31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3822 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3822  Xylan 1,4-beta-xylosidase  100 
 
 		 518 aa  1046    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163293  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1978  Xylan 1,4-beta-xylosidase  67.27 
 
 		 512 aa  662    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727016  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33180  beta-xylosidase  66.34 
 
 		 520 aa  690    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0737494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2997  Xylan 1,4-beta-xylosidase  63.29 
 
 		 514 aa  633  1e-180  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2663  Xylan 1,4-beta-xylosidase  59.21 
 
 		 510 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0370  Xylan 1,4-beta-xylosidase  59.21 
 
 		 509 aa  601  1.0000000000000001e-171  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.809464  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2398  Xylan 1,4-beta-xylosidase  55.23 
 
 		 519 aa  573  1.0000000000000001e-162  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2705  glycoside hydrolase family 39  49.18 
 
 		 503 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1259  glycoside hydrolase family 39  44.85 
 
 		 501 aa  478  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0184  Xylan 1,4-beta-xylosidase  45 
 
 		 501 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0776  glycoside hydrolase family protein  34.51 
 
 		 523 aa  312  7.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1297  glycoside hydrolase family 39  34.76 
 
 		 523 aa  295  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0187  glycoside hydrolase family 39  38.36 
 
 		 388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3134  glycoside hydrolase family protein  36.02 
 
 		 477 aa  265  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3132  xylan 1,4-beta-xylosidase  33.54 
 
 		 530 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0820  Xylan 1,4-beta-xylosidase  34.46 
 
 		 550 aa  258  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0114  glycoside hydrolase family 39  33.02 
 
 		 544 aa  250  4e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.747279  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7193  glycoside hydrolase family 39  29.52 
 
 		 548 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0114061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0170  Xylan 1,4-beta-xylosidase  35.74 
 
 		 611 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268815  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1539  glycoside hydrolase family 39  29.03 
 
 		 578 aa  140  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3952  glycoside hydrolase family 39  23.34 
 
 		 542 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5268  glycoside hydrolase family 39  23.81 
 
 		 561 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3934  glycoside hydrolase family 39  23.21 
 
 		 576 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5150  glycoside hydrolase family 39  23.71 
 
 		 566 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964315  hitchhiker  0.00110099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1416  glycoside hydrolase family 39  21.86 
 
 		 557 aa  97.1  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1362  glycoside hydrolase family protein  24.5 
 
 		 557 aa  86.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0695  glycoside hydrolase family protein  24.02 
 
 		 466 aa  73.9  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.251112  normal  0.0214921 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  33.12 
 
 		 864 aa  68.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1432  AraC family transcriptional regulator  19.53 
 
 		 686 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00438113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1698  AraC family transcriptional regulator  19.58 
 
 		 686 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000348751  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  26.55 
 
 		 415 aa  43.9  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>