More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04440 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_20670  aspartyl-tRNA synthetase  73.52 
 
 
593 aa  920    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0420  aspartyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 
608 aa  666    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04440  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
592 aa  1229    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.462018  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 
600 aa  645    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0600  aspartyl-tRNA synthetase  77.03 
 
 
592 aa  975    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  53.34 
 
 
608 aa  630  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  53.08 
 
 
594 aa  627  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 
596 aa  626  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  53.25 
 
 
594 aa  623  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 
627 aa  623  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 
593 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 
591 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 
591 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 
591 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 
591 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 
591 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 
591 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 
593 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 
591 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 
597 aa  609  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 
591 aa  609  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 
591 aa  609  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 
595 aa  610  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  52.6 
 
 
600 aa  611  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 
586 aa  611  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 
589 aa  608  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 
594 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 
593 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 
598 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  52.91 
 
 
613 aa  605  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 
590 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  51.56 
 
 
591 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
602 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 
597 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
592 aa  595  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
594 aa  592  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
592 aa  590  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
593 aa  588  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  51.89 
 
 
606 aa  591  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
590 aa  590  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  50.95 
 
 
601 aa  585  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 
614 aa  587  1e-166  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 
610 aa  585  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 
594 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 
598 aa  579  1e-164  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 
598 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 
595 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 
588 aa  577  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 
588 aa  577  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 
585 aa  573  1.0000000000000001e-162  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0724  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
600 aa  570  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000988367  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
588 aa  571  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
594 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 
597 aa  570  1e-161  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0708  aspartyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 
598 aa  565  1e-160  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000309343  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
588 aa  568  1e-160  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2107  aspartyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 
583 aa  567  1e-160  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.863952  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
596 aa  566  1e-160  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1948  aspartyl-tRNA synthetase  49.31 
 
 
583 aa  567  1e-160  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 
599 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
591 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 
593 aa  564  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 
589 aa  564  1.0000000000000001e-159  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1484  aspartyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 
587 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.04576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 
594 aa  561  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 
593 aa  559  1e-158  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
591 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_612  aspartyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
598 aa  561  1e-158  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000641857  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 
597 aa  561  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 
597 aa  558  1e-158  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
605 aa  555  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 
590 aa  555  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 
602 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
594 aa  556  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
599 aa  555  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 
598 aa  556  1e-157  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0590  aspartyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 
591 aa  557  1e-157  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1213  aspartyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 
591 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352456  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4545  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
590 aa  554  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486893  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
591 aa  552  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 
591 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 
602 aa  551  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  49.04 
 
 
600 aa  553  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51820  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
591 aa  552  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000228175  hitchhiker  0.000212692 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 
617 aa  552  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
599 aa  551  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
623 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3016  aspartyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 
596 aa  550  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.187201 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 
592 aa  548  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 
603 aa  551  1e-155  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2776  aspartyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 
600 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233707  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 
591 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0381  aspartyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 
599 aa  551  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
623 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2752  aspartyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 
600 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314882  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1844  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
592 aa  546  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00295429  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2113  aspartyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 
600 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19758  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2643  aspartyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 
600 aa  548  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21858  normal  0.167975 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 
607 aa  546  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
599 aa  548  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>