41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2889 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2889  a-glycosyltransferase  100 
 
 		 399 aa  820    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000672894  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3145  Protein of unknown function DUF1972  56.42 
 
 		 402 aa  468  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3051  glycosyl transferase, group 1  48.48 
 
 		 363 aa  345  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2826  glycosyl transferase, group 1  48.6 
 
 		 351 aa  342  5e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1405  glycosyl transferase, group 1  48.19 
 
 		 352 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0023982 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0586  glycosyl transferase, group 1  40.5 
 
 		 360 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.233194 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0206  glycosyltransferase  35.7 
 
 		 402 aa  189  5e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0874911  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2013  glycosyltransferase, RfaG  31.02 
 
 		 368 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0887  Protein of unknown function DUF1972  28.94 
 
 		 399 aa  172  5.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.736373 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5357  hypothetical protein  30.27 
 
 		 394 aa  169  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4249  Protein of unknown function DUF1972  30 
 
 		 373 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.0986637 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16220  hypothetical protein  29.86 
 
 		 368 aa  164  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02940  glycosyltransferase  30.79 
 
 		 379 aa  164  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5479  hypothetical protein  29.32 
 
 		 380 aa  162  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2169  glycosyltransferase-like protein  30.35 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.231417  hitchhiker  0.00000680168 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1781  glycosyltransferase, RfaG  28.73 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  28.77 
 
 		 816 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0995  Protein of unknown function DUF1972  28.88 
 
 		 380 aa  158  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00615148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4445  Protein of unknown function DUF1972  28.84 
 
 		 421 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1423  glycosyl transferase, putative  30.29 
 
 		 384 aa  149  6e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0457556  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1503  glycosyltransferase  29.31 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1437  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  28.94 
 
 		 382 aa  139  7e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000575862  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 		 394 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  23.3 
 
 		 370 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  22.8 
 
 		 370 aa  86.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  21.98 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 		 398 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  21.31 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  21.35 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  21.98 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  21.3 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  23.91 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  20.37 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  20.94 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  20.17 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6507  glycosyl transferase group 1  20.83 
 
 		 356 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0255  glycosyl transferase group 1  20.29 
 
 		 411 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880027  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 		 371 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2914  glycosyl transferase, group 1  31.85 
 
 		 342 aa  46.6  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0369  mannosyltransferase  28.28 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 		 374 aa  43.9  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>