More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2011 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2011  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 328 aa  642    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2491  inner-membrane translocator  49.53 
 
 		 405 aa  293  3e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  41.9 
 
 		 341 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.82 
 
 		 345 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  41.14 
 
 		 345 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  41.46 
 
 		 345 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  41.14 
 
 		 345 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  41.14 
 
 		 345 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  40.82 
 
 		 345 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  42.01 
 
 		 339 aa  228  9e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  42.14 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  41.61 
 
 		 347 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  40.19 
 
 		 333 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  43 
 
 		 328 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  43.4 
 
 		 342 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1349  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  41.77 
 
 		 341 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5596  monosaccharide-transporting ATPase  42.09 
 
 		 341 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.496226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  37.39 
 
 		 345 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  37.06 
 
 		 311 aa  185  8e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  38.44 
 
 		 343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0872  Monosaccharide-transporting ATPase  39.5 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  33.12 
 
 		 359 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5134  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  38.6 
 
 		 349 aa  182  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.180892  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  39.1 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  39.57 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  36.89 
 
 		 315 aa  179  7e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  37.38 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5472  Monosaccharide-transporting ATPase  38.07 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.614199  normal  0.795246 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  36.48 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 320 aa  177  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  35.35 
 
 		 333 aa  176  4e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1253  monosaccharide-transporting ATPase  37.16 
 
 		 349 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  35.17 
 
 		 327 aa  175  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1227  inner-membrane translocator  37.16 
 
 		 349 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6314  monosaccharide-transporting ATPase  38.87 
 
 		 343 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.359966 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  34.05 
 
 		 354 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  36.01 
 
 		 348 aa  172  6.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 324 aa  172  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6473  inner-membrane translocator  38.56 
 
 		 343 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6708  inner-membrane translocator  38.56 
 
 		 343 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46964  normal  0.292611 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  39.32 
 
 		 322 aa  172  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  35.38 
 
 		 324 aa  172  7.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  36.74 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  34.95 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  35.05 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  35.05 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  35.05 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  35.37 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  35.05 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  35.26 
 
 		 315 aa  169  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  37.26 
 
 		 321 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  35.37 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  35.37 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  35.05 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  35.46 
 
 		 317 aa  169  6e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  35.05 
 
 		 311 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  35.05 
 
 		 311 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  34.73 
 
 		 311 aa  169  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  35.29 
 
 		 327 aa  169  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  34.2 
 
 		 320 aa  169  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  34.63 
 
 		 331 aa  168  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  35.29 
 
 		 327 aa  169  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  37.79 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  34.9 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  36.16 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  35.6 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  35.95 
 
 		 310 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  35.48 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  35.48 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  36.81 
 
 		 341 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  35.48 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  35.48 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  35.48 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  34.95 
 
 		 322 aa  166  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  35.48 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  35.48 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  35.48 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  35.06 
 
 		 310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02651  Ribose transport system permease protein rbsC  40.88 
 
 		 327 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  37.79 
 
 		 310 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  35.48 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  35.48 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  35.15 
 
 		 323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  35.48 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  34.74 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  35.48 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  35.48 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  35.58 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  35.48 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  34.47 
 
 		 346 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 355 aa  163  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  35.64 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0155  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 324 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  33 
 
 		 314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  33.87 
 
 		 330 aa  162  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  33.87 
 
 		 330 aa  162  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>