More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1144 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1144  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 158 aa  322  1e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0400  30S ribosomal protein S7  86.08 
 
 		 158 aa  294  4e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05700  30S ribosomal protein S7  87.97 
 
 		 158 aa  292  1e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0596  30S ribosomal protein S7  67.09 
 
 		 155 aa  229  8.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.370718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3165  30S ribosomal protein S7  67.09 
 
 		 155 aa  228  4e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.987301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1607  ribosomal protein S7  68.99 
 
 		 155 aa  225  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.398796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4448  ribosomal protein S7  65.82 
 
 		 155 aa  222  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4340  30S ribosomal protein S7  65.19 
 
 		 155 aa  221  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.435501 
 
 
-
 
NC_002950  PG1941  30S ribosomal protein S7  62.66 
 
 		 158 aa  211  2.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0126  30S ribosomal protein S7  59.49 
 
 		 155 aa  201  4e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  53.8 
 
 		 155 aa  189  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  54.78 
 
 		 156 aa  189  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  187  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  187  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 157 aa  187  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1659  30S ribosomal protein S7  50.63 
 
 		 156 aa  186  9e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.13751  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0180  30S ribosomal protein S7  52.53 
 
 		 156 aa  184  4e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0647203  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  54.78 
 
 		 156 aa  184  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0275  30S ribosomal protein S7  57.32 
 
 		 156 aa  183  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000213948  unclonable  0.0000000969286 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  183  6e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  49.04 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312429  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1799  30S ribosomal protein S7  54.78 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0695126  normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3913  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240756  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0450  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0295757  unclonable  0.000000315052 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0480  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.037317  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0541  30S ribosomal protein S7  49.37 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  52.23 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0512  30S ribosomal protein S7  49.37 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.083045  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4753  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00430296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06200  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  181  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0483  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0139239  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0209  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000277948  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0240  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1443  30S ribosomal protein S7  49.37 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0452  30S ribosomal protein S7  48.73 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  52.23 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0291  30S ribosomal protein S7  54.78 
 
 		 157 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000126021  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  53.16 
 
 		 157 aa  181  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1245  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0076  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0676  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00139219  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1342  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000656375  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0622  ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0341393  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  50.96 
 
 		 156 aa  181  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0493  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  180  6e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00259026  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0323  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  180  6e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0188  ribosomal protein S7  51.59 
 
 		 156 aa  180  6e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4552  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  180  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.881982  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0356  30S ribosomal protein S7  49.37 
 
 		 155 aa  180  7e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  50.96 
 
 		 156 aa  180  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  52.23 
 
 		 156 aa  180  8.000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  52.23 
 
 		 156 aa  180  8.000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0195  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0242327  hitchhiker  0.000000200344 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0227  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  54.78 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2328  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 		 155 aa  179  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000186286  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4694  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127766  unclonable  0.0000000319623 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0196  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00224175  hitchhiker  0.00012084 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4060  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00273725  hitchhiker  0.00000107053 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0195  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0296111  hitchhiker  0.00000562021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0190  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0202713  decreased coverage  0.000349844 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4466  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0192  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0139894  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002298  SSU ribosomal protein S7p (S5e)  54.14 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0187  30S ribosomal protein S7  51.9 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00102254  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2772  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143156  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00056  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  47.77 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0144  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000170326  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  52.23 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0166  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261088  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 		 156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  49.68 
 
 		 156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2718  30S ribosomal protein S7  48.41 
 
 		 156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2404  30S ribosomal protein S7  48.41 
 
 		 156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0356  ribosomal protein S7  48.73 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000114638  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1357  30S ribosomal protein S7  50.96 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216177  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0862  30S ribosomal protein S7  50.96 
 
 		 155 aa  177  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0046  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000296735  hitchhiker  6.48919e-23 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0154  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529705  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1076  30S ribosomal protein S7  49.68 
 
 		 156 aa  177  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>