More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2538 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2538  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 139 aa  283  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.565005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4361  nucleoside diphosphate kinase  82.48 
 
 		 140 aa  234  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4923  nucleoside diphosphate kinase  81.02 
 
 		 140 aa  231  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0403558  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0488  nucleoside diphosphate kinase  78.68 
 
 		 140 aa  224  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.94112  normal  0.716052 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1974  nucleoside diphosphate kinase  76.3 
 
 		 140 aa  215  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.209722 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2288  nucleoside diphosphate kinase  74.81 
 
 		 140 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2328  nucleoside diphosphate kinase  74.45 
 
 		 140 aa  211  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2012  nucleoside diphosphate kinase  74.07 
 
 		 140 aa  209  7.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.684832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1746  nucleoside diphosphate kinase  75.91 
 
 		 140 aa  207  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2901  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1127  nucleoside diphosphate kinase  72.99 
 
 		 140 aa  201  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.355617 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2122  nucleoside diphosphate kinase  70.07 
 
 		 140 aa  202  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2894  nucleoside diphosphate kinase  72.99 
 
 		 140 aa  201  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.588521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1538  nucleoside diphosphate kinase  72.99 
 
 		 140 aa  201  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2433  nucleoside diphosphate kinase  67.88 
 
 		 140 aa  200  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0030  nucleoside diphosphate kinase  72.46 
 
 		 140 aa  199  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.348386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2318  nucleoside diphosphate kinase  70.8 
 
 		 140 aa  199  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2485  nucleoside diphosphate kinase  70.07 
 
 		 140 aa  199  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1601  nucleoside diphosphate kinase  68.61 
 
 		 140 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00859967  normal  0.254258 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3466  nucleoside diphosphate kinase  69.34 
 
 		 140 aa  197  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157142  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2961  nucleoside diphosphate kinase  69.34 
 
 		 140 aa  197  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0984592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0968  nucleoside diphosphate kinase  69.34 
 
 		 140 aa  197  6e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00326747 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2169  nucleoside diphosphate kinase  74.26 
 
 		 140 aa  194  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0237  nucleoside diphosphate kinase  70.07 
 
 		 140 aa  194  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal  0.83109 
 
 
-
 
NC_004310  BR0694  nucleoside diphosphate kinase  69.34 
 
 		 140 aa  194  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.900866  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0685  nucleoside diphosphate kinase  69.34 
 
 		 140 aa  194  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1822  nucleoside diphosphate kinase  69.34 
 
 		 140 aa  194  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0957  nucleoside diphosphate kinase  70.07 
 
 		 140 aa  193  7e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1350  nucleoside diphosphate kinase  70.07 
 
 		 140 aa  192  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.388595 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1079  nucleoside diphosphate kinase  65.69 
 
 		 140 aa  191  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000368146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1224  nucleoside diphosphate kinase  65.69 
 
 		 140 aa  191  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131645 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2594  nucleoside diphosphate kinase  67.15 
 
 		 140 aa  190  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  70.07 
 
 		 140 aa  189  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1759  nucleoside diphosphate kinase  68.38 
 
 		 140 aa  187  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0775  nucleoside diphosphate kinase  65.69 
 
 		 140 aa  187  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3838  nucleoside diphosphate kinase  71.53 
 
 		 140 aa  186  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.502354 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0514  nucleoside diphosphate kinase  64.23 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.321088  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0894  nucleoside diphosphate kinase  66.91 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139474  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1234  nucleoside-diphosphate kinase  67.15 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0263228  normal  0.0520892 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1979  nucleoside diphosphate kinase  62.77 
 
 		 140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1311  nucleoside-diphosphate kinase  65.94 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.298971  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1552  nucleoside diphosphate kinase  65.15 
 
 		 132 aa  177  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.744593  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0925  nucleoside diphosphate kinase  59.71 
 
 		 139 aa  175  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.621681 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2890  Nucleoside-diphosphate kinase  61.31 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.421827  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3160  nucleoside diphosphate kinase  59.71 
 
 		 139 aa  175  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00622384 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1439  nucleoside diphosphate kinase  58.99 
 
 		 139 aa  173  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0019677  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1183  nucleoside diphosphate kinase  61.03 
 
 		 139 aa  170  5.999999999999999e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  61.03 
 
 		 141 aa  168  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2686  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 137 aa  167  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.77267e-18  normal  0.505951 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2190  Nucleoside-diphosphate kinase  61.03 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0233  nucleoside diphosphate kinase  62.5 
 
 		 137 aa  164  2.9999999999999998e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2164  Nucleoside-diphosphate kinase  54.68 
 
 		 139 aa  163  6.9999999999999995e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.961833 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2559  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.17056e-35 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  60.29 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1654  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000296551  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2992  nucleoside diphosphate kinase  58.82 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000780378  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1110  nucleoside diphosphate kinase  57.35 
 
 		 137 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000208887  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  58.82 
 
 		 143 aa  160  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4256  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 143 aa  160  7e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  59.56 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  58.7 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1747  nucleoside diphosphate kinase  59.56 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000066664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1827  nucleoside diphosphate kinase  59.56 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00692161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 143 aa  159  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2544  nucleoside diphosphate kinase  60 
 
 		 141 aa  157  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478014  hitchhiker  0.00487946 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2272  nucleoside diphosphate kinase  58.82 
 
 		 143 aa  157  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000444266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1702  nucleoside diphosphate kinase  59.56 
 
 		 137 aa  157  5e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0225  Nucleoside-diphosphate kinase  59.26 
 
 		 137 aa  157  5e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0787  nucleoside diphosphate kinase  57.35 
 
 		 141 aa  157  6e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.365993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1580  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 		 137 aa  157  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000001622  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 		 141 aa  157  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2377  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 143 aa  156  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000377324  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2493  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 143 aa  156  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  hitchhiker  0.00287307 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1970  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 143 aa  156  7e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570351  hitchhiker  0.000372949 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2389  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 143 aa  156  7e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00124206  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  56.62 
 
 		 164 aa  156  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1591  nucleoside diphosphate kinase  60 
 
 		 141 aa  156  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2141  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 143 aa  156  9e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000896706  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3611  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 138 aa  156  9e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1498  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 		 143 aa  156  9e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300953  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  59.26 
 
 		 141 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  59.26 
 
 		 141 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  56.62 
 
 		 143 aa  156  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0619  nucleoside-diphosphate kinase  55.22 
 
 		 141 aa  156  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000154193  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3394  nucleoside diphosphate kinase  55.56 
 
 		 141 aa  156  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3504  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 		 143 aa  155  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2274  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1301  nucleoside diphosphate kinase  56.62 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378961  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0074  Nucleoside-diphosphate kinase  53.28 
 
 		 138 aa  155  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0647  nucleoside diphosphate kinase  56.62 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1342  nucleoside diphosphate kinase  57.04 
 
 		 139 aa  154  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00960069  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0354  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 137 aa  154  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.773452  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1775  nucleoside-diphosphate kinase  57.04 
 
 		 137 aa  154  4e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2180  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 		 140 aa  154  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0298319  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0377  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 137 aa  154  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0678  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 143 aa  153  6e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.910925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1626  nucleoside diphosphate kinase  58.52 
 
 		 137 aa  153  6e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2862  nucleoside diphosphate kinase  56.62 
 
 		 143 aa  153  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.760882  hitchhiker  0.0000000204456 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01064  nucleoside diphosphate kinase  56.62 
 
 		 141 aa  153  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0990  nucleoside diphosphate kinase  57.35 
 
 		 137 aa  153  7e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1123  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 		 142 aa  153  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>