183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3468 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3468  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 535 aa  1104    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116112  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1145  carbohydrate kinase FGGY  69.39 
 
 		 532 aa  784    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0242  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  54.46 
 
 		 531 aa  624  1e-177  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14138  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0034  sugar kinase  53.11 
 
 		 530 aa  616  1e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0227  L-ribulokinase (putative)  54.77 
 
 		 532 aa  602  1.0000000000000001e-171  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0854  L-ribulokinase (putative)  51.99 
 
 		 539 aa  587  1e-166  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1020  putative L-ribulokinase  53.7 
 
 		 548 aa  581  1e-164  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2755  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  50.57 
 
 		 538 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.018415  decreased coverage  0.00000370584 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0480  carbohydrate kinase, FGGY  51.14 
 
 		 540 aa  576  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.50905  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0496  carbohydrate kinase FGGY  52.18 
 
 		 539 aa  574  1.0000000000000001e-162  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.906538 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29500  pentulose/hexulose kinase  47.92 
 
 		 546 aa  535  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0401  carbohydrate kinase FGGY  50.57 
 
 		 537 aa  527  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42527  predicted protein  29.03 
 
 		 522 aa  181  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000294856  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  24.05 
 
 		 501 aa  103  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  25.1 
 
 		 512 aa  95.5  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  23.81 
 
 		 500 aa  94  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  23.13 
 
 		 518 aa  84.3  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  22.82 
 
 		 489 aa  84  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  23.68 
 
 		 509 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  24.1 
 
 		 509 aa  80.9  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  21.79 
 
 		 496 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  22.43 
 
 		 509 aa  76.6  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  22.26 
 
 		 490 aa  71.6  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  22.31 
 
 		 515 aa  69.7  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  22.39 
 
 		 499 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  19.56 
 
 		 493 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  21.54 
 
 		 499 aa  67.4  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  21.58 
 
 		 496 aa  67  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  21.85 
 
 		 510 aa  66.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  24 
 
 		 486 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  24 
 
 		 486 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  24 
 
 		 486 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  24.04 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  20.81 
 
 		 497 aa  65.1  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  22.81 
 
 		 506 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  22.29 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  20 
 
 		 493 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  22.95 
 
 		 498 aa  63.5  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  22.37 
 
 		 511 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  20.74 
 
 		 494 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  22.16 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  22.16 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  22.96 
 
 		 486 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  21.69 
 
 		 502 aa  62  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  24.26 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  24.26 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  24.26 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  24.26 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  22.16 
 
 		 492 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  22.51 
 
 		 495 aa  60.5  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  21.69 
 
 		 487 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  22.22 
 
 		 493 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  22.16 
 
 		 492 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  22.7 
 
 		 502 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  22.18 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  19.53 
 
 		 496 aa  58.9  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  22.29 
 
 		 496 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  22.96 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  21.06 
 
 		 504 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  21.65 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  20.75 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  21.59 
 
 		 498 aa  58.2  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  23.2 
 
 		 485 aa  58.2  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  24.75 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  23.86 
 
 		 485 aa  57.8  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  23.15 
 
 		 499 aa  57.8  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  22.04 
 
 		 498 aa  57.4  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  23.61 
 
 		 484 aa  57  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  23.61 
 
 		 484 aa  57  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  23.61 
 
 		 484 aa  57  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  23.55 
 
 		 484 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  23.61 
 
 		 484 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  23.42 
 
 		 484 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  20.95 
 
 		 487 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  20.15 
 
 		 494 aa  55.8  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  20.9 
 
 		 493 aa  54.7  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  22.3 
 
 		 486 aa  54.7  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  20 
 
 		 493 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  21.58 
 
 		 489 aa  54.7  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  24.34 
 
 		 484 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  23.33 
 
 		 484 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  22.84 
 
 		 481 aa  54.3  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3071  xylulokinase  22 
 
 		 488 aa  53.9  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  19.66 
 
 		 493 aa  53.9  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  21.5 
 
 		 488 aa  53.9  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  19.66 
 
 		 493 aa  53.9  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  21.5 
 
 		 488 aa  53.9  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  22.34 
 
 		 491 aa  53.5  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  20.54 
 
 		 500 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  22.89 
 
 		 493 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  21.5 
 
 		 488 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  21.13 
 
 		 483 aa  53.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  22.46 
 
 		 511 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  22.39 
 
 		 486 aa  52.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  20.73 
 
 		 490 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  19.05 
 
 		 493 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  22.83 
 
 		 517 aa  52.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  20.73 
 
 		 490 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  20.73 
 
 		 490 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0409  glycerol kinase  24 
 
 		 481 aa  52.8  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>