More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0353 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0353  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
332 aa  650    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.87 
 
 
370 aa  317  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.805184 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  56.03 
 
 
389 aa  259  3e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  55.25 
 
 
389 aa  257  2e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.19 
 
 
394 aa  250  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1833  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.57 
 
 
395 aa  245  8e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.210479 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.19 
 
 
379 aa  241  9e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.19 
 
 
379 aa  241  9e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.19 
 
 
379 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0313  ATPase domain-containing protein  52.38 
 
 
363 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0134516  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.85 
 
 
394 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.79 
 
 
380 aa  237  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  0.259549 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.22 
 
 
394 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210229  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.22 
 
 
394 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  53.78 
 
 
369 aa  232  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49 
 
 
379 aa  231  9e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203937  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.78 
 
 
369 aa  231  9e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.61 
 
 
381 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.61 
 
 
381 aa  230  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748065  normal  0.851667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.22 
 
 
385 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  50.4 
 
 
356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 
375 aa  212  9e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.59 
 
 
367 aa  202  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.41 
 
 
380 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  42.8 
 
 
354 aa  193  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.85 
 
 
382 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.05 
 
 
483 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.9 
 
 
365 aa  190  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  42.45 
 
 
391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4232  ATP-binding region ATPase domain protein  43.09 
 
 
410 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2605  ATP-binding region ATPase domain protein  43.09 
 
 
410 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.85 
 
 
383 aa  189  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 
359 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  42.98 
 
 
449 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 
473 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  41.06 
 
 
473 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 
487 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 
471 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5346  histidine kinase  41.39 
 
 
558 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  0.150364 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.15 
 
 
354 aa  180  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.016689  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
723 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.5 
 
 
471 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  41.06 
 
 
470 aa  179  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  36.78 
 
 
464 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 
425 aa  179  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 
483 aa  179  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.45 
 
 
458 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  41.7 
 
 
593 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  39.92 
 
 
364 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  39.92 
 
 
364 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 
358 aa  176  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2708  histidine kinase  45.88 
 
 
469 aa  175  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.128907  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  44.26 
 
 
594 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0088  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 
359 aa  175  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2307  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.59 
 
 
666 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  38.43 
 
 
463 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  41.98 
 
 
423 aa  172  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
364 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 
473 aa  172  9e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.86 
 
 
467 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 
413 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.45 
 
 
467 aa  170  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0391914 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  37.45 
 
 
467 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  37.45 
 
 
467 aa  169  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  37.45 
 
 
467 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.45 
 
 
467 aa  169  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.45 
 
 
467 aa  169  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 
463 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000121964  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  41.74 
 
 
360 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.04 
 
 
467 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.63 
 
 
467 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.04 
 
 
467 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1489  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 
465 aa  166  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0687129  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 
582 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  36.99 
 
 
463 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 
458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  38.96 
 
 
496 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 
509 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  30.86 
 
 
310 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4195  histidine kinase  41.56 
 
 
592 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445902  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
459 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.76 
 
 
453 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
453 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 
504 aa  162  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
454 aa  162  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 
585 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 
371 aa  162  8.000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3304  sensor histidine kinase BaeS  33.74 
 
 
514 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
646 aa  161  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.21 
 
 
461 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1680  sensor histidine kinase  38.02 
 
 
465 aa  160  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.69088  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  30.45 
 
 
473 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  35.95 
 
 
466 aa  159  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  36.21 
 
 
466 aa  159  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  36.21 
 
 
466 aa  159  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  36.21 
 
 
466 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  36.21 
 
 
466 aa  159  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  36.21 
 
 
466 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  36.21 
 
 
466 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>