65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0142 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009727  CBUD_0142  cold shock protein  100 
 
 		 183 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2184  ribosomal subunit interface protein domain/'cold-shock' DNA-binding domain-containing protein  99.44 
 
 		 178 aa  367  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0149492  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0821  putative sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  50.57 
 
 		 181 aa  186  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0905  putative sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  48.31 
 
 		 195 aa  179  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.489949  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2438  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  46.96 
 
 		 182 aa  167  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1447  SSU ribosomal protein S30P / sigma 54 modulation protein  46.29 
 
 		 189 aa  164  5e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12501  normal  0.434118 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3849  putative sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  44.83 
 
 		 196 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4090  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.51 
 
 		 188 aa  160  8.000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.25862 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2991  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0247  Cold-shock protein DNA-binding  43.26 
 
 		 192 aa  151  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2701  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.82 
 
 		 189 aa  148  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.282479  normal  0.669398 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4049  cold-shock protein, DNA-binding  39.31 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000700497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49880  Cold-shock domain-containing protein  38.59 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335771  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1214  hypothetical protein  40.83 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0458  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  37.22 
 
 		 197 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1208  hypothetical protein  40.24 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2405  cold-shock DNA-binding domain protein  35.56 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0142448  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1457  DNA-binding cold-shock protein  35.2 
 
 		 194 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.616969  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2492  Cold-shock protein DNA-binding  34.44 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1031  ribosomal subunit interface protein, putative  51.33 
 
 		 119 aa  115  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248083  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4848  cold-shock DNA-binding domain protein  36.22 
 
 		 207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00619999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0545  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  35.75 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2770  cold-shock protein, DNA-binding  30.48 
 
 		 194 aa  92.8  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1952  ribosomal subunit interface protein  38.61 
 
 		 109 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2358  ribosomal subunit interface protein  38.61 
 
 		 109 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1460  ribosomal subunit interface protein YfiA, putative  38.61 
 
 		 109 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.105702  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3352  putative ribosomal subunit interface protein YfiA  38.61 
 
 		 109 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0772066  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2317  ribosomal subunit interface protein  38.78 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.127274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2475  RedA  38.89 
 
 		 160 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2124  sigma 54 modulation protein, putative  38 
 
 		 212 aa  84.7  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1599  sigma 54 modulation protein, putative  35.64 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000251677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1677  cold-shock protein DNA-binding  28.88 
 
 		 209 aa  67.8  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.220197 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0073  ribosomal subunit interface protein, putative  35.85 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2828  cold shock domain-contain protein  45.33 
 
 		 90 aa  67  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1221  cold-shock protein DNA-binding  26.37 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.34226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4411  ribosomal subunit interface protein  30.21 
 
 		 105 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.895647 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4544  ribosomal subunit interface protein  30.21 
 
 		 105 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00451099 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2274  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  26.61 
 
 		 109 aa  60.5  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4123  sigma 54 modulation protein / SSU ribosomal protein S30P  32 
 
 		 119 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3245  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  34.07 
 
 		 105 aa  45.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000561012  hitchhiker  0.0000449546 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0325  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  31.03 
 
 		 119 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0595  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  32 
 
 		 118 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447662  normal  0.0133792 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0123  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  30.21 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.715825  hitchhiker  0.0000155175 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6122  sigma 54 modulation protein / SSU ribosomal protein S30P  29.31 
 
 		 119 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.604598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2710  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  29.31 
 
 		 119 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0445901 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2803  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  29.31 
 
 		 119 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1264  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  30 
 
 		 120 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303296 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2852  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  29.31 
 
 		 119 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0523  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  29.31 
 
 		 119 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2792  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  29.31 
 
 		 119 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2178  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  29.31 
 
 		 119 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4396  hypothetical protein  27.62 
 
 		 113 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.505361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4529  hypothetical protein  27.62 
 
 		 113 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.469544  normal  0.0452511 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0485  ribosomal subunit interface protein  30 
 
 		 119 aa  42  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0764  putative PTS system, EIIA component  29.91 
 
 		 134 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4148  SSU ribosomal protein S30P / sigma 54 modulation protein  27.17 
 
 		 108 aa  41.6  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2794  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  33.33 
 
 		 108 aa  41.2  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.56309  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0580  ribosomal subunit interface protein  29 
 
 		 119 aa  41.2  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3109  ribosomal subunit interface protein  29 
 
 		 119 aa  41.2  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.146096  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2716  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  28.26 
 
 		 102 aa  41.2  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0077  ribosomal subunit interface protein  29 
 
 		 119 aa  41.2  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2941  ribosomal subunit interface protein  29 
 
 		 119 aa  41.2  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1513  ribosomal subunit interface protein  29 
 
 		 119 aa  41.2  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0596  ribosomal subunit interface protein  29 
 
 		 119 aa  41.2  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2912  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  30.69 
 
 		 117 aa  40.8  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>