More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3831 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3831  gluconate transporter  100 
 
 		 474 aa  917    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0228851  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  47.9 
 
 		 448 aa  399  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  43.78 
 
 		 446 aa  360  2e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  41.43 
 
 		 447 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  41.43 
 
 		 447 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  41.43 
 
 		 447 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  41.46 
 
 		 447 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  38 
 
 		 477 aa  301  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001958  low-affinity gluconate/H+ symporter GntU  40.35 
 
 		 458 aa  298  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0665  gluconate permease  40.46 
 
 		 458 aa  296  6e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.843783  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00514  permease  39.82 
 
 		 458 aa  296  8e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2267  gluconate transporter  38.9 
 
 		 461 aa  295  9e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  38.79 
 
 		 461 aa  295  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  37.69 
 
 		 464 aa  294  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  38.08 
 
 		 459 aa  293  5e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2664  putative gluconate permease  40.83 
 
 		 458 aa  292  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.909443  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0378  gluconate permease  38.57 
 
 		 444 aa  290  3e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00016138  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  37.76 
 
 		 449 aa  289  7e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  37.93 
 
 		 464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4498  gluconate transporter  36.07 
 
 		 445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  38.94 
 
 		 458 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4787  gluconate transporter  37.94 
 
 		 465 aa  282  9e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5329  gluconate transporter  37.03 
 
 		 477 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5418  gluconate transporter  37.03 
 
 		 477 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5708  gluconate transporter  36.81 
 
 		 477 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24190  gluconate transporter  35.91 
 
 		 460 aa  275  9e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.456069  normal  0.0307448 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3910  low affinity gluconate transporter  34.99 
 
 		 446 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.706016 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3741  low affinity gluconate transporter  34.99 
 
 		 446 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3730  low affinity gluconate transporter  34.99 
 
 		 446 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.811939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  33.48 
 
 		 438 aa  274  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3808  low affinity gluconate transporter  34.99 
 
 		 446 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  33.48 
 
 		 438 aa  274  3e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  36.79 
 
 		 449 aa  274  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  33.48 
 
 		 438 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  36.64 
 
 		 449 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5912  gluconate transporter  36.76 
 
 		 474 aa  273  7e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0993393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  34.25 
 
 		 450 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  32.35 
 
 		 438 aa  271  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  36.56 
 
 		 449 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  36.56 
 
 		 449 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3850  low affinity gluconate transporter  34.76 
 
 		 446 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3844  low affinity gluconate transporter  35.21 
 
 		 446 aa  271  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.567934 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  36.32 
 
 		 449 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  32.13 
 
 		 438 aa  269  7e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3942  gluconate transporter  39.74 
 
 		 458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  35.96 
 
 		 453 aa  267  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04131  L-idonate and D-gluconate transporter  33.33 
 
 		 439 aa  266  5e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04095  hypothetical protein  33.33 
 
 		 439 aa  266  5e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4746  Gnt-II system L-idonate transporter  33.33 
 
 		 439 aa  266  5e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.618535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0223  gluconate transporter  33.03 
 
 		 439 aa  266  5e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  35.23 
 
 		 453 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  35.23 
 
 		 453 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  35.23 
 
 		 453 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3732  gluconate transporter  33.33 
 
 		 439 aa  266  7e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4521  Gnt-II system L-idonate transporter  33.33 
 
 		 439 aa  266  7e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00247449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  35.73 
 
 		 453 aa  266  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2931  gluconate transporter  39.16 
 
 		 458 aa  265  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3529  gluconate transporter  37.36 
 
 		 467 aa  263  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3977  gluconate transporter  35.29 
 
 		 457 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.485519 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03287  gluconate transporter, low affinity GNT 1 system  35.21 
 
 		 446 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.805381  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0279  gluconate transporter  35.21 
 
 		 446 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0277  low affinity gluconate transporter  35.21 
 
 		 446 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  36 
 
 		 453 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3635  low affinity gluconate transporter  35.21 
 
 		 446 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03240  hypothetical protein  35.21 
 
 		 446 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3719  low affinity gluconate transporter  35.21 
 
 		 446 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3914  low affinity gluconate transporter  35.21 
 
 		 446 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4752  low affinity gluconate transporter  35.21 
 
 		 446 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.920357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0360  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  35.01 
 
 		 453 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3438  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  35.01 
 
 		 453 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2629  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  35.01 
 
 		 453 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00621588  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3440  GntP family high-affinity gluconate permease  35.01 
 
 		 453 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3404  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  35.01 
 
 		 453 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2444  gluconate permease, putative  35.18 
 
 		 446 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1136  gluconate transporter  36.24 
 
 		 467 aa  262  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120866 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1218  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  35.18 
 
 		 446 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0503  gluconate transporter  36.67 
 
 		 476 aa  262  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2721  gluconate transporter  35.23 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  35.01 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  34.79 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3889  low affinity gluconate transporter  34.99 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4867  gluconate:H+ symporter family protein  33.11 
 
 		 463 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.147551 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4830  gluconate:H+ symporter (hypothetical protein) family transporter  33.11 
 
 		 463 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.742324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3027  gluconate transporter  35.11 
 
 		 450 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4886  gluconate:H+ symporter family transporter  33.11 
 
 		 439 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4767  transporter, gluconate:H+ symporter (GntP) family  33.11 
 
 		 439 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0776084  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  33.64 
 
 		 452 aa  259  6e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  34.67 
 
 		 450 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4737  transporter gluconate:H+ symporter (GntP) family  33.11 
 
 		 439 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.137331 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4651  gluconate transporter  31.63 
 
 		 438 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0583  gluconate transporter  35.01 
 
 		 453 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32757  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0557  gluconate transporter  35.01 
 
 		 453 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.736742  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  34.44 
 
 		 450 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  34.44 
 
 		 450 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26850  gluconate transporter  34 
 
 		 459 aa  256  5e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3711  high-affinity gluconate transporter  32.58 
 
 		 438 aa  256  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3882  high-affinity gluconate transporter  32.58 
 
 		 438 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3714  high-affinity gluconate transporter  32.58 
 
 		 438 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07730  gluconate transporter  36.68 
 
 		 461 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.619912  normal  0.0357152 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4722  high-affinity gluconate transporter  32.12 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>