70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene COXBURSA331_A2184 on replicon NC_010117
Organism: Coxiella burnetii RSA 331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009727  CBUD_0142  cold shock protein  99.44 
 
 		 183 aa  367  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2184  ribosomal subunit interface protein domain/'cold-shock' DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 178 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0149492  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0821  putative sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  50 
 
 		 181 aa  185  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0905  putative sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  47.75 
 
 		 195 aa  177  5.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.489949  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2438  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  46.41 
 
 		 182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1447  SSU ribosomal protein S30P / sigma 54 modulation protein  45.71 
 
 		 189 aa  164  9e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12501  normal  0.434118 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3849  putative sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  44.25 
 
 		 196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4090  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.94 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.25862 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2991  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.89 
 
 		 186 aa  155  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0247  Cold-shock protein DNA-binding  42.7 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2701  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.26 
 
 		 189 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.282479  normal  0.669398 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4049  cold-shock protein, DNA-binding  39.31 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000700497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49880  Cold-shock domain-containing protein  38.04 
 
 		 189 aa  135  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0458  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  37.22 
 
 		 197 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1214  hypothetical protein  40.24 
 
 		 190 aa  134  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1208  hypothetical protein  39.64 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2405  cold-shock DNA-binding domain protein  35.56 
 
 		 195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0142448  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1457  DNA-binding cold-shock protein  35.2 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.616969  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2492  Cold-shock protein DNA-binding  34.44 
 
 		 195 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1031  ribosomal subunit interface protein, putative  50.44 
 
 		 119 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248083  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4848  cold-shock DNA-binding domain protein  35.68 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00619999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0545  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  35.2 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2770  cold-shock protein, DNA-binding  29.95 
 
 		 194 aa  90.9  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2358  ribosomal subunit interface protein  38.68 
 
 		 109 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3352  putative ribosomal subunit interface protein YfiA  38.68 
 
 		 109 aa  85.5  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0772066  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1460  ribosomal subunit interface protein YfiA, putative  38.68 
 
 		 109 aa  85.5  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.105702  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1952  ribosomal subunit interface protein  38.68 
 
 		 109 aa  85.5  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2475  RedA  38.68 
 
 		 160 aa  85.1  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2317  ribosomal subunit interface protein  38.54 
 
 		 160 aa  84.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.127274  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2124  sigma 54 modulation protein, putative  37.76 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1599  sigma 54 modulation protein, putative  34.65 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000251677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1677  cold-shock protein DNA-binding  28.88 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.220197 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2828  cold shock domain-contain protein  45.33 
 
 		 90 aa  67.4  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0073  ribosomal subunit interface protein, putative  34.91 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1221  cold-shock protein DNA-binding  26.37 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.34226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4411  ribosomal subunit interface protein  30.21 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.895647 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2274  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  26.61 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4544  ribosomal subunit interface protein  30.21 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00451099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4123  sigma 54 modulation protein / SSU ribosomal protein S30P  32 
 
 		 119 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0325  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  31.03 
 
 		 119 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0595  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  32 
 
 		 118 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447662  normal  0.0133792 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0523  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  29.31 
 
 		 119 aa  44.7  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3245  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  32.97 
 
 		 105 aa  44.3  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000561012  hitchhiker  0.0000449546 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2852  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  29.31 
 
 		 119 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0123  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  30.21 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.715825  hitchhiker  0.0000155175 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2710  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  29.31 
 
 		 119 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0445901 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2803  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  29.31 
 
 		 119 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1264  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  32 
 
 		 120 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303296 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6122  sigma 54 modulation protein / SSU ribosomal protein S30P  29.31 
 
 		 119 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.604598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2178  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  29.31 
 
 		 119 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2792  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  29.31 
 
 		 119 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0485  ribosomal subunit interface protein  30 
 
 		 119 aa  42.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4148  SSU ribosomal protein S30P / sigma 54 modulation protein  27.17 
 
 		 108 aa  42  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4529  hypothetical protein  27.62 
 
 		 113 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.469544  normal  0.0452511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4396  hypothetical protein  27.62 
 
 		 113 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.505361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0764  putative PTS system, EIIA component  29 
 
 		 134 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1513  ribosomal subunit interface protein  29 
 
 		 119 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2941  ribosomal subunit interface protein  29 
 
 		 119 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0596  ribosomal subunit interface protein  29 
 
 		 119 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0580  ribosomal subunit interface protein  29 
 
 		 119 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0077  ribosomal subunit interface protein  29 
 
 		 119 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0302  30S ribosomal protein S30P / sigma 54 modulation protein  28.89 
 
 		 117 aa  41.2  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.227103  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3109  ribosomal subunit interface protein  29 
 
 		 119 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.146096  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1037  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  27.59 
 
 		 172 aa  41.2  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0750  sigma54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  26.09 
 
 		 96 aa  41.2  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2716  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  28.26 
 
 		 102 aa  41.2  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2912  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  30.69 
 
 		 117 aa  40.8  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1384  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  27.47 
 
 		 186 aa  40.8  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000667858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0262  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  27.78 
 
 		 117 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0289  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  27.78 
 
 		 117 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>