More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05900 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_05900  serine-pyruvate aminotransferase  100 
 
 		 355 aa  735    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000730264 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0870  aminotransferase, class V  44.28 
 
 		 338 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  29.05 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0969  aminotransferase class V  29.19 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.716227  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  29.01 
 
 		 380 aa  166  4e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  29.3 
 
 		 384 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  33.71 
 
 		 391 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  27.32 
 
 		 380 aa  160  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  31.94 
 
 		 397 aa  155  1e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  31.18 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  28.85 
 
 		 379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  28.61 
 
 		 385 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  31.83 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  29.26 
 
 		 362 aa  151  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  29.55 
 
 		 389 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  28.65 
 
 		 384 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  29.66 
 
 		 363 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  29.13 
 
 		 360 aa  150  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  29.25 
 
 		 362 aa  149  5e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  29.75 
 
 		 389 aa  149  6e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  28.85 
 
 		 382 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  28.85 
 
 		 382 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  30.25 
 
 		 382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  27.7 
 
 		 383 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  32.78 
 
 		 394 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  28.81 
 
 		 360 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  27.35 
 
 		 384 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  27.35 
 
 		 384 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  30.29 
 
 		 382 aa  143  6e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  26.97 
 
 		 387 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  28.21 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.56 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  29.2 
 
 		 385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  26.35 
 
 		 387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  27.33 
 
 		 382 aa  139  4.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  29.01 
 
 		 379 aa  139  6e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  29.01 
 
 		 379 aa  139  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  28.1 
 
 		 380 aa  139  8.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  28.81 
 
 		 379 aa  138  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  29.06 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.14 
 
 		 400 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  29.64 
 
 		 382 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  29.97 
 
 		 382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1287  aminotransferase, class V  27.7 
 
 		 387 aa  136  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17916  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  28.17 
 
 		 382 aa  136  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  28.45 
 
 		 379 aa  136  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  28.36 
 
 		 382 aa  136  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  30.14 
 
 		 375 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  29.53 
 
 		 380 aa  135  8e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  27.55 
 
 		 395 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  26.69 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  27.62 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  30.29 
 
 		 382 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  28.66 
 
 		 383 aa  133  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  28.18 
 
 		 391 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  28.33 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  27.97 
 
 		 384 aa  130  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  28.53 
 
 		 385 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  26.7 
 
 		 384 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  29.73 
 
 		 381 aa  129  6e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  28.98 
 
 		 383 aa  129  8.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  30 
 
 		 395 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  28.06 
 
 		 387 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  27.17 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1762  aminotransferase class V  28.09 
 
 		 412 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.0159311 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  27.11 
 
 		 396 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  28.02 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  27.95 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  27.98 
 
 		 387 aa  122  9e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  29.12 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  29.33 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  27.01 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3126  aminotransferase class V  30.36 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  26.82 
 
 		 398 aa  119  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0828  aminotransferase, class V  28.93 
 
 		 383 aa  119  7.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  25.41 
 
 		 385 aa  119  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  25.41 
 
 		 385 aa  119  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  27.93 
 
 		 360 aa  119  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  30.53 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  30.61 
 
 		 401 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1315  aminotransferase, class V  27.65 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.754091  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  27.12 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  29.05 
 
 		 387 aa  116  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1674  aminotransferase, class V  28.41 
 
 		 372 aa  116  6.9999999999999995e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00211461  normal  0.187219 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  27.89 
 
 		 385 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  25.85 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  28.57 
 
 		 381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  31.15 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  26.86 
 
 		 396 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0713  aminotransferase, class V  28.83 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0073  aminotransferase, class V  26.18 
 
 		 370 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2387  aminotransferase class V  27.37 
 
 		 355 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.271517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  27.17 
 
 		 412 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0909  aminotransferase class V  28.57 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.520093  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  26.88 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  27.6 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3000  alanine--glyoxylate transaminase  26.94 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  26.61 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  27.86 
 
 		 355 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>