More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0628 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0628  alpha-L-glutamate ligase  100 
 
 		 300 aa  610  1e-173  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  63 
 
 		 299 aa  395  1e-109  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  63.33 
 
 		 299 aa  389  1e-107  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  61 
 
 		 299 aa  376  1e-103  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0763  alpha-L-glutamate ligase  60 
 
 		 299 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.708688  normal  0.325873 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  45.61 
 
 		 295 aa  212  5.999999999999999e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  42.39 
 
 		 293 aa  205  6e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  36.51 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  36.65 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  36.14 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  34.21 
 
 		 292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  42.08 
 
 		 296 aa  187  1e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  29.79 
 
 		 310 aa  122  7e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  31.94 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  32.39 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.8 
 
 		 301 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0248  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.94 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180089 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.38 
 
 		 324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  34.11 
 
 		 411 aa  111  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0263  alpha-L-glutamate ligase  31.94 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  30.58 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.94 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.4 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  29.36 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2098  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.75 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.97 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.15 
 
 		 329 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  30.04 
 
 		 292 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  31.28 
 
 		 302 aa  108  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  31.28 
 
 		 302 aa  108  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.91 
 
 		 299 aa  108  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0273  alpha-L-glutamate ligase  31.48 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.72 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4964  alpha-L-glutamate ligase  31.48 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000940925 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  30.56 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0262  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.02 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345619 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0655  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.8 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.922088  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  31.39 
 
 		 292 aa  105  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2254  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.95 
 
 		 314 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  29.46 
 
 		 301 aa  105  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.84 
 
 		 301 aa  105  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2610  SSU ribosomal protein S6P modification protein  33.63 
 
 		 306 aa  105  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.38 
 
 		 302 aa  104  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  30.33 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3763  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.23 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.86581 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.09 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0505  alpha-L-glutamate ligase  32.23 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3945  alpha-L-glutamate ligase  32.23 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3819  alpha-L-glutamate ligase  32.23 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  30.73 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  30.7 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.86 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.47 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0234  ribosomal protein S6 modification protein  30.09 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0173  S6 modification enzyme RimK  30.09 
 
 		 301 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  29.63 
 
 		 301 aa  103  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  28.7 
 
 		 302 aa  103  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  29.82 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  30.1 
 
 		 301 aa  102  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0546  alpha-L-glutamate ligase  31.28 
 
 		 301 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3484  alpha-L-glutamate ligase  31.28 
 
 		 301 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  31.28 
 
 		 301 aa  102  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  30.52 
 
 		 329 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  28.11 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.58 
 
 		 283 aa  102  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2434  SSU ribosomal protein S6P modification protein  33.33 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5945  alpha-L-glutamate ligase  29.79 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891733 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  29.63 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  29.63 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  30.09 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6485  alpha-L-glutamate ligase  29.96 
 
 		 333 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0928  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.68 
 
 		 447 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2103  ribosomal protein S6 modification protein  31.28 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  28.9 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3081  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.02 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.86 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2024  alpha-L-glutamate ligase  31.28 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.095015  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  33.18 
 
 		 267 aa  100  4e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1240  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.24 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272934  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0545  alpha-L-glutamate ligase  30.52 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0546  ribosomal protein S6 modification protein  30.05 
 
 		 301 aa  99.8  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.63 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  29.17 
 
 		 301 aa  99  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  27.35 
 
 		 292 aa  99  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.23 
 
 		 327 aa  99  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.532418  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2113  alpha-L-glutamate ligase  35.35 
 
 		 340 aa  99  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795675  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1783  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.1 
 
 		 304 aa  99  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0099597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  29.38 
 
 		 459 aa  99  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3121  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.77 
 
 		 447 aa  98.6  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  29.17 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1691  SSU ribosomal protein S6P modification protein  33.49 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  29.09 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5981  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.15 
 
 		 301 aa  98.2  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  29.03 
 
 		 303 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.23 
 
 		 327 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  30.33 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  28.91 
 
 		 456 aa  97.8  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.12 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  26.91 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.39 
 
 		 321 aa  97.4  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>