More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0065 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0065  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 		 177 aa  366  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0090  methionine-R-sulfoxide reductase  98.87 
 
 		 180 aa  362  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0092  methionine-R-sulfoxide reductase  84.29 
 
 		 150 aa  259  1e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 		 506 aa  257  7e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0090  methionine-R-sulfoxide reductase  77.54 
 
 		 190 aa  230  9e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.645705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6049  methionine-R-sulfoxide reductase  58.48 
 
 		 171 aa  219  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  normal  0.218402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0270  methionine-R-sulfoxide reductase  55.11 
 
 		 184 aa  209  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.301923  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7118  methionine-R-sulfoxide reductase  56.07 
 
 		 171 aa  207  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  67.67 
 
 		 154 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  50.28 
 
 		 189 aa  185  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  57.36 
 
 		 137 aa  158  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  56.59 
 
 		 139 aa  157  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  55.81 
 
 		 137 aa  156  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  56.45 
 
 		 132 aa  156  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  55.91 
 
 		 138 aa  155  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  53.17 
 
 		 133 aa  154  6e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  55.04 
 
 		 134 aa  153  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  56.72 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  51.75 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  53.08 
 
 		 133 aa  151  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  54.26 
 
 		 135 aa  150  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  50.78 
 
 		 142 aa  149  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  56.1 
 
 		 183 aa  148  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  52.71 
 
 		 135 aa  147  9e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  51.64 
 
 		 134 aa  147  9e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  53.17 
 
 		 141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  51.91 
 
 		 151 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  52.34 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1027  methionine sulfoxide reductase B  59.17 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  51.56 
 
 		 147 aa  145  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  55.04 
 
 		 130 aa  145  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  48.89 
 
 		 148 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  49.31 
 
 		 137 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  52.38 
 
 		 136 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  53.12 
 
 		 136 aa  144  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  55.74 
 
 		 133 aa  144  9e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  53.12 
 
 		 132 aa  143  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  53.39 
 
 		 133 aa  143  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  52.71 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  52.34 
 
 		 146 aa  143  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  49.68 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  53.44 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  51.54 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  50.36 
 
 		 140 aa  142  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  52.42 
 
 		 144 aa  142  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  50.78 
 
 		 133 aa  141  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  50.39 
 
 		 185 aa  141  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  50.38 
 
 		 137 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  56.91 
 
 		 141 aa  141  5e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  50.79 
 
 		 142 aa  141  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2627  methionine-R-sulfoxide reductase  50.81 
 
 		 136 aa  141  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  52.07 
 
 		 155 aa  140  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  51.15 
 
 		 133 aa  140  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  49.61 
 
 		 136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  51.16 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2582  protein-methionine-S-oxide reductase  50.75 
 
 		 136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1638  methionine-R-sulfoxide reductase  49.19 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  49.6 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2643  methionine-R-sulfoxide reductase  50.81 
 
 		 137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  53.78 
 
 		 131 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2964  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 156 aa  139  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  55.28 
 
 		 140 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12689  hypothetical protein  52.71 
 
 		 136 aa  139  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.09651e-60  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  47.92 
 
 		 137 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  51.56 
 
 		 131 aa  138  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  53.97 
 
 		 137 aa  137  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  50.4 
 
 		 167 aa  137  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  46.53 
 
 		 138 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  48.09 
 
 		 132 aa  137  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33670  methionine-R-sulfoxide reductase  55.74 
 
 		 131 aa  137  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  52.07 
 
 		 135 aa  137  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 136 aa  136  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5464  methionine-R-sulfoxide reductase  51.22 
 
 		 135 aa  136  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  48.09 
 
 		 177 aa  135  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  47.45 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  49.62 
 
 		 132 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  51.24 
 
 		 141 aa  135  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  49.25 
 
 		 137 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  48.85 
 
 		 140 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  47.41 
 
 		 138 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  55.28 
 
 		 140 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  48.12 
 
 		 137 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  47.41 
 
 		 138 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  53.12 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  48.82 
 
 		 136 aa  134  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1654  methionine-R-sulfoxide reductase  50.39 
 
 		 178 aa  134  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  51.18 
 
 		 167 aa  134  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  51.18 
 
 		 198 aa  134  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1317  methionine-R-sulfoxide reductase  48.82 
 
 		 134 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.145812 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  50.42 
 
 		 131 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2552  methionine-R-sulfoxide reductase  46.46 
 
 		 148 aa  134  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417643  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  49.23 
 
 		 132 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  50.82 
 
 		 134 aa  134  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  53.28 
 
 		 138 aa  134  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  53.85 
 
 		 180 aa  134  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  53.23 
 
 		 137 aa  134  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  50.42 
 
 		 131 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  53.85 
 
 		 180 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1661  methionine-R-sulfoxide reductase  44.74 
 
 		 161 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.626292  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3481  methionine-R-sulfoxide reductase  50.77 
 
 		 133 aa  133  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>