130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_49880 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_49880  Cold-shock domain-containing protein  100 
 
 		 189 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335771  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2701  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  49.21 
 
 		 189 aa  202  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.282479  normal  0.669398 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2438  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  52.78 
 
 		 182 aa  197  7e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4090  cold-shock DNA-binding protein family protein  47.62 
 
 		 188 aa  187  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.25862 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2991  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.57 
 
 		 186 aa  178  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0458  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.05 
 
 		 197 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0247  Cold-shock protein DNA-binding  45.41 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1214  hypothetical protein  41.58 
 
 		 190 aa  164  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1208  hypothetical protein  41.05 
 
 		 190 aa  161  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0905  putative sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  39.67 
 
 		 195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.489949  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1447  SSU ribosomal protein S30P / sigma 54 modulation protein  40 
 
 		 189 aa  141  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12501  normal  0.434118 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0545  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.78 
 
 		 187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1457  DNA-binding cold-shock protein  44.2 
 
 		 194 aa  138  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.616969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2405  cold-shock DNA-binding domain protein  42.22 
 
 		 195 aa  138  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0142448  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0142  cold shock protein  38.59 
 
 		 183 aa  137  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2492  Cold-shock protein DNA-binding  41.67 
 
 		 195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2184  ribosomal subunit interface protein domain/'cold-shock' DNA-binding domain-containing protein  38.04 
 
 		 178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0149492  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4049  cold-shock protein, DNA-binding  39.66 
 
 		 176 aa  128  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000700497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3849  putative sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  40.22 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0821  putative sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  37.99 
 
 		 181 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1031  ribosomal subunit interface protein, putative  47.86 
 
 		 119 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248083  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2770  cold-shock protein, DNA-binding  35.9 
 
 		 194 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2828  cold shock domain-contain protein  54.95 
 
 		 90 aa  101  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4848  cold-shock DNA-binding domain protein  32.24 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00619999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1221  cold-shock protein DNA-binding  29.67 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.34226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0073  ribosomal subunit interface protein, putative  38.14 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1677  cold-shock protein DNA-binding  28.96 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.220197 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2274  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  35.24 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1460  ribosomal subunit interface protein YfiA, putative  33.33 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.105702  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1952  ribosomal subunit interface protein  33.33 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3352  putative ribosomal subunit interface protein YfiA  33.33 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0772066  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2358  ribosomal subunit interface protein  33.33 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2475  RedA  33.33 
 
 		 160 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2317  ribosomal subunit interface protein  33.33 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.127274  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1599  sigma 54 modulation protein, putative  27.1 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000251677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4544  ribosomal subunit interface protein  31.19 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00451099 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4411  ribosomal subunit interface protein  31.19 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.895647 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2124  sigma 54 modulation protein, putative  30.84 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2944  cold shock protein CspA  36.67 
 
 		 67 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000190383  hitchhiker  0.00000000328218 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2387  cold shock protein CspA  36.67 
 
 		 67 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343372  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2236  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  36.67 
 
 		 67 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000182228  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1777  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  35 
 
 		 67 aa  48.1  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0792  cold shock protein  34.92 
 
 		 69 aa  47.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000000912185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3553  cold shock protein CspB  33.33 
 
 		 66 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000960966  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3333  cold shock protein CspB  33.33 
 
 		 66 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000000736097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3297  cold shock protein  33.33 
 
 		 66 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.0310600000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  33.33 
 
 		 66 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000222014  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1670  cold shock protein CspB  33.33 
 
 		 66 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000143673  decreased coverage  2.4479999999999998e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  33.33 
 
 		 66 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632893  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3548  cold shock protein CspB  33.33 
 
 		 66 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.8624399999999996e-45 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3647  cold shock protein CspB  33.33 
 
 		 66 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3557  cold shock protein CspB  33.33 
 
 		 66 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3242  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 66 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000134861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0567  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  37.1 
 
 		 67 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000164882  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0733  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  36.07 
 
 		 67 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000585148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2200  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  36.07 
 
 		 66 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000689795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  33.87 
 
 		 66 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1449  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  36.07 
 
 		 66 aa  45.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000494956  unclonable  0.00000584596 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0855  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 67 aa  45.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000708983  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0928  cold-shock DNA-binding domain protein  31.67 
 
 		 65 aa  45.4  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4562  cold-shock DNA-binding protein family protein  40 
 
 		 136 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0340056 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5045  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  39.34 
 
 		 136 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4858  cold-shock DNA-binding protein family protein  40 
 
 		 136 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.705438  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0248  cold shock protein CspD  32.31 
 
 		 66 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000599312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4701  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  32.31 
 
 		 66 aa  45.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000295831  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0825  cold-shock DNA-binding domain protein  41.67 
 
 		 139 aa  45.1  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.425934  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4475  cold-shock DNA-binding protein family protein  40 
 
 		 147 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.534449  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0278  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  30.16 
 
 		 65 aa  45.1  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01002  ribosome-associated protein Y  31.48 
 
 		 108 aa  44.7  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2454  cold shock protein CspA  33.33 
 
 		 67 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  34.43 
 
 		 67 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2257  cold shock protein CspA  33.33 
 
 		 67 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000681816  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5040  cold shock protein CspC  34.43 
 
 		 67 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2216  cold shock protein  33.33 
 
 		 67 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.62754e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4870  cold shock protein  34.43 
 
 		 67 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2177  cold shock protein  33.33 
 
 		 67 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4885  cold shock protein  34.43 
 
 		 67 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2422  cold shock protein CspA  33.33 
 
 		 67 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000271714  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5424  cold shock protein CspC  34.43 
 
 		 65 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5356  cold shock protein CspC  34.43 
 
 		 67 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0756  cold-shock DNA-binding protein family protein  29.69 
 
 		 66 aa  44.7  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000688666  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3214  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  34.43 
 
 		 67 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0979697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5280  cold shock protein CspC  34.43 
 
 		 67 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584465 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5310  cold shock protein CspC  34.43 
 
 		 65 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2440  cold shock protein CspA  33.33 
 
 		 67 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11145 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5647  cold shock protein CspC  34.43 
 
 		 65 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135799 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5449  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  30.11 
 
 		 94 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265568  normal  0.248856 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4985  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  34.43 
 
 		 67 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2521  cold shock protein CspA  33.33 
 
 		 67 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000175758  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1457  hypothetical protein  62.07 
 
 		 78 aa  43.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.897377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0036  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  32.26 
 
 		 66 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1707  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  39.34 
 
 		 136 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3605  putative cold-shock DNA-binding domain protein  33.87 
 
 		 67 aa  43.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3497  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  32.26 
 
 		 66 aa  42.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000616798  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0028  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  29.51 
 
 		 66 aa  42.7  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000670362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4972  cold shock protein CspD  30.77 
 
 		 66 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4754  cold shock protein CspD  30.77 
 
 		 66 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000181  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1909  cold-shock DNA-binding protein family protein  29.03 
 
 		 69 aa  42.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00215125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  30.77 
 
 		 66 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3598  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  29.23 
 
 		 66 aa  42.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>