More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2236 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2236  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 590 aa  1213    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2709  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  51.02 
 
 		 590 aa  609  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0186895  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0156  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  41.55 
 
 		 586 aa  479  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1070  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.56 
 
 		 593 aa  350  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04875  DNA mismatch repair protein mutS  34.98 
 
 		 601 aa  340  4e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5542  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.47 
 
 		 610 aa  299  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0359  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33 
 
 		 598 aa  293  9e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3595  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.67 
 
 		 607 aa  290  6e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0161652  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1114  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.66 
 
 		 605 aa  286  8e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2469  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.4 
 
 		 626 aa  269  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4132  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.18 
 
 		 610 aa  268  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2411  MutS domain-containing protein  33.56 
 
 		 595 aa  267  4e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2123  MutS domain-containing protein  33.56 
 
 		 595 aa  267  4e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2141  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.86 
 
 		 624 aa  266  8e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0247  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  32.23 
 
 		 601 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0988  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.66 
 
 		 615 aa  259  8e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0656  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.32 
 
 		 604 aa  256  7e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2027  MutS-like mismatch repair protein, ATPase  30.37 
 
 		 596 aa  254  4.0000000000000004e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2547  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.87 
 
 		 597 aa  234  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2451  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.35 
 
 		 597 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.412357  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1406  DNA mismatch repair protein MutS-like  33.14 
 
 		 597 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2424  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  29.64 
 
 		 594 aa  209  8e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720949  normal  0.166887 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3182  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  27.23 
 
 		 618 aa  200  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1160  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.59 
 
 		 554 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0562  DNA mismatch repair protein MutS-like  36.55 
 
 		 243 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0552  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  27.27 
 
 		 555 aa  127  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0300  MutS domain-containing protein  28.93 
 
 		 521 aa  120  9e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0305  MutS domain-containing protein  30.37 
 
 		 521 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.667577  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0886  MutS domain-containing protein  25 
 
 		 557 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2383  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  36.21 
 
 		 558 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.356876  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2122  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.33 
 
 		 536 aa  110  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0365547  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2085  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.33 
 
 		 536 aa  110  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00891152  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.68 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7097  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.71 
 
 		 443 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000373438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0706  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.22 
 
 		 438 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.574952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2667  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32 
 
 		 442 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0622  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  45.54 
 
 		 112 aa  103  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000499338  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1660  MutS family protein  25.78 
 
 		 538 aa  99  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0221998  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3053  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.16 
 
 		 450 aa  98.6  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3054  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.05 
 
 		 437 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.613085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  29.91 
 
 		 868 aa  94  7e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  30.12 
 
 		 869 aa  91.3  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  28.17 
 
 		 776 aa  86.3  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  31.34 
 
 		 956 aa  84.7  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  30.84 
 
 		 860 aa  84.3  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1159  DNA mismatch repair protein MutS  29.02 
 
 		 850 aa  82.4  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0179722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  28.4 
 
 		 887 aa  82.8  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  27.65 
 
 		 859 aa  82  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  28.38 
 
 		 917 aa  82  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  27.43 
 
 		 815 aa  81.6  0.00000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  26.57 
 
 		 793 aa  80.5  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  27.04 
 
 		 881 aa  80.1  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  26.43 
 
 		 793 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  31.4 
 
 		 918 aa  79.3  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  27.23 
 
 		 860 aa  78.6  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2284  DNA mismatch repair protein MutS  29.5 
 
 		 897 aa  78.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.339354  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  30.59 
 
 		 848 aa  78.6  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  29.41 
 
 		 853 aa  78.2  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  30.39 
 
 		 750 aa  78.2  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  30.58 
 
 		 868 aa  77.8  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  30.23 
 
 		 910 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  28.37 
 
 		 846 aa  77.4  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  30.23 
 
 		 910 aa  77.8  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2666  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.56 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  26.58 
 
 		 856 aa  76.6  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  28.37 
 
 		 846 aa  77  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  29.63 
 
 		 804 aa  76.3  0.000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01479  DNA-binding protein of the mitochondria (Eurofung)  28.03 
 
 		 924 aa  75.9  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1151  DNA mismatch repair protein MutS  29.11 
 
 		 882 aa  76.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75556  normal  0.534383 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0916  hypothetical protein  27.49 
 
 		 685 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0756379 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  29.92 
 
 		 804 aa  74.3  0.000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  27.66 
 
 		 873 aa  74.3  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  32.3 
 
 		 858 aa  74.3  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  29.11 
 
 		 817 aa  73.9  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0670  DNA mismatch repair protein MutS  28.28 
 
 		 902 aa  73.9  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.48055  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  27.62 
 
 		 864 aa  73.9  0.000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  28.37 
 
 		 893 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  25.81 
 
 		 884 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  25.81 
 
 		 884 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0993  DNA mismatch repair protein MutS  28.17 
 
 		 882 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0273389  normal  0.417331 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5989  DNA mismatch repair protein MutS  28.84 
 
 		 885 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  27.16 
 
 		 886 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  27.68 
 
 		 856 aa  73.2  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  32.35 
 
 		 872 aa  73.2  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  31.68 
 
 		 872 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  26.67 
 
 		 878 aa  72.8  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  27.02 
 
 		 873 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  29.34 
 
 		 871 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  28.07 
 
 		 855 aa  72.4  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  28.71 
 
 		 761 aa  72  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1998  DNA mismatch repair protein MutS  27.91 
 
 		 885 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368418 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  28.05 
 
 		 883 aa  72.4  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2124  DNA mismatch repair protein MutS  27.91 
 
 		 886 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  26.74 
 
 		 893 aa  72  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  27.43 
 
 		 855 aa  71.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  26.29 
 
 		 862 aa  71.6  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  26.8 
 
 		 900 aa  71.6  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  28.92 
 
 		 968 aa  71.6  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  26.16 
 
 		 852 aa  71.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2064  mismatch repair ATPase  36.22 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>