146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0849 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0849  NusG antitermination factor  100 
 
 		 173 aa  346  8e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0204  NusG antitermination factor  56.65 
 
 		 188 aa  209  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1362  NusG antitermination factor  57.8 
 
 		 185 aa  207  7e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0821693  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2445  NusG antitermination factor  30.86 
 
 		 172 aa  92  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.012878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12290  transcription antiterminator  32.57 
 
 		 169 aa  85.5  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1920  NusG antitermination factor  32.76 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.549773  hitchhiker  0.00427943 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4226  NusG antitermination factor  26.74 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.841034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2239  NusG antitermination factor  27.81 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000688878  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1880  NusG antitermination factor  29.14 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  hitchhiker  0.00000812866 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1881  NusG antitermination factor  31.61 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.541166  hitchhiker  0.00000716942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1702  NusG antitermination factor  28.26 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00942091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0267  transcription antitermination protein nusG  24.58 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185967  hitchhiker  0.0014194 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  26.4 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0019  transcription antitermination protein NusG, putative  26.11 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000223141  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  25.28 
 
 		 194 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2041  NusG antitermination factor  22.28 
 
 		 176 aa  51.6  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  25.28 
 
 		 194 aa  51.6  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0283  NusG antitermination factor  24.39 
 
 		 191 aa  51.2  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000819878  hitchhiker  0.00383281 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1892  transcription antitermination protein nusG  22.83 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.194693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  23.46 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2684  NusG antitermination factor  26.06 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000736005  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0891  transcriptional activator  26.29 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2182  NusG antitermination factor  22.83 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0729444  normal  0.026966 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0314  NusG antitermination factor  24.39 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000044126  decreased coverage  0.000127563 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0191  NusG antitermination factor  24.24 
 
 		 191 aa  48.9  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000382089  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1967  NusG antitermination factor  24.7 
 
 		 192 aa  48.9  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.688216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3454  NusG antitermination factor  21.79 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000805693  normal  0.0356218 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  24.72 
 
 		 172 aa  48.5  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  25.14 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  23.16 
 
 		 177 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0228  transcription antitermination protein nusG  25.45 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00207828  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  25.14 
 
 		 185 aa  48.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  25.14 
 
 		 185 aa  48.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  25.14 
 
 		 185 aa  48.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1124  transcriptional activator RfaH  25.15 
 
 		 167 aa  47.8  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  25.7 
 
 		 201 aa  47.8  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  25.28 
 
 		 177 aa  47.8  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4020  NusG antitermination factor  22.47 
 
 		 189 aa  47.4  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.579663  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  23.6 
 
 		 177 aa  47.4  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0283  NusG antitermination factor  25.99 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912407  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  23.03 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  23.86 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000110912  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0566  transcription antitermination protein NusG  24.72 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268519  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  23.86 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2112  transcription antitermination protein NusG  22.1 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000000834658  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  26.23 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1938  NusG antitermination factor  24.1 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  25.42 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  25.42 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0149  NusG antitermination factor  26.63 
 
 		 197 aa  45.4  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.114969  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  25.42 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0409  transcription antitermination protein NusG  24.43 
 
 		 177 aa  45.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00119754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  25.42 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  25.42 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  25.42 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  25.42 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  25.42 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  22.78 
 
 		 188 aa  45.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1636  NusG antitermination factor  33.8 
 
 		 85 aa  45.1  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2265  NusG antitermination factor  19.41 
 
 		 175 aa  45.1  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0311  NusG antitermination factor  21.31 
 
 		 177 aa  45.1  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000340936  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00690  transcription termination/antitermination factor NusG  25 
 
 		 183 aa  44.7  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000164845  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0158  transcription termination/antitermination factor NusG  25 
 
 		 183 aa  44.7  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000171251  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04536  transcription antitermination protein NusG  23.33 
 
 		 185 aa  44.7  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1953  NusG antitermination factor  23.91 
 
 		 195 aa  44.7  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00519694  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2201  transcription antitermination protein NusG  22.1 
 
 		 185 aa  44.7  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000256386  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0744  transcription antitermination protein NusG  22.78 
 
 		 186 aa  44.7  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000594191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1867  transcription antitermination protein  23.56 
 
 		 188 aa  44.7  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420515  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0322  transcription termination/antitermination factor NusG  23.56 
 
 		 173 aa  44.7  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00302903  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  25.42 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  24.86 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0352  NusG antitermination factor  24.16 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000459133  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  24.86 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3174  transcription antitermination protein nusG  20.54 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  23.3 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  23.3 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  24.86 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  24.86 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2803  NusG antitermination factor  23.67 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  24.43 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  22.86 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000043421  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  24.86 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1650  transcriptional acivator RfaH  28.11 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0204524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  24.86 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0037  NusG antitermination factor  24.29 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000759472  hitchhiker  0.0000000000226007 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  24.86 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4777  transcription termination/antitermination factor NusG  25.14 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  22.6 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1665  NusG antitermination factor  24.5 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  25.42 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  22.65 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  24.43 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0444  NusG antitermination factor  21.71 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  22.03 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  22.29 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1631  NusG antitermination factor  21.47 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00050  putative transcription antitermination protein  22.28 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1699  NusG antitermination factor  24.49 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  24.29 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  20.65 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>