41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1214 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl1214  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  391  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1208  hypothetical protein  99.47 
 
 		 190 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0247  Cold-shock protein DNA-binding  60.22 
 
 		 192 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2438  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  54.1 
 
 		 182 aa  199  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2701  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.89 
 
 		 189 aa  171  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.282479  normal  0.669398 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4090  cold-shock DNA-binding protein family protein  42.7 
 
 		 188 aa  165  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.25862 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49880  Cold-shock domain-containing protein  41.58 
 
 		 189 aa  164  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335771  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2991  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.58 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0905  putative sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  40.43 
 
 		 195 aa  147  9e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.489949  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1447  SSU ribosomal protein S30P / sigma 54 modulation protein  39.56 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12501  normal  0.434118 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0142  cold shock protein  40.83 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2184  ribosomal subunit interface protein domain/'cold-shock' DNA-binding domain-containing protein  40.24 
 
 		 178 aa  134  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0149492  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1031  ribosomal subunit interface protein, putative  53.51 
 
 		 119 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248083  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0821  putative sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  39.76 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0458  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  35.91 
 
 		 197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4049  cold-shock protein, DNA-binding  35.71 
 
 		 176 aa  107  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000700497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2405  cold-shock DNA-binding domain protein  33.88 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0142448  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2492  Cold-shock protein DNA-binding  33.7 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3849  putative sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  34.94 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1457  DNA-binding cold-shock protein  34.25 
 
 		 194 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.616969  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0545  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  36.02 
 
 		 187 aa  99.8  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4848  cold-shock DNA-binding domain protein  32.43 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00619999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1221  cold-shock protein DNA-binding  31.06 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.34226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2770  cold-shock protein, DNA-binding  32.4 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0073  ribosomal subunit interface protein, putative  38.14 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2358  ribosomal subunit interface protein  38.39 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3352  putative ribosomal subunit interface protein YfiA  38.39 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0772066  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1952  ribosomal subunit interface protein  38.39 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1460  ribosomal subunit interface protein YfiA, putative  38.39 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.105702  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2475  RedA  38.39 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2317  ribosomal subunit interface protein  38.39 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.127274  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2274  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  33.03 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2124  sigma 54 modulation protein, putative  38.74 
 
 		 212 aa  72  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1677  cold-shock protein DNA-binding  26.06 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.220197 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1599  sigma 54 modulation protein, putative  35.64 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000251677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2828  cold shock domain-contain protein  39.13 
 
 		 90 aa  60.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4411  ribosomal subunit interface protein  33.02 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.895647 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4544  ribosomal subunit interface protein  33.02 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00451099 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1457  hypothetical protein  33.75 
 
 		 78 aa  46.2  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.897377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4396  hypothetical protein  31.07 
 
 		 113 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.505361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4529  hypothetical protein  31.07 
 
 		 113 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.469544  normal  0.0452511 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>