More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2504 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2504  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 460 aa  912    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1207  DNA repair protein RadA  65.66 
 
 		 458 aa  530  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3485  DNA repair protein RadA  63.51 
 
 		 474 aa  523  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692018 
 
 
-
 
NC_004310  BR0449  DNA repair protein RadA  59.44 
 
 		 467 aa  513  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165637  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0455  DNA repair protein RadA  59.23 
 
 		 467 aa  511  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1064  DNA repair protein RadA  61.97 
 
 		 452 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.66544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2456  DNA repair protein RadA  61.97 
 
 		 452 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  56.55 
 
 		 467 aa  508  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1119  DNA repair protein RadA  61.97 
 
 		 452 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.340586 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  58.37 
 
 		 466 aa  510  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0562  DNA repair protein RadA  61.86 
 
 		 464 aa  504  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.814745  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1044  DNA repair protein RadA  58.59 
 
 		 466 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1189  DNA repair protein RadA  58.59 
 
 		 466 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380692  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0489  DNA repair protein RadA  60.09 
 
 		 457 aa  503  1e-141  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.665667  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2129  DNA repair protein RadA  59.76 
 
 		 455 aa  497  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.875143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4092  DNA repair protein RadA  60.51 
 
 		 455 aa  496  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2015  DNA repair protein RadA  61.78 
 
 		 486 aa  495  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.086129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3789  DNA repair protein RadA  61.24 
 
 		 499 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3936  DNA repair protein RadA  58.79 
 
 		 476 aa  495  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.075328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4304  DNA repair protein RadA  59 
 
 		 476 aa  497  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0337551 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3499  DNA repair protein RadA  62.44 
 
 		 485 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4409  DNA repair protein RadA  59.29 
 
 		 481 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.589948 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0415  DNA repair protein RadA  59.29 
 
 		 470 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2291  DNA repair protein RadA  61.15 
 
 		 482 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.284518  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1784  DNA repair protein RadA  60.28 
 
 		 454 aa  494  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4631  DNA repair protein RadA  60 
 
 		 477 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.742671  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3897  DNA repair protein RadA  60.04 
 
 		 478 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.217877 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2454  DNA repair protein RadA  62.21 
 
 		 483 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.819464  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1712  DNA repair protein RadA  58.69 
 
 		 455 aa  488  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.136365  normal  0.743682 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2597  DNA repair protein RadA  59.73 
 
 		 477 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0406  DNA repair protein RadA  61.36 
 
 		 469 aa  487  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2995  DNA repair protein RadA  61.97 
 
 		 495 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1806  DNA repair protein RadA  57.78 
 
 		 453 aa  487  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.75981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2309  DNA repair protein RadA  60.09 
 
 		 471 aa  478  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2284  DNA repair protein RadA  60.18 
 
 		 503 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3941  DNA repair protein RadA  57.33 
 
 		 454 aa  470  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1956  DNA repair protein RadA  59.58 
 
 		 455 aa  468  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0985  DNA repair protein RadA  59.65 
 
 		 462 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2402  DNA repair protein RadA  60.23 
 
 		 489 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0305  DNA repair protein RadA  50.94 
 
 		 450 aa  462  1e-129  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0403  DNA repair protein RadA  59.15 
 
 		 466 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0887  DNA repair protein RadA  52.33 
 
 		 450 aa  455  1e-127  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0698  DNA repair protein RadA  49.3 
 
 		 450 aa  450  1e-125  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1850  DNA repair protein RadA  58.29 
 
 		 469 aa  433  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  49.78 
 
 		 452 aa  425  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  50 
 
 		 453 aa  424  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  48.06 
 
 		 457 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  47.93 
 
 		 458 aa  418  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  48.69 
 
 		 458 aa  420  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  51.24 
 
 		 450 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  48.37 
 
 		 484 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  50.34 
 
 		 450 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  47.7 
 
 		 458 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  47.7 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  47.7 
 
 		 458 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  47.7 
 
 		 458 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  47.7 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  47.7 
 
 		 458 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  47.92 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  47.7 
 
 		 458 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  49.66 
 
 		 453 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  47.7 
 
 		 458 aa  415  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  49.66 
 
 		 449 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  46.6 
 
 		 454 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  49.56 
 
 		 453 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  42.52 
 
 		 453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1332  DNA repair protein RadA  49.45 
 
 		 453 aa  402  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.909582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  42.2 
 
 		 454 aa  405  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1145  DNA repair protein RadA  48.03 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  49.09 
 
 		 447 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  49.65 
 
 		 460 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  47.99 
 
 		 457 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  44.42 
 
 		 457 aa  396  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  46.06 
 
 		 458 aa  398  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  44.2 
 
 		 454 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3492  DNA repair protein RadA  47.19 
 
 		 460 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  46.92 
 
 		 451 aa  395  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  44.09 
 
 		 461 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  46.92 
 
 		 451 aa  395  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4991  DNA repair protein RadA  46.19 
 
 		 460 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0825  DNA repair protein RadA  47.19 
 
 		 460 aa  397  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  43.9 
 
 		 457 aa  396  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  48.64 
 
 		 448 aa  397  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1045  DNA repair protein RadA  44.73 
 
 		 454 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.665867  normal  0.0445974 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1110  DNA repair protein RadA  44.73 
 
 		 454 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3621  DNA repair protein RadA  47.19 
 
 		 460 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  47.88 
 
 		 453 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  45.24 
 
 		 461 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  44.2 
 
 		 454 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  49.41 
 
 		 448 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  47.46 
 
 		 453 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1049  DNA repair protein RadA  44.73 
 
 		 454 aa  395  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0626  DNA repair protein RadA  45.3 
 
 		 459 aa  393  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1226  DNA repair protein RadA  44.52 
 
 		 454 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4903  DNA repair protein RadA  45.97 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1148  DNA repair protein RadA  44.52 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0384904 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3358  DNA repair protein RadA  44.52 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.918494 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2057  DNA repair protein RadA  49.02 
 
 		 458 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0548  DNA repair protein RadA  46.3 
 
 		 461 aa  393  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2038  DNA repair protein RadA  48.8 
 
 		 458 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>