain-containing protein  26.78 
 
 		 522 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0128  AMP-binding domain-containing protein  26.78 
 
 		 522 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  25.46 
 
 		 554 aa  103  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3884  AMP-dependent synthetase and ligase  27.67 
 
 		 497 aa  103  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.445629  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0705  AMP-binding domain-containing protein  27.37 
 
 		 535 aa  103  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1574  AMP-binding domain-containing protein  27.37 
 
 		 535 aa  103  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.575944  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2026  AMP-binding domain-containing protein  27.37 
 
 		 535 aa  103  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2124  AMP-binding domain-containing protein  27.37 
 
 		 535 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0616  AMP-binding domain-containing protein  27.37 
 
 		 608 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117672  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0111  AMP-dependent synthetase and ligase  27.32 
 
 		 526 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.471366  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  28.84 
 
 		 496 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>