More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5465 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_22260  argininosuccinate lyase  73.55 
 
 
500 aa  676    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5465  argininosuccinate lyase  100 
 
 
472 aa  942    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559884  hitchhiker  0.0094933 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2051  argininosuccinate lyase  76.56 
 
 
476 aa  693    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3155  argininosuccinate lyase  72 
 
 
481 aa  656    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14330  argininosuccinate lyase  71.37 
 
 
486 aa  653    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00125191  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5449  argininosuccinate lyase  70.87 
 
 
463 aa  642    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25560  argininosuccinate lyase  72.41 
 
 
465 aa  644    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1503  argininosuccinate lyase  70.76 
 
 
479 aa  670    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1504  argininosuccinate lyase  70.84 
 
 
480 aa  665    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000851302 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2475  argininosuccinate lyase  71.98 
 
 
470 aa  650    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3055  argininosuccinate lyase  73.29 
 
 
472 aa  681    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.097869  normal  0.940422 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1118  argininosuccinate lyase  68.4 
 
 
474 aa  633  1e-180  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.542068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2366  argininosuccinate lyase  70.4 
 
 
476 aa  621  1e-177  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23929  decreased coverage  0.0035121 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1333  argininosuccinate lyase  71.61 
 
 
484 aa  616  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279434  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2396  argininosuccinate lyase  65.09 
 
 
482 aa  607  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10100  argininosuccinate lyase  68.18 
 
 
478 aa  595  1e-169  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4124  argininosuccinate lyase  70.78 
 
 
485 aa  596  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.826501  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1648  argininosuccinate lyase  69.76 
 
 
471 aa  597  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3069  argininosuccinate lyase  64.58 
 
 
470 aa  592  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3168  argininosuccinate lyase  63.85 
 
 
464 aa  585  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0440728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1744  argininosuccinate lyase  63.95 
 
 
511 aa  587  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814038 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21670  argininosuccinate lyase  69.06 
 
 
502 aa  581  1.0000000000000001e-165  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335342  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2834  argininosuccinate lyase  67.9 
 
 
495 aa  582  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2158  argininosuccinate lyase  63.93 
 
 
472 aa  581  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000750754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6070  argininosuccinate lyase  61.06 
 
 
472 aa  574  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566647  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2024  argininosuccinate lyase  61.73 
 
 
482 aa  571  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0998023 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0809  argininosuccinate lyase  64.6 
 
 
490 aa  567  1e-160  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1888  argininosuccinate lyase  62.28 
 
 
487 aa  566  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3022  argininosuccinate lyase  62.63 
 
 
486 aa  566  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11677  argininosuccinate lyase  67.39 
 
 
470 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480026  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3523  argininosuccinate lyase  67.25 
 
 
470 aa  559  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2980  argininosuccinate lyase  67.99 
 
 
470 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0620413 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1256  argininosuccinate lyase  63.18 
 
 
489 aa  550  1e-155  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3307  argininosuccinate lyase  67.77 
 
 
470 aa  550  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2965  argininosuccinate lyase  67.55 
 
 
470 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3009  argininosuccinate lyase  67.55 
 
 
470 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1895  argininosuccinate lyase  62.72 
 
 
487 aa  543  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329316  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0675  argininosuccinate lyase  59.96 
 
 
505 aa  539  9.999999999999999e-153  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2852  argininosuccinate lyase  56.18 
 
 
475 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4987  argininosuccinate lyase  53.86 
 
 
488 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718333 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3518  argininosuccinate lyase  52.93 
 
 
476 aa  486  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6164  argininosuccinate lyase  56.48 
 
 
477 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6457  argininosuccinate lyase  56.26 
 
 
477 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1985  argininosuccinate lyase  54.31 
 
 
480 aa  479  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290932  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  45.96 
 
 
461 aa  432  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  46.88 
 
 
460 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  43.65 
 
 
458 aa  412  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  42.54 
 
 
461 aa  412  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  46.53 
 
 
456 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  44.89 
 
 
458 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  48.43 
 
 
478 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  45.33 
 
 
458 aa  411  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  43.85 
 
 
459 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  46.77 
 
 
458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  46.32 
 
 
462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  45.56 
 
 
458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  48.31 
 
 
459 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  46.33 
 
 
464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  47.28 
 
 
468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  44.67 
 
 
458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  47.69 
 
 
475 aa  404  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  45.98 
 
 
458 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  44.99 
 
 
466 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  47.53 
 
 
465 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  45.9 
 
 
458 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2338  argininosuccinate lyase  48.17 
 
 
464 aa  398  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  47.42 
 
 
464 aa  396  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  45.11 
 
 
459 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  42.58 
 
 
462 aa  395  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  42.79 
 
 
462 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  42.79 
 
 
462 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  47.57 
 
 
467 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  42.58 
 
 
462 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  43.01 
 
 
463 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  44.17 
 
 
461 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  46.31 
 
 
457 aa  392  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  43.04 
 
 
462 aa  393  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  46.88 
 
 
463 aa  394  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  47.77 
 
 
455 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  46.26 
 
 
459 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0841  argininosuccinate lyase  46.79 
 
 
458 aa  392  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.330511  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  42.58 
 
 
462 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  47.05 
 
 
478 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  44.64 
 
 
476 aa  392  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  42.79 
 
 
463 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  46.97 
 
 
457 aa  393  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  43.61 
 
 
441 aa  394  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  42.58 
 
 
462 aa  395  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  47.12 
 
 
463 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02920  argininosuccinate lyase  44.52 
 
 
464 aa  391  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  42.36 
 
 
462 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  45.01 
 
 
467 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  42.58 
 
 
462 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  46.67 
 
 
489 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  46.19 
 
 
460 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  47.12 
 
 
467 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0522  argininosuccinate lyase  46.02 
 
 
467 aa  389  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  46.42 
 
 
462 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  44.69 
 
 
469 aa  386  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  46.99 
 
 
463 aa  387  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>