More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4981 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4981  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 253 aa  512  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00303517  hitchhiker  0.00602163 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3452  transcriptional regulator, LacI family  50.7 
 
 		 359 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3390  hypothetical protein  50.23 
 
 		 346 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.305361  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3098  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  48.15 
 
 		 352 aa  168  6e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3382  transcriptional regulator, LacI family  44.29 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.22035  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2515  transcriptional regulator, LacI family  43.46 
 
 		 357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185479  hitchhiker  0.0043298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1295  transcriptional regulator, LacI family  40.48 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2723  transcriptional regulator, LacI family  45.61 
 
 		 347 aa  150  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.858464 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.76 
 
 		 330 aa  96.3  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  29.28 
 
 		 386 aa  90.9  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  31.3 
 
 		 338 aa  90.5  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  28.91 
 
 		 339 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  28.97 
 
 		 341 aa  89.4  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2822  LacI family transcription regulator  31.75 
 
 		 352 aa  89  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531617  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2799  transcriptional regulator, LacI family  35.05 
 
 		 340 aa  88.6  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  30.84 
 
 		 337 aa  87.8  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1187  LacI family regulatory protein  31.28 
 
 		 384 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  29.3 
 
 		 337 aa  85.9  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  30.99 
 
 		 339 aa  85.1  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  31.65 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  32.41 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1769  LacI family transcription regulator  28.57 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00410  transcriptional regulator, LacI family  26.92 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  32.41 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2503  transcriptional regulator, LacI family  31.96 
 
 		 337 aa  82.4  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  29.28 
 
 		 341 aa  82.4  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2782  transcriptional regulator, LacI family  31.77 
 
 		 338 aa  82  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  34.43 
 
 		 338 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2646  transcriptional regulator, LacI family  32.23 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1193  transcriptional regulator, LacI family  31.03 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.502548  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  26.18 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2557  LacI family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000811694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0420  LacI family transcription regulator  28.05 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130171  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  29.22 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  33.51 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3367  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.02 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00871192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1242  LacI family transcription regulator  29.07 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  33.02 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0881  transcriptional regulator, LacI family  26.99 
 
 		 336 aa  79  0.00000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00312464  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  26.42 
 
 		 341 aa  79  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0416  LacI family transcription regulator  28.05 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  28.12 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3594  transcriptional regulator, LacI family  32.72 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  29.49 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0226  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.84 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.586057  normal  0.327461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3620  transcriptional regulator, LacI family  31.02 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4283  LacI family transcription regulator  29.77 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1273  transcriptional regulator, LacI family  30.1 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0892  LacI family transcription regulator  32.16 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00803151  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.52 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  29.95 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1332  transcriptional regulator, LacI family  30.92 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3383  LacI family transcription regulator  30.05 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6588  LacI family transcription regulator  31.4 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  27.19 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1093  LacI family transcription regulator  29.02 
 
 		 351 aa  75.9  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137161  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1655  LacI family transcription regulator  31.82 
 
 		 366 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.677065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1956  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 		 348 aa  75.9  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000378532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  28.97 
 
 		 346 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3061  transcriptional regulator, LacI family  29.13 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  27.23 
 
 		 342 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  29.91 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  29.52 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1820  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.67 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  28.16 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0597  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.10797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1438  transcriptional regulator, LacI family  25.64 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1772  transcriptional regulator, LacI family protein  31.02 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.297999  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4842  trehalose repressor  28.7 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38350  transcriptional regulator  33.8 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  27.88 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1828  DNA-binding transcriptional repressor MalI  31.67 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674851 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  28.97 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2022  transcriptional regulator, LacI family  29.68 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.287863  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2010  DNA-binding transcriptional repressor MalI  29.68 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.708853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6733  transcriptional regulator, LacI family  31.8 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1579  DNA-binding transcriptional repressor MalI  29.68 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  32.57 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1618  DNA-binding transcriptional repressor MalI  27.52 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.671811  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  27.4 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4837  trehalose repressor  26.92 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0058  LacI family transcription regulator  31.1 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1828  DNA-binding transcriptional repressor MalI  29.68 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  32.86 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1808  DNA-binding transcriptional repressor MalI  29.68 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4803  trehalose repressor  26.92 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.94717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1971  LacI family transcription regulator  29.05 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.137395  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1695  DNA-binding transcriptional repressor MalI  29.68 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4858  trehalose repressor  26.92 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0591749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  32.69 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  25.12 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2332  DNA-binding transcriptional repressor MalI  29.68 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01589  DNA-binding transcriptional repressor  29.68 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.784776  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2326  transcriptional regulator, LacI family  26.07 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000810119  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5763  trehalose repressor  27.62 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.693149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4495  trehalose repressor  27.62 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01579  hypothetical protein  29.68 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2305  LacI family transcription regulator  26.07 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00729932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4722  trehalose repressor  27.62 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.557711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>