39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1840 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2126  TPR domain-containing protein  99.18 
 
 		 365 aa  723    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000503657  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1840  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 365 aa  725    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00013398  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1333  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.79 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  26.14 
 
 		 1266 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 568 aa  54.7  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 412 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1957  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.02 
 
 		 375 aa  52.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  31.25 
 
 		 573 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1641  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.54 
 
 		 292 aa  50.1  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3645  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 266 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 927 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  28.32 
 
 		 573 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 581 aa  47  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  32.52 
 
 		 733 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 949 aa  46.6  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.81 
 
 		 566 aa  46.6  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 804 aa  46.2  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  28.42 
 
 		 725 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  25.31 
 
 		 2145 aa  44.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0213  TPR domain-containing protein  29.36 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000856086  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 		 468 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 643 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.38 
 
 		 572 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.62 
 
 		 1034 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2989  diguanylate cyclase  28.67 
 
 		 628 aa  43.9  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.542118  normal  0.107456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  24.14 
 
 		 782 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  27.78 
 
 		 745 aa  43.9  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 565 aa  43.9  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1229  hypothetical protein  35.64 
 
 		 237 aa  43.5  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000200658  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 465 aa  43.9  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0354  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 684 aa  43.5  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.431996  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 356 aa  43.5  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  35 
 
 		 594 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 573 aa  43.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  34.62 
 
 		 208 aa  43.1  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 638 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1005 aa  42.7  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0402  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 596 aa  42.7  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  28.87 
 
 		 566 aa  42.7  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>