23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7352 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7352  putative integral membrane protein  100 
 
 		 563 aa  1142    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33063 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10860  predicted membrane protein  38.28 
 
 		 525 aa  266  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2911  hypothetical protein  34.65 
 
 		 494 aa  213  9e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal  0.0308568 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1346  Protein of unknown function DUF2079, membrane  33.33 
 
 		 509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001004 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08120  predicted membrane protein  34.1 
 
 		 455 aa  183  8.000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117111  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5205  membrane protein-like protein  37.18 
 
 		 521 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2573  hypothetical protein  32.24 
 
 		 489 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1053  membrane protein-like protein  31.55 
 
 		 489 aa  156  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150253  hitchhiker  0.00944494 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09720  predicted membrane protein  33.18 
 
 		 481 aa  155  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.523461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5084  hypothetical protein  31.03 
 
 		 506 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.108071  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0363  membrane protein-like  28.93 
 
 		 486 aa  97.4  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115908  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0371  membrane protein-like  34.78 
 
 		 476 aa  77  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2129  hypothetical protein  27.06 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2177  hypothetical protein  26.61 
 
 		 463 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2371  hypothetical protein  23.21 
 
 		 482 aa  61.2  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1915  hypothetical protein  30.14 
 
 		 474 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24123 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1451  Ets- domain containing protein  22.52 
 
 		 463 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0415  hypothetical protein  28.45 
 
 		 498 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0414  hypothetical protein  22.77 
 
 		 520 aa  50.4  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.103112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1477  hypothetical protein  21.85 
 
 		 463 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0545423  normal  0.74916 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4049  hypothetical protein  23.33 
 
 		 541 aa  47.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0753  membrane protein-like protein  25.71 
 
 		 659 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.844921  normal  0.0837231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4411  membrane protein-like protein  25.51 
 
 		 663 aa  44.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0414403  normal  0.531187 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>