131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5882 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5882  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  251  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  64.75 
 
 
130 aa  167  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  60.16 
 
 
131 aa  153  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  59.35 
 
 
125 aa  144  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  56.91 
 
 
125 aa  139  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  57.72 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  58.68 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  54.47 
 
 
335 aa  130  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4252  hypothetical protein  51.56 
 
 
129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  51.28 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0300  hypothetical protein  48.41 
 
 
128 aa  115  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0914  hypothetical protein  47.69 
 
 
150 aa  114  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02690  hypothetical protein  45.38 
 
 
143 aa  110  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475561  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  50 
 
 
119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  45.97 
 
 
127 aa  105  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  46.49 
 
 
119 aa  99.4  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  39.67 
 
 
117 aa  84.3  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.35 
 
 
115 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.35 
 
 
115 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.35 
 
 
115 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  42.61 
 
 
116 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  44.14 
 
 
116 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  40.16 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4667  hypothetical protein  42.86 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0764382  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  42.98 
 
 
116 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  42.98 
 
 
116 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  41.18 
 
 
116 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.88 
 
 
113 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22500  hypothetical protein  36.3 
 
 
135 aa  77  0.00000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.831354  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  42.61 
 
 
115 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0448  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.71 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.25753 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.8 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  40.68 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.03 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  43.75 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  40.65 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1972  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.87 
 
 
125 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.41866  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  41.38 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2836  hypothetical protein  35.97 
 
 
145 aa  72  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936594  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2488  hypothetical protein  36.89 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3598  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.77 
 
 
126 aa  72  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.692223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  38.21 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1240  hypothetical protein  48.84 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4061  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.82 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1922  hypothetical protein  43.18 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0447405  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0555  hypothetical protein  35.04 
 
 
141 aa  70.1  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481999  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19330  hypothetical protein  44.32 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193262  normal  0.367636 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  37.5 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3284  hypothetical protein  36.7 
 
 
234 aa  68.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  40.65 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1040  hypothetical protein  37.21 
 
 
253 aa  67  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  38.94 
 
 
132 aa  67  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  37.1 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  35.16 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  32.35 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2187  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.2 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0642581 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  34.04 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3616  hypothetical protein  39.83 
 
 
245 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3034  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0240001  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  36.8 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0380  hypothetical protein  32.88 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.544251  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2260  hypothetical protein  34.51 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5458  hypothetical protein  29.66 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1463  hypothetical protein  34.78 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2066  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3858  hypothetical protein  34.9 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0149643  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3097  hypothetical protein  34.78 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.52 
 
 
129 aa  63.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0503  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.71 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.012909  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6978  hypothetical protein  35.33 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5068  hypothetical protein  40.91 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.560594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5116  hypothetical protein  39.83 
 
 
240 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1719  hypothetical protein  32.17 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  33.59 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3812  hypothetical protein  31.39 
 
 
144 aa  61.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  37.74 
 
 
127 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.29 
 
 
136 aa  60.5  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1747  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.06 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  34.78 
 
 
113 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25380  hypothetical protein  32.19 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606308  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3282  hypothetical protein  28.17 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.04 
 
 
121 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1976  hypothetical protein  31.88 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7787  hypothetical protein  37.84 
 
 
120 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6380  hypothetical protein  29.66 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862709  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7567  hypothetical protein  32.85 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1038  hypothetical protein  30.17 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5075  hypothetical protein  31.39 
 
 
142 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.899338 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1116  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.61 
 
 
238 aa  57  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1526  hypothetical protein  34.38 
 
 
124 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  0.757551 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0799  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.29 
 
 
395 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2315  hypothetical protein  39.47 
 
 
239 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3966  hypothetical protein  37.72 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2585  hypothetical protein  32.37 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1956  hypothetical protein  30.77 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06250  hypothetical protein  34.68 
 
 
242 aa  54.7  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.938865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8404  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.86 
 
 
118 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97224  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1346  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.84 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.743338  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1410  hypothetical protein  50 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>