More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1860 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  100 
 
 
259 aa  526  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  73.64 
 
 
265 aa  385  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  72.48 
 
 
264 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  60.63 
 
 
270 aa  326  3e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  62.6 
 
 
255 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  60 
 
 
271 aa  310  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  61.94 
 
 
271 aa  306  2.0000000000000002e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  59.11 
 
 
268 aa  299  3e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  58.17 
 
 
255 aa  296  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  51.95 
 
 
256 aa  287  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2029  ABC transporter related  60.24 
 
 
261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  55.78 
 
 
255 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.56 
 
 
254 aa  279  3e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  52.99 
 
 
255 aa  278  5e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  55.21 
 
 
257 aa  278  7e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  56.75 
 
 
276 aa  276  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  53.39 
 
 
256 aa  275  7e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  55.38 
 
 
255 aa  274  8e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  51.75 
 
 
262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  54.44 
 
 
257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  53.36 
 
 
271 aa  271  6e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  51.17 
 
 
259 aa  271  9e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  55.86 
 
 
260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  50 
 
 
259 aa  269  4e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  53.41 
 
 
263 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  53.41 
 
 
251 aa  268  8e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  53.82 
 
 
258 aa  267  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  50.19 
 
 
261 aa  266  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  54.18 
 
 
254 aa  266  2e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  51.98 
 
 
273 aa  265  4e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  54.18 
 
 
255 aa  265  4e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  53.63 
 
 
271 aa  265  5e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.73 
 
 
256 aa  264  8e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  50.78 
 
 
261 aa  265  8e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  52.19 
 
 
273 aa  264  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  52.19 
 
 
256 aa  264  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  51.19 
 
 
255 aa  264  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  50.2 
 
 
259 aa  263  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  51.95 
 
 
262 aa  263  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  50.2 
 
 
265 aa  262  4e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  54.22 
 
 
293 aa  262  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  50.6 
 
 
270 aa  262  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  50.6 
 
 
270 aa  262  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  53.82 
 
 
283 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  50.6 
 
 
270 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  49.13 
 
 
307 aa  261  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  52.8 
 
 
259 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  52 
 
 
258 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  52 
 
 
257 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  51.38 
 
 
257 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  51.39 
 
 
260 aa  260  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  51.39 
 
 
260 aa  260  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  51.09 
 
 
284 aa  260  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  53.01 
 
 
275 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  53.01 
 
 
275 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  53.01 
 
 
275 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  53.41 
 
 
261 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  54.62 
 
 
280 aa  258  5.0000000000000005e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  48.79 
 
 
302 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  51.2 
 
 
258 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  51.2 
 
 
258 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  51.2 
 
 
258 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.8 
 
 
258 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  50.8 
 
 
256 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  51.76 
 
 
648 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  51.81 
 
 
251 aa  256  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  48.63 
 
 
255 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  50.36 
 
 
284 aa  256  3e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  51.19 
 
 
260 aa  256  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  51.81 
 
 
253 aa  255  5e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  50.59 
 
 
258 aa  255  5e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  50.4 
 
 
258 aa  255  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  50.4 
 
 
256 aa  254  7e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  49.81 
 
 
270 aa  254  7e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1518  ABC transporter related  49.21 
 
 
253 aa  254  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.121559  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  50.37 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  52.21 
 
 
334 aa  253  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  49.8 
 
 
259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  52 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.6 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  50.6 
 
 
258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  51.39 
 
 
250 aa  253  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  49.01 
 
 
259 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  49.8 
 
 
258 aa  252  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2268  ABC transporter related  52.92 
 
 
262 aa  251  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  50.79 
 
 
255 aa  251  8.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  54.4 
 
 
294 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  51.2 
 
 
250 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.2 
 
 
255 aa  250  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0536  ABC transporter related  49.21 
 
 
281 aa  250  2e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.508685  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0365  ABC transporter related  47.64 
 
 
253 aa  250  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000174953  unclonable  0.0000000581692 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  50.8 
 
 
258 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  51 
 
 
256 aa  250  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  50.8 
 
 
257 aa  249  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  50.8 
 
 
258 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>