More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1353 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1562  NlpC/P60 family protein  90.66 
 
 		 553 aa  909    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000246871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1353  NLP/P60 family protein, enterotoxin  100 
 
 		 549 aa  1098    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.185421  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1439  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  38.76 
 
 		 1049 aa  188  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00896108  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1245  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  36.19 
 
 		 969 aa  179  8e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0232944  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  31.73 
 
 		 582 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  31.81 
 
 		 582 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.25 
 
 		 580 aa  159  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  30.67 
 
 		 579 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  31.59 
 
 		 582 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  35.47 
 
 		 564 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  33.54 
 
 		 564 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  33.54 
 
 		 564 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  33.54 
 
 		 564 aa  152  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  31.25 
 
 		 577 aa  152  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  33.23 
 
 		 564 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  30.04 
 
 		 578 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  29.2 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  30.12 
 
 		 575 aa  141  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  34.92 
 
 		 598 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.94 
 
 		 553 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  28.29 
 
 		 413 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  28.54 
 
 		 420 aa  126  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  28.29 
 
 		 420 aa  124  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  28.29 
 
 		 420 aa  124  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  27.98 
 
 		 426 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  28.05 
 
 		 420 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  28.05 
 
 		 420 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  27.98 
 
 		 426 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0203  enterotoxin, putative  27.31 
 
 		 603 aa  118  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1821  NLP/P60 protein  28.37 
 
 		 430 aa  118  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0263  peptidase, M23/M37 family  27.31 
 
 		 603 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  29.78 
 
 		 432 aa  107  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.23 
 
 		 1776 aa  103  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  26.48 
 
 		 424 aa  103  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  27.18 
 
 		 341 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  29.03 
 
 		 319 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  38.3 
 
 		 235 aa  96.3  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  31.25 
 
 		 388 aa  92.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  48.35 
 
 		 293 aa  89.7  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  28.51 
 
 		 296 aa  87.4  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  35.81 
 
 		 333 aa  87  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  49.4 
 
 		 306 aa  86.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0577  NLP/P60 protein  27.06 
 
 		 242 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  33.76 
 
 		 227 aa  85.9  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  25.35 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  31.98 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  52.7 
 
 		 340 aa  82.8  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  33.56 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  44.16 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  34.78 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5534  NLP/P60 protein  47.37 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  34.56 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  34.06 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  51.39 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  30.77 
 
 		 452 aa  80.1  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  29.7 
 
 		 370 aa  80.1  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  32.67 
 
 		 337 aa  79.7  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  44.3 
 
 		 393 aa  79.7  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  44.32 
 
 		 337 aa  80.1  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  48.61 
 
 		 281 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  42.53 
 
 		 350 aa  79.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.43 
 
 		 1284 aa  79  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  30.41 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.9 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  32.06 
 
 		 524 aa  78.6  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5540  NLP/P60 protein  46.32 
 
 		 473 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal  0.121534 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  34.88 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  44.83 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  34.42 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  27.59 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  39.29 
 
 		 1048 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  42.22 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  32.32 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  31.72 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  43.68 
 
 		 378 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.05 
 
 		 321 aa  76.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  31.62 
 
 		 400 aa  76.6  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0435  NLP/P60 protein  27.23 
 
 		 232 aa  76.6  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  26.91 
 
 		 298 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  51.56 
 
 		 348 aa  76.3  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5763  NLP/P60 protein  43.18 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0801  peptidase, M23/M37 family  32.91 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70657e-48 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  33.09 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  33.09 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0006  bacteriocin  31.17 
 
 		 1067 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0794  M24/M37 family peptidase  29.54 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000011526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  32.91 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.2041900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  37.01 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  49.28 
 
 		 476 aa  74.7  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0876  peptidase, M23/M37 family  29.54 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  47.62 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  32.3 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0610  peptidase M23B  30.99 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000136568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0690  M24/M37 family peptidase  32.91 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000234103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0724  M23/37 family peptidase  32.91 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000754893  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3345  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.33 
 
 		 448 aa  73.9  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  39.08 
 
 		 363 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  31.61 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  42.53 
 
 		 372 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  21.95 
 
 		 860 aa  73.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>