68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1682 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1682  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  707    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.075067  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3062  hypothetical protein  53.46 
 
 
385 aa  353  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1307  hypothetical protein  46.09 
 
 
443 aa  293  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.618243  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2238  hypothetical protein  45.05 
 
 
367 aa  290  3e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502937  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2746  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.71 
 
 
396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44350  hypothetical protein  42.54 
 
 
394 aa  263  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189571  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.87 
 
 
397 aa  227  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3067  putative phosphatidyltransferase  34.97 
 
 
402 aa  159  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.802926  normal  0.32934 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2923  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.51 
 
 
429 aa  93.2  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1251  hypothetical protein  24.62 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.282628  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1362  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  32.19 
 
 
265 aa  57  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5154  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.19 
 
 
301 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113865  decreased coverage  0.000103616 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3539  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.15 
 
 
226 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.15 
 
 
226 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  0.387897 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10690  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  34.56 
 
 
203 aa  52.8  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0112608  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.05 
 
 
203 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.0571807 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35 
 
 
226 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1910  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35 
 
 
226 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4241  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35 
 
 
231 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3394  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35 
 
 
231 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35 
 
 
231 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484601  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.08 
 
 
221 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.36 
 
 
200 aa  50.1  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.25 
 
 
216 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.46 
 
 
428 aa  49.7  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0624  hypothetical protein  31.4 
 
 
233 aa  49.3  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0065  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.73 
 
 
197 aa  49.7  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.364844  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.27 
 
 
203 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00859125  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2070  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.98 
 
 
276 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0999876  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  32.98 
 
 
229 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.67 
 
 
207 aa  48.1  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0138452  normal  0.0276686 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17430  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  38.24 
 
 
215 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0943717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0358  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.17 
 
 
208 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0166511  normal  0.5363 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0754  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  32.98 
 
 
229 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.623389  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2022  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  32.98 
 
 
229 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0695  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  32.98 
 
 
229 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0352071  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1047  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  32.98 
 
 
229 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0784  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  32.98 
 
 
229 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.62 
 
 
410 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2041  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36 
 
 
209 aa  47  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000224281 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33864  predicted protein  25.24 
 
 
465 aa  47  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0421094  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.93 
 
 
194 aa  47  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0979  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
270 aa  46.6  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3836  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.43 
 
 
220 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.17 
 
 
233 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0819  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.16 
 
 
216 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.0722385 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.27 
 
 
530 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2334  hypothetical protein  30 
 
 
525 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  35.29 
 
 
231 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2244  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  25.79 
 
 
222 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.8 
 
 
507 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3064  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.02 
 
 
206 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.097831  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8198  predicted protein  32.95 
 
 
119 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.391811 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2291  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  25.79 
 
 
222 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2283  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  25.79 
 
 
222 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802523  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  30.83 
 
 
193 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  33.33 
 
 
193 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1470  phosphatidylserine synthase  30.67 
 
 
302 aa  43.5  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.02 
 
 
655 aa  43.5  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3186  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.01 
 
 
218 aa  43.5  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.747561  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0791  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30 
 
 
218 aa  43.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0197797 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.44 
 
 
200 aa  43.1  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2141  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.17 
 
 
212 aa  43.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000520042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2092  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.85 
 
 
215 aa  42.7  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2289  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.35 
 
 
235 aa  42.7  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.82 
 
 
205 aa  42.7  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243953 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4301  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.68 
 
 
259 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4279  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.68 
 
 
259 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>