77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3623 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3623  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  537  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.337914  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5053  hypothetical protein  66.41 
 
 
266 aa  357  7e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1606  hypothetical protein  44.57 
 
 
287 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.379267  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2039  hypothetical protein  43.8 
 
 
282 aa  206  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0439547  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7128  hypothetical protein  42.58 
 
 
257 aa  202  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314077  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2475  hypothetical protein  42.02 
 
 
269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.0111265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0780  hypothetical protein  33.71 
 
 
266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3207  hypothetical protein  44.51 
 
 
166 aa  152  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000208093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4309  hypothetical protein  34.32 
 
 
261 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2567  hypothetical protein  32.69 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4230  hypothetical protein  36.64 
 
 
253 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101232  normal  0.122542 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1349  hypothetical protein  33.07 
 
 
258 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2500  hypothetical protein  30.53 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475104  normal  0.0433406 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1741  hypothetical protein  31.56 
 
 
258 aa  132  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.15585  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5292  hypothetical protein  29.28 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2666  hypothetical protein  30.35 
 
 
256 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357392  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7484  putative arylesterase-like protein  28.52 
 
 
229 aa  95.5  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2148  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 
276 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0578  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3379  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.397279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3112  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0698  alpha/beta hydrolase fold protein  25.46 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20839  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1073  Alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0642  putative acetone-cyanohydrin lyase  26.02 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4728  arylesterase-related protein  27.92 
 
 
524 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0151687 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1591  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 
297 aa  58.5  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1657  alpha/beta hydrolase fold  22.47 
 
 
290 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2303  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 
263 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000377537  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4137  Alpha/beta hydrolase fold  21.93 
 
 
268 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 
275 aa  53.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0559  Alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
267 aa  53.5  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1914  Alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 
268 aa  52.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3502  hypothetical protein  27.8 
 
 
264 aa  52.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3272  hypothetical protein  26.34 
 
 
278 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206237  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0740  alpha/beta hydrolase fold protein  25.63 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3618  alpha/beta hydrolase fold protein  27.48 
 
 
296 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1944  proline iminopeptidase, putative  24.7 
 
 
299 aa  48.9  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.967499  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2192  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000941808  hitchhiker  0.00021747 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 
348 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  33.33 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  32.93 
 
 
271 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2063  esterase, putative  22.49 
 
 
291 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.12276  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  33.33 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  33.33 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  33.33 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0119  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4729  alpha/beta fold family hydrolase  24.14 
 
 
249 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0133586 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 
423 aa  47  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  32.93 
 
 
271 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  32.93 
 
 
271 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  23.18 
 
 
331 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  32.93 
 
 
271 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  23.58 
 
 
263 aa  45.4  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43025  predicted protein  27.93 
 
 
386 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0408918  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2728  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
271 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190242  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1851  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 
332 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240679 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3950  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 
295 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0198056  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  33.33 
 
 
271 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  24.49 
 
 
280 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1269  alpha/beta hydrolase fold  25.66 
 
 
348 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331641  normal  0.0800465 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  26.05 
 
 
332 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  32.76 
 
 
291 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  32.76 
 
 
291 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  32.76 
 
 
291 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3673  signal peptide protein  28.05 
 
 
255 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  32.76 
 
 
291 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  31.25 
 
 
291 aa  42.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  29.21 
 
 
277 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 
268 aa  42.7  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  25.45 
 
 
330 aa  42.7  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3767  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.99 
 
 
680 aa  42.4  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  31.25 
 
 
286 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 
421 aa  42  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05312  cob(I)alamin adenosyltransferase  27.52 
 
 
205 aa  42  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  31.94 
 
 
275 aa  42  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
332 aa  42  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1824  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
332 aa  42  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>