132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1862 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1862  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 355 aa  737    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2121  SAM-dependent methyltransferase  51.69 
 
 		 356 aa  404  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.212274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1680  O-methyltransferase, putative  50 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.275559  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1718  O-methyltransferase, putative  50 
 
 		 357 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000763077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2873  O-methyltransferase family protein  48.03 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2107  putative O-methyltransferase  49.72 
 
 		 379 aa  375  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1560  methyltransferase type 12  47.75 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1499  methyltransferase type 12  47.47 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00534816 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1566  methyltransferase type 12  47.75 
 
 		 357 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2128  O-methyltransferase, putative  48.03 
 
 		 359 aa  368  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2686  O-methyltransferase family protein  48.03 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0445752  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2765  O-methyltransferase family protein  48.31 
 
 		 363 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.974745  hitchhiker  0.00708299 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1698  O-methyltransferase family 2  48.03 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000510936 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2905  O-methyltransferase, putative  46.63 
 
 		 357 aa  363  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5794  Methyltransferase type 12  48.43 
 
 		 352 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4566  O-methyltransferase family 2  47.44 
 
 		 355 aa  360  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2371  O-methyltransferase family protein  47.03 
 
 		 359 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4796  O-methyltransferase, family 2  46.59 
 
 		 352 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0717  O-methyltransferase family 2  47.44 
 
 		 365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004060  SAM-dependent methyltransferase  46.51 
 
 		 355 aa  355  5.999999999999999e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3883  O-methyltransferase family protein  45.17 
 
 		 354 aa  351  8.999999999999999e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.181684 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2384  O-methyltransferase family protein  46.63 
 
 		 355 aa  348  7e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401072 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1505  O-methyltransferase, putative  45.98 
 
 		 359 aa  333  2e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.538539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2096  Methyltransferase type 12  43.68 
 
 		 357 aa  327  3e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  27.01 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  30.33 
 
 		 333 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  29.41 
 
 		 334 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4003  O-methyltransferase, family 2  29.29 
 
 		 380 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.414327  decreased coverage  0.000643794 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1908  O-methyltransferase family protein  28.66 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0280821  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2038  O-methyltransferase family protein  25.84 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.309417  normal  0.146139 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0264  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  30.34 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  27.15 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  22.57 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1725  O-methyltransferase family 2  23.57 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  24.01 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6439  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  31.25 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  30.25 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3121  O-methyltransferase family protein  23.53 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2050  O-methyltransferase family 2  31.65 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141136 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2966  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  37.04 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.678001  normal  0.0331478 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0204  O-methyltransferase family protein  23.68 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  23.32 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4077  O-methyltransferase family 2  21.38 
 
 		 356 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0325026  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4955  O-methyltransferase family protein  29.13 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  25.6 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0616  O-methyltransferase family protein  25.77 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3758  O-methyltransferase family protein  25 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542752 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2850  O-methyltransferase family 2  26.75 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.387298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2402  methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 350 aa  57  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  26.25 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2963  O-methyltransferase family 2  30 
 
 		 338 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.193819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2815  O-methyltransferase family protein  25 
 
 		 341 aa  54.7  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.330603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2661  O-methyltransferase family protein  22.46 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1708  O-methyltransferase family 2  23.86 
 
 		 373 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1917  hypothetical protein  27.56 
 
 		 630 aa  53.1  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0181  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  23.01 
 
 		 378 aa  53.1  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  27.87 
 
 		 343 aa  53.1  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1486  O-methyltransferase family protein  23.03 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1906  hypothetical protein  27.56 
 
 		 630 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1178  O-methyltransferase family protein  24.86 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1147  O-methyltransferase family 2  24.34 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2119  O-methyltransferase family protein  23.03 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930505  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0802  O-methyltransferase  23.03 
 
 		 367 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4154  O-methyltransferase family protein  27.93 
 
 		 332 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1815  O-methyltransferase family protein  23.6 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0486  O-methyltransferase  23.6 
 
 		 473 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300285  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0388  O-methyltransferase  23.6 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826087  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  20.8 
 
 		 356 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2361  Methyltransferase type 12  26.36 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09490  putative phenazine-specific methyltransferase  24.64 
 
 		 334 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 286 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0115  CrtF-related protein  30.56 
 
 		 338 aa  50.4  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6962  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.67 
 
 		 336 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797096  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0030  methyltransferase type 12  23.08 
 
 		 368 aa  50.1  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1720  O-methyltransferase family protein  26.81 
 
 		 364 aa  49.7  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.365884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3940  O-methyltransferase family protein  28.97 
 
 		 375 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7639  O-methyltransferase family 2  25.4 
 
 		 359 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2758  C-20 methyltransferase BchU  27.1 
 
 		 339 aa  49.7  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.160488  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1291  O-methyltransferase family protein  24.68 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.419968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2907  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.67 
 
 		 259 aa  49.3  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0889  putative phenazine-specific methyltransferase  25.29 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1149  O-methyltransferase family 2  27.34 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  26.94 
 
 		 399 aa  47.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1418  Methyltransferase type 12  28.97 
 
 		 328 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.12101  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2714  O-methyltransferase family protein  24.49 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0330772  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2087  hypothetical protein  27.93 
 
 		 373 aa  47.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2839  methyltransferase type 12  25 
 
 		 256 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323425  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1211  C-20 methyltransferase BchU  28.3 
 
 		 354 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.40685  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2512  C-20 methyltransferase BchU  20.64 
 
 		 339 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.669224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4382  O-methyltransferase family 2  24.68 
 
 		 330 aa  47.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2098  hypothetical protein  27.93 
 
 		 373 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1315  O-methyltransferase family protein  29.2 
 
 		 341 aa  47  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.575705  normal  0.038188 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1064  O-methyltransferase family 2  21.69 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0855  O-methyltransferase family protein  22.86 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2956  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  19.57 
 
 		 384 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.934016  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3515  hydroxyneurosporene methyltransferase  29.09 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.758284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6986  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.71 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397091  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2253  C-20 methyltransferase BchU  22.43 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1816  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  23.27 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2124  O-methyltransferase family protein  25 
 
 		 371 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>