More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1375 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1375  ABC transporter related  100 
 
 
254 aa  493  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0787  ABC transporter related  57.26 
 
 
281 aa  263  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638665  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2105  ABC transporter related  56.81 
 
 
263 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.617159  normal  0.69001 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5204  ABC transporter related protein  53.97 
 
 
270 aa  246  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.213509  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1201  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.37 
 
 
370 aa  244  6.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2530  ABC transporter related  52.52 
 
 
326 aa  242  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  hitchhiker  0.00171141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2718  ABC transporter related  53.75 
 
 
263 aa  240  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0351  ABC transporter related  51.05 
 
 
324 aa  240  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0304446  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50.2 
 
 
375 aa  239  4e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0186  ABC transporter related  46.64 
 
 
256 aa  238  5e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2339  ABC transporter, ATPase subunit  53.23 
 
 
263 aa  238  9e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2252  ABC transporter related  53.85 
 
 
257 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.411417  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3243  ABC transporter related  53.33 
 
 
267 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.211149  normal  0.876591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1635  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.52 
 
 
397 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.839045 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00640  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  50.79 
 
 
386 aa  232  4.0000000000000004e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.253633  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001530  L-proline Glycine Betaine ABC transport ATP-binding protein proV  48.13 
 
 
389 aa  232  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1622  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.94 
 
 
398 aa  232  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3336  ABC transporter related  55.06 
 
 
264 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.314642  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1815  ABC transporter related  52.08 
 
 
326 aa  230  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3565  ABC transporter related  52.21 
 
 
333 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.230396 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0118  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  45.61 
 
 
378 aa  229  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.435278  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2354  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  44.86 
 
 
393 aa  229  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2358  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.26 
 
 
395 aa  229  4e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5180  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATPase subunit  50.84 
 
 
392 aa  229  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4291  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.65 
 
 
351 aa  229  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.603453 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6069  putative glycine betaine/carnitine/choline ABC transporter ATP-binding protein  58.41 
 
 
291 aa  228  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1154  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  50.21 
 
 
318 aa  228  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
375 aa  228  9e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2051  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.22 
 
 
370 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0985  ABC transporter related  48.59 
 
 
321 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.997708  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3117  ABC transporter related  51.64 
 
 
312 aa  227  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0287879  normal  0.0491103 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4151  ABC transporter related protein  51.05 
 
 
389 aa  227  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0577  ABC transporter related  48.77 
 
 
334 aa  226  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000339076  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37600  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  52.28 
 
 
353 aa  227  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1069  ABC transporter related  50.63 
 
 
259 aa  226  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0686791  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3334  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  44.26 
 
 
376 aa  226  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0347475  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0244  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.8 
 
 
381 aa  226  3e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26260  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  52.16 
 
 
384 aa  226  3e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.560056  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3109  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.26 
 
 
389 aa  226  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2475  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.26 
 
 
408 aa  226  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00846223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2523  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.26 
 
 
408 aa  226  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0108992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2804  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.17 
 
 
379 aa  224  7e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000395219  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0802  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  51.39 
 
 
398 aa  224  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2493  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  50.6 
 
 
391 aa  224  9e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167851  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2530  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50.6 
 
 
391 aa  224  9e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2538  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50.6 
 
 
391 aa  224  9e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0404434  normal  0.847899 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2493  glycine betaine/L-proline transport ATP-binding subunit  50.93 
 
 
388 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.957361  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18440  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.3 
 
 
377 aa  223  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00065366  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2992  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  50.46 
 
 
400 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5105  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.5 
 
 
371 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.116998 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2313  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 
315 aa  221  6e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.499344  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2129  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 
240 aa  221  6e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1276  ABC transporter related  47.35 
 
 
321 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2981  ABC transporter related  49.79 
 
 
317 aa  221  8e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3636  ABC transporter related protein  52.92 
 
 
288 aa  221  9e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.90014  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2913  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.84 
 
 
371 aa  221  9e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.362905 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1352  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.52 
 
 
369 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.739461  normal  0.456479 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2245  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.92 
 
 
370 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.4729  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2125  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  46.19 
 
 
315 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2063  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 
315 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.832322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2059  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 
315 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2305  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 
315 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.264442 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2279  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  46.19 
 
 
315 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.987599  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4639  ABC transporter related  50.83 
 
 
312 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.493735  normal  0.263146 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1126  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  45.34 
 
 
367 aa  220  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0622  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  54.47 
 
 
394 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2262  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 
315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1921  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  44.67 
 
 
382 aa  220  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30040  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  52.08 
 
 
282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2668  ABC transporter related  52.17 
 
 
346 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.194568  normal  0.0593639 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2099  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.03 
 
 
321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2031  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.41 
 
 
418 aa  219  3e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.015462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2389  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 
315 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.301455  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4886  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.67 
 
 
382 aa  219  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.887323  normal  0.719773 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4726  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50.83 
 
 
364 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.631244  hitchhiker  0.000147167 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6584  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50.94 
 
 
392 aa  218  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00553818  normal  0.0117418 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6102  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50.94 
 
 
392 aa  218  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0083  ABC transporter related  47.77 
 
 
255 aa  218  7e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3063  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  45.76 
 
 
315 aa  218  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1922  glycine betaine transport ATP-binding protein  47.74 
 
 
252 aa  218  7.999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0268  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  47.74 
 
 
252 aa  218  7.999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1848  choline transport ATP-binding protein opuBA  47.73 
 
 
382 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.607667  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1602  choline transport ATP-binding protein opuBA  47.73 
 
 
382 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.844336  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7553  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  50.94 
 
 
391 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1661  choline transport ATP-binding protein OpuBA  47.73 
 
 
382 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2137  ABC transporter related  49.57 
 
 
312 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0397  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  54.17 
 
 
369 aa  217  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0172  ABC transporter related  52.47 
 
 
310 aa  217  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1593  choline transport ATP-binding protein opuBA  47.73 
 
 
382 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.108629 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1681  choline transport ATP-binding protein opuBA  47.73 
 
 
382 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.413883  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0297  ABC transporter related  50.64 
 
 
312 aa  216  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0909  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.37 
 
 
335 aa  216  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4310  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  44.77 
 
 
385 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.944105  normal  0.26992 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3265  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.55 
 
 
385 aa  216  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0149839 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0745  ABC transporter related  44.68 
 
 
325 aa  215  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0762  ABC transporter related  44.68 
 
 
325 aa  215  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.128148  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2728  ABC transporter related  50.9 
 
 
316 aa  215  5e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4756  ABC transporter related protein  48.93 
 
 
328 aa  214  8e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0913  choline ABC transporter ATP binding protein  48.82 
 
 
305 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3624  ABC transporter related  50.65 
 
 
314 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>