43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_5004 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  100 
 
 		 436 aa  883    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  26.09 
 
 		 435 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  26.67 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0024  O-antigen polymerase  27.2 
 
 		 456 aa  80.1  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3885  O-antigen polymerase  34.57 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.722344  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  26.69 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  25.12 
 
 		 498 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  25.1 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  25.31 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3061  O-antigen polymerase  28.03 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  25 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0679  O-antigen polymerase  30.77 
 
 		 437 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  30.88 
 
 		 459 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  26.33 
 
 		 436 aa  55.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3077  O-antigen polymerase  26.03 
 
 		 504 aa  53.9  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  23.94 
 
 		 454 aa  54.3  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  27.03 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  23.01 
 
 		 501 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  23.3 
 
 		 474 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  27.03 
 
 		 404 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  27.03 
 
 		 404 aa  50.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  27.03 
 
 		 404 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  26.15 
 
 		 671 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  27.03 
 
 		 404 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3774  O-antigen polymerase  34.69 
 
 		 439 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1497  O-antigen polymerase  28.23 
 
 		 672 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  30.29 
 
 		 467 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2363  hypothetical protein  28.97 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  31.58 
 
 		 540 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2608  O-antigen polymerase  27.57 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  27.03 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  26.14 
 
 		 500 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0300  O-antigen polymerase  26.18 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  26.04 
 
 		 500 aa  47.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  23.9 
 
 		 437 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2821  O-antigen polymerase  22.84 
 
 		 434 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0314  O-antigen polymerase  29.44 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  28.22 
 
 		 446 aa  47  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1639  hypothetical protein  24.39 
 
 		 447 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  25.82 
 
 		 773 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3268  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  21.15 
 
 		 452 aa  44.3  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0446  O-antigen polymerase  31.25 
 
 		 1070 aa  44.3  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2886  O-antigen ligase-like  29.53 
 
 		 414 aa  43.5  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000199013  normal  0.062273 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>