147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0208 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0208  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 333 aa  687    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.819308  hitchhiker  0.00109807 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0199  Radical SAM domain protein  85.59 
 
 		 333 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1451  hypothetical protein  75.83 
 
 		 335 aa  543  1e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000857119  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1913  hypothetical protein  64.35 
 
 		 334 aa  462  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.971358  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3188  radical SAM domain-containing protein  61.4 
 
 		 329 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1926  Radical SAM domain protein  44.34 
 
 		 334 aa  293  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1526  hypothetical protein  60.24 
 
 		 84 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  28.62 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  26.77 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3189  biotin synthase  25.67 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000310414  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  24.26 
 
 		 326 aa  62.4  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0535  biotin synthase  24.74 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.464062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  25.84 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  25.65 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  24.07 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  24.44 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  26.41 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  26.79 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1104  biotin synthase  23.47 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  26.61 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1571  biotin synthase  27.7 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598658  normal  0.287862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  24.16 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11991  biotin synthase  22.64 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.496147  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2292  biotin synthase  25.26 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  23.83 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11841  biotin synthase  23.46 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  23.44 
 
 		 331 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  26.64 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12001  biotin synthase  23.26 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.678797  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0156  biotin synthase  25.19 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3644  biotin synthase  24.79 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  23.49 
 
 		 322 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3073  biotin synthase  27.07 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  23.53 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3133  biotin synthase  27.07 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30955  Biotin synthase  24.29 
 
 		 361 aa  53.9  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0547155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3090  biotin synthase  27.07 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  23.49 
 
 		 336 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0963  biotin synthase  24.79 
 
 		 326 aa  53.1  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.032686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  23.49 
 
 		 339 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  23.49 
 
 		 339 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  23.49 
 
 		 336 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  23.49 
 
 		 339 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  24.72 
 
 		 349 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  26.28 
 
 		 352 aa  53.1  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  23.49 
 
 		 339 aa  52.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  25.42 
 
 		 339 aa  52.8  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 		 360 aa  52.8  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0430  biotin synthase  24.62 
 
 		 346 aa  52.8  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2518  biotin synthase  25.88 
 
 		 354 aa  52.8  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0492  biotin synthase  24.62 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  24.15 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5738  biotin synthase  25.57 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0657  biotin synthase  23.95 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  29.8 
 
 		 319 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  23.16 
 
 		 335 aa  51.2  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  24.82 
 
 		 346 aa  50.8  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  23.79 
 
 		 354 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1839  biotin synthase  22 
 
 		 353 aa  50.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0814889  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  25.98 
 
 		 334 aa  50.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0371  biotin synthase  24.51 
 
 		 339 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.478786  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  22.43 
 
 		 360 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0612  biotin synthase  25 
 
 		 333 aa  49.7  0.00007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0271  Radical SAM domain protein  24.16 
 
 		 347 aa  49.7  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.195415  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4622  biotin synthase  22.18 
 
 		 332 aa  49.7  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2776  biotin synthetase  24.84 
 
 		 350 aa  49.7  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02874  biotin synthase  24.48 
 
 		 344 aa  49.3  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1428  biotin synthase  22.92 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1556  biotin synthase  23.68 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0875  biotin synthase  23.97 
 
 		 356 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  25.87 
 
 		 331 aa  48.5  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0801  biotin synthase  22.22 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0149  biotin synthase  24.19 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.464836 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  23.48 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2070  biotin synthase  24.62 
 
 		 340 aa  47.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2320  biotin synthase  23.74 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0133468  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2934  biotin synthase  23.74 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  22.55 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  21.77 
 
 		 334 aa  47.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  24.68 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2949  biotin synthase  23.74 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.992954 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16510  iron-only hydrogenase maturation protein HydE  24.23 
 
 		 351 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  23.1 
 
 		 375 aa  47.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0352  biotin synthase  27.78 
 
 		 326 aa  47.8  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.643225  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  25.75 
 
 		 361 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2045  biotin synthase  25.7 
 
 		 350 aa  47.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0111965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  22.19 
 
 		 368 aa  47.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3396  biotin synthase  24.83 
 
 		 336 aa  47  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.739802 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  22.36 
 
 		 328 aa  47.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1855  biotin synthase  25.7 
 
 		 350 aa  47  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0719  biotin synthase  24.25 
 
 		 356 aa  47  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1786  biotin synthase  24.48 
 
 		 330 aa  47  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.904329 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1433  biotin synthase  24.08 
 
 		 324 aa  46.6  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46799  predicted protein  26.98 
 
 		 311 aa  46.6  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.970391 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2846  biotin synthase  23.74 
 
 		 339 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.699161  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3779  biotin synthase  24.67 
 
 		 353 aa  46.2  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195072  normal  0.526732 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  22.7 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  22.81 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  24.42 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  25.19 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>