More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0708 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0708  carboxypeptidase  100 
 
 
396 aa  822    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0634  carboxypeptidase  98.23 
 
 
396 aa  808    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.062973  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1065  carboxypeptidase  98.48 
 
 
396 aa  813    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.094231  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  44.92 
 
 
394 aa  363  2e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  42.97 
 
 
405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  44.09 
 
 
403 aa  318  9e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  43.82 
 
 
403 aa  316  5e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  42.49 
 
 
408 aa  316  5e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  41.58 
 
 
405 aa  308  8e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  41.75 
 
 
390 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  40.52 
 
 
405 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  41.46 
 
 
405 aa  305  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  39.89 
 
 
393 aa  296  4e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  43.18 
 
 
396 aa  296  6e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  40.41 
 
 
400 aa  291  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  38.82 
 
 
423 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  38.56 
 
 
398 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  38.97 
 
 
390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  39.53 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  38.72 
 
 
398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  39 
 
 
390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  38.76 
 
 
380 aa  282  7.000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  39.16 
 
 
394 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  38.66 
 
 
398 aa  282  8.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  41.41 
 
 
404 aa  282  9e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  37.98 
 
 
404 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  39.89 
 
 
403 aa  281  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  38.68 
 
 
399 aa  278  9e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0146  amidohydrolase family protein  38.82 
 
 
400 aa  278  1e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  36.81 
 
 
393 aa  276  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  39.14 
 
 
391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  38.83 
 
 
394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  39.89 
 
 
397 aa  273  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  41.64 
 
 
389 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  39.58 
 
 
387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  38.93 
 
 
399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  37.5 
 
 
403 aa  273  6e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  37.59 
 
 
401 aa  273  6e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  39.56 
 
 
402 aa  272  9e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  38.15 
 
 
389 aa  271  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  37.05 
 
 
397 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  38.85 
 
 
387 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  37.31 
 
 
397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  38.48 
 
 
398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0654  M20/M25/M40 family peptidase  39.73 
 
 
390 aa  269  5e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  39.44 
 
 
401 aa  270  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  39.44 
 
 
401 aa  270  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  39.57 
 
 
387 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  38.85 
 
 
387 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  39.63 
 
 
390 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  39.57 
 
 
387 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  40.16 
 
 
404 aa  269  7e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  38.08 
 
 
388 aa  268  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  40.05 
 
 
385 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  40.82 
 
 
412 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  39.16 
 
 
387 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  39.34 
 
 
385 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  38.32 
 
 
387 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  42.27 
 
 
389 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  40.11 
 
 
385 aa  266  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  37.24 
 
 
396 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  38.58 
 
 
387 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  37.24 
 
 
396 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  36 
 
 
396 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  36.98 
 
 
396 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  37.2 
 
 
387 aa  266  7e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  38.06 
 
 
387 aa  265  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  37.98 
 
 
397 aa  265  8e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  37.82 
 
 
397 aa  265  8.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  39.47 
 
 
391 aa  264  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  36.01 
 
 
415 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  36.01 
 
 
415 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  36.01 
 
 
396 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  39.13 
 
 
387 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  41.97 
 
 
390 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  41.9 
 
 
394 aa  263  4e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  37.85 
 
 
388 aa  262  8e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  38.95 
 
 
387 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  37.47 
 
 
399 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  39.05 
 
 
395 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  35.5 
 
 
399 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  40.11 
 
 
389 aa  261  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  37.43 
 
 
424 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  39.3 
 
 
390 aa  260  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  37.74 
 
 
388 aa  260  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3033  peptidase M20D, amidohydrolase  37.57 
 
 
385 aa  260  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  36.63 
 
 
415 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  39.73 
 
 
400 aa  259  8e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  38.77 
 
 
387 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  37.53 
 
 
389 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  36.25 
 
 
425 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  37.54 
 
 
389 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4094  peptidase M20D, amidohydrolase  38.81 
 
 
392 aa  257  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.665516  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  41.48 
 
 
390 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  35.08 
 
 
395 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  37.43 
 
 
425 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0512  peptidase M20D, amidohydrolase  38.92 
 
 
379 aa  257  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  37.87 
 
 
384 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  36.22 
 
 
389 aa  256  5e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  36.34 
 
 
415 aa  255  8e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>