More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_20670 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0420  aspartyl-tRNA synthetase  53.22 
 
 
608 aa  655    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20670  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
593 aa  1231    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0600  aspartyl-tRNA synthetase  75.04 
 
 
592 aa  944    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04440  aspartyl-tRNA synthetase  73.52 
 
 
592 aa  903    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.462018  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  53.2 
 
 
600 aa  626  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 
590 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 
591 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 
591 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 
591 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 
591 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 
591 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 
591 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 
591 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 
591 aa  600  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 
591 aa  601  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 
593 aa  600  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 
608 aa  601  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 
595 aa  594  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  51.29 
 
 
597 aa  592  1e-168  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  51.29 
 
 
589 aa  593  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  50.95 
 
 
594 aa  589  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  51.3 
 
 
591 aa  589  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 
594 aa  590  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 
596 aa  585  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 
598 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 
586 aa  582  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
594 aa  580  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
592 aa  579  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 
592 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  50.69 
 
 
627 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 
600 aa  572  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 
613 aa  569  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
588 aa  570  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 
602 aa  565  1e-160  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 
606 aa  566  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 
590 aa  567  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 
597 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
593 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
593 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 
593 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 
594 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 
598 aa  560  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 
585 aa  560  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
610 aa  559  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2107  aspartyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 
583 aa  555  1e-157  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.863952  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 
595 aa  558  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 
594 aa  554  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 
601 aa  554  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
598 aa  549  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1948  aspartyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 
583 aa  550  1e-155  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 
594 aa  551  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 
617 aa  548  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0708  aspartyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 
598 aa  545  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000309343  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 
596 aa  548  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 
588 aa  545  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 
619 aa  545  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0913  aspartyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
582 aa  545  1e-154  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.570744  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
594 aa  545  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1484  aspartyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 
587 aa  545  1e-154  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.04576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 
614 aa  543  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 
598 aa  543  1e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 
589 aa  543  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0724  aspartyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
600 aa  544  1e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000988367  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
589 aa  543  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_002950  PG0153  aspartyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
587 aa  538  9.999999999999999e-153  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 
599 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 
590 aa  540  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 
603 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
599 aa  540  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_612  aspartyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 
598 aa  539  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000641857  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0111  aspartyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
616 aa  541  9.999999999999999e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 
592 aa  538  9.999999999999999e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 
594 aa  540  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 
592 aa  537  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 
588 aa  535  1e-151  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 
597 aa  536  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
602 aa  537  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
602 aa  535  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  46.66 
 
 
599 aa  532  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 
594 aa  535  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 
599 aa  534  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 
597 aa  532  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 
588 aa  534  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 
588 aa  534  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0381  aspartyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 
599 aa  531  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 
599 aa  533  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 
597 aa  535  1e-150  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 
591 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 
593 aa  530  1e-149  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 
593 aa  528  1e-149  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0814  aspartyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 
582 aa  530  1e-149  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1844  aspartyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 
592 aa  531  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00295429  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01940  aspartyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 
582 aa  531  1e-149  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.425315  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 
597 aa  531  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
592 aa  531  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 
607 aa  531  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 
600 aa  526  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1248  aspartyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 
583 aa  526  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 
599 aa  527  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1621  aspartyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 
599 aa  525  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.504505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>