205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0600 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0600  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 362 aa  751    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4054  oxidoreductase domain protein  61.45 
 
 		 357 aa  462  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1594  oxidoreductase domain protein  55.87 
 
 		 359 aa  424  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1988  oxidoreductase domain-containing protein  55.93 
 
 		 391 aa  412  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0347113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0585  Oxidoreductase domain  51.69 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1648  oxidoreductase domain protein  51.97 
 
 		 360 aa  378  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01560  predicted dehydrogenase  49.44 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2507  oxidoreductase domain protein  47.13 
 
 		 335 aa  330  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.762014  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2165  oxidoreductase domain protein  46.71 
 
 		 335 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.97582  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0267  oxidoreductase domain protein  41.01 
 
 		 387 aa  288  7e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2442  oxidoreductase domain-containing protein  42.56 
 
 		 342 aa  278  9e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0049  oxidoreductase domain protein  39.88 
 
 		 391 aa  277  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0595236  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4491  oxidoreductase-like  41.49 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5583  oxidoreductase  39.88 
 
 		 342 aa  268  8.999999999999999e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6513  oxidoreductase domain protein  41.79 
 
 		 336 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6100  oxidoreductase domain protein  40.9 
 
 		 336 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207397  normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3326  oxidoreductase domain-containing protein  39.04 
 
 		 338 aa  249  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4492  oxidoreductase-like  35.14 
 
 		 342 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3349  oxidoreductase domain protein  23.08 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.773836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2078  oxidoreductase domain protein  23.86 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1283  oxidoreductase domain protein  22.87 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0628466  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0495  oxidoreductase domain-containing protein  22.68 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0650214  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0519  oxidoreductase domain-containing protein  22.68 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00249264  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  24.47 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  24.8 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  24.74 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  25.66 
 
 		 315 aa  57  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1916  oxidoreductase domain protein  23.39 
 
 		 335 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0311153  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0189  putative oxidoreductase  22.28 
 
 		 366 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.329829  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08211  putative oxidoreductase  22.28 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.839284 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2322  oxidoreductase domain-containing protein  28.33 
 
 		 320 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  20.2 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  26.98 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.29 
 
 		 350 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  23.66 
 
 		 347 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2113  oxidoreductase domain protein  23.7 
 
 		 344 aa  55.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  20.81 
 
 		 347 aa  53.9  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  21.98 
 
 		 397 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  21 
 
 		 391 aa  53.1  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3001  oxidoreductase domain-containing protein  25.15 
 
 		 349 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.133367 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  26.05 
 
 		 345 aa  52.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  21.6 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  25 
 
 		 326 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  25.17 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  26.79 
 
 		 344 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  25.74 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  24.55 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  23.72 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  21.66 
 
 		 389 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  22.15 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  22.78 
 
 		 349 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  20.88 
 
 		 370 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  23.31 
 
 		 346 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  23.31 
 
 		 346 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  23.31 
 
 		 346 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  20.14 
 
 		 370 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0785  oxidoreductase domain-containing protein  25.84 
 
 		 345 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  23.67 
 
 		 346 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  25.43 
 
 		 349 aa  50.4  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  23.31 
 
 		 346 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  26.71 
 
 		 361 aa  50.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0125  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.53 
 
 		 350 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4759  oxidoreductase domain protein  25.95 
 
 		 381 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.0244054 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3994  oxidoreductase YdgJ  23.53 
 
 		 350 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  22.26 
 
 		 363 aa  50.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  23.31 
 
 		 346 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  23.28 
 
 		 349 aa  50.1  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0541  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 		 354 aa  50.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4431  oxidoreductase domain-containing protein  25.43 
 
 		 334 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 		 377 aa  49.7  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  21.19 
 
 		 362 aa  49.7  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  24.06 
 
 		 374 aa  49.3  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  24.37 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  21.69 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  24.68 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  23.24 
 
 		 373 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0322  oxidoreductase domain protein  24.69 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  22.49 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  22.49 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  24.31 
 
 		 344 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  25.29 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  24.1 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1238  oxidoreductase domain protein  26.28 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  22.49 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  26.82 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  20.09 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  22.49 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  22.49 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  24.1 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  22.49 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  23.53 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2998  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.28 
 
 		 350 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  21.36 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1539  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.28 
 
 		 350 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  20.94 
 
 		 357 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  23.6 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  21.93 
 
 		 356 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  22.49 
 
 		 359 aa  47.8  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  20.3 
 
 		 334 aa  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3319  oxidoreductase domain-containing protein  28.07 
 
 		 361 aa  47.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>