87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1679 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1679  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  724    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489043 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3733  hypothetical protein  34.41 
 
 		 348 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0568  DNA replication and repair protein RecF  31.53 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3188  putative ATP-binding protein  30.75 
 
 		 344 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.636765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1140  putative ATP-binding protein  34.75 
 
 		 349 aa  169  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2637  putative ATP-binding protein  34.23 
 
 		 353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592528  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0648  AAA ATPase  30.03 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0666  DNA replication and repair protein RecF  33.05 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0186794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2687  putative ATP-binding protein  32.03 
 
 		 355 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.815306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5454  ATP-binding protein  30.54 
 
 		 356 aa  125  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.696652  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4282  hypothetical protein  32.2 
 
 		 355 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.551761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0350  putative ATP-binding protein  26.61 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  normal  0.712412 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2233  hypothetical protein  28.95 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  27.74 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2195  cell division ATP-binding protein FtsE  41.3 
 
 		 232 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.204033  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3089  cell division ATP-binding protein FtsE  39.13 
 
 		 237 aa  47  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.29144  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  32.1 
 
 		 249 aa  47  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2863  cell division ATP-binding protein FtsE  39.13 
 
 		 253 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2983  cell division ATP-binding protein FtsE  39.13 
 
 		 237 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0984  cell division ATP-binding protein FtsE  43.48 
 
 		 236 aa  46.6  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3138  ABC transporter related  35 
 
 		 253 aa  46.6  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.709242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1132  hypothetical protein  51.02 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0249333  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1650  ABC transporter related protein  44.19 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0762596  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1154  cell division ATP-binding protein FtsE  39.13 
 
 		 231 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.386083  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  42.55 
 
 		 371 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0003  recombination protein F  36.36 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000843052  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  31.11 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  42.55 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1205  ABC transporter related protein  32.61 
 
 		 251 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00143482  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4431  FHA domain-containing protein  30.1 
 
 		 796 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31021  Protein involved in recombination repair  46 
 
 		 1063 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.109982 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  46.94 
 
 		 579 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  23.17 
 
 		 349 aa  45.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0005  DNA replication and repair protein RecF  44.83 
 
 		 402 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.478589  hitchhiker  0.000458598 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0640  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  26.38 
 
 		 601 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  46.94 
 
 		 579 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1325  DNA repair protein RecN  48.78 
 
 		 529 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11608  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1393  hypothetical protein  26.47 
 
 		 213 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.197951 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0022  cell division ATP-binding protein FtsE  39.13 
 
 		 235 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.640793  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09773  putative DNA replication and repair protein  29.41 
 
 		 359 aa  44.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.753312  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2660  cell division ATP-binding protein FtsE  23.93 
 
 		 224 aa  44.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8795  hitchhiker  0.0000942029 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3716  DNA replication and repair protein RecF  44.68 
 
 		 359 aa  44.7  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.362635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3330  ABC transporter related  52.5 
 
 		 231 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.237178  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  38.98 
 
 		 371 aa  43.9  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  29.01 
 
 		 866 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  29.01 
 
 		 866 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  38.71 
 
 		 373 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1997  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  41.3 
 
 		 219 aa  43.5  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2531  cell-division ATP-binding protein  40 
 
 		 221 aa  43.9  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2518  cell division ATP-binding protein FtsE  36.96 
 
 		 220 aa  43.5  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1923  cell division ATP-binding protein FtsE  41.3 
 
 		 219 aa  43.5  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2596  DNA repair protein RecN  46.34 
 
 		 537 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0003  DNA replication and repair protein RecF  45.9 
 
 		 404 aa  43.5  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00736355  unclonable  0.00000172391 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  48.78 
 
 		 572 aa  43.5  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  29.01 
 
 		 866 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1176  cell division ABC transpoter ATP-binding protein  41.67 
 
 		 219 aa  43.9  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  38.71 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  38.71 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  38.71 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  38.71 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2096  DNA repair protein RecN  46.34 
 
 		 523 aa  43.5  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4027  cell division ATP-binding protein  39.13 
 
 		 207 aa  43.1  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  38.71 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2781  ABC transporter related  29.73 
 
 		 256 aa  43.5  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1216  SMC domain protein  46.34 
 
 		 531 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  38.71 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  38.71 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  38.98 
 
 		 370 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  38.71 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  38.71 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  38.98 
 
 		 370 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  39.62 
 
 		 241 aa  43.1  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00170  putative ATP-binding protein involved in cell division  40.48 
 
 		 229 aa  43.1  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  30 
 
 		 241 aa  43.1  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  38.71 
 
 		 375 aa  43.1  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5508  DNA replication and repair protein RecF  34.48 
 
 		 368 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  30.25 
 
 		 402 aa  43.1  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0021  SMC domain protein  43.9 
 
 		 533 aa  43.1  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1913  peptide ABC transporter ATPase  36.62 
 
 		 259 aa  43.1  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.334881  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2290  hypothetical protein  29.52 
 
 		 409 aa  43.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  34.62 
 
 		 374 aa  42.7  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0362  cell division ATP-binding protein FtsE  36.96 
 
 		 220 aa  43.1  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  39.66 
 
 		 374 aa  43.1  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  24.82 
 
 		 670 aa  42.7  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2848  SMC domain protein  43.9 
 
 		 533 aa  42.7  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2374  cell division ATP-binding protein FtsE  41.51 
 
 		 285 aa  42.7  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.195215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3865  cell division ATP-binding protein FtsE  39.13 
 
 		 219 aa  42.7  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.120389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>