61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1524 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1336  PseD  63.59 
 
 
654 aa  797    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  75.08 
 
 
649 aa  972    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  76.07 
 
 
647 aa  986    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1524  motility accessory factor  100 
 
 
638 aa  1302    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  79.85 
 
 
653 aa  1035    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0168  motility accessory factor  51.73 
 
 
638 aa  590  1e-167  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000847186  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  48.5 
 
 
635 aa  502  1e-141  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0166  motility accessory factor  43.88 
 
 
617 aa  472  1e-132  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00679404  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  44.15 
 
 
632 aa  467  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  44.53 
 
 
629 aa  468  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0165  motility accessory factor  41.38 
 
 
625 aa  435  1e-120  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.16921  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1335  motility accessory factor  44.02 
 
 
604 aa  421  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1523  motility accessory factor  42.42 
 
 
626 aa  419  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  38.16 
 
 
666 aa  352  1e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  44.52 
 
 
578 aa  336  9e-91  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  33.98 
 
 
661 aa  312  9e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2228  protein of unknown function DUF115  31.58 
 
 
627 aa  265  2e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  33.39 
 
 
607 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  35.03 
 
 
605 aa  245  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  32.64 
 
 
605 aa  237  4e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  32.66 
 
 
605 aa  236  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  32.89 
 
 
608 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  30.48 
 
 
570 aa  153  1e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  28.87 
 
 
671 aa  124  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  28.04 
 
 
891 aa  100  6e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  23.98 
 
 
618 aa  99.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  24.29 
 
 
629 aa  89.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  24.44 
 
 
616 aa  82  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0451  hypothetical protein  23.57 
 
 
623 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  22.98 
 
 
430 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  23.84 
 
 
841 aa  66.6  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01211  hypothetical protein  29.75 
 
 
676 aa  66.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  28.89 
 
 
470 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  24.93 
 
 
823 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  23.53 
 
 
446 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  24.05 
 
 
648 aa  61.6  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  24.9 
 
 
821 aa  62  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1457  hypothetical protein  23.88 
 
 
507 aa  60.8  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01231  hypothetical protein  26.99 
 
 
673 aa  60.8  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  21.7 
 
 
700 aa  60.5  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  22.5 
 
 
626 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3220  protein of unknown function DUF115  23.51 
 
 
758 aa  58.9  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01241  hypothetical protein  23.17 
 
 
671 aa  58.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.730155 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3053  hypothetical protein  21.51 
 
 
1179 aa  58.2  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  27.27 
 
 
578 aa  57  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0627  protein of unknown function DUF115  21.58 
 
 
871 aa  54.7  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3565  hypothetical protein  26 
 
 
702 aa  53.9  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0447  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 
839 aa  53.9  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  22.71 
 
 
435 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  22.71 
 
 
435 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0174  hypothetical protein  21.47 
 
 
662 aa  53.1  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.899538  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0629  protein of unknown function DUF115  25.35 
 
 
645 aa  52.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822878  hitchhiker  0.000000292404 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  23.68 
 
 
824 aa  52.4  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  22.32 
 
 
841 aa  51.6  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2415  hypothetical protein  20.15 
 
 
656 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.174354  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  21.99 
 
 
430 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2149  protein of unknown function DUF115  35 
 
 
577 aa  46.6  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  19.26 
 
 
826 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2165  hypothetical protein  25.95 
 
 
833 aa  46.2  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0449  hypothetical protein  22.67 
 
 
509 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  25.62 
 
 
441 aa  44.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>