More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1787 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1787  recombinase A  100 
 
 		 348 aa  699    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.744188  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0616  recombinase A  80.46 
 
 		 364 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2094  recombinase A  81.56 
 
 		 365 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1669  recombinase A  82.22 
 
 		 343 aa  578  1e-164  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1845  recombinase A  82.22 
 
 		 343 aa  578  1e-164  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2047  recombinase A  81.92 
 
 		 343 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.161674  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0153  recombinase A  81.69 
 
 		 344 aa  573  1.0000000000000001e-162  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0201  recombinase A  82.16 
 
 		 345 aa  567  1e-161  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.911025  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2236  recA protein  77.03 
 
 		 347 aa  552  1e-156  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2002  recombinase A  77.13 
 
 		 345 aa  527  1e-148  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  67.54 
 
 		 350 aa  480  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  69.02 
 
 		 366 aa  471  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  68.4 
 
 		 355 aa  471  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  69.33 
 
 		 361 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  65.5 
 
 		 348 aa  470  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  65.2 
 
 		 348 aa  469  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  69.11 
 
 		 343 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  65.98 
 
 		 357 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  69.33 
 
 		 424 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  68.71 
 
 		 362 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  69.02 
 
 		 364 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  66.18 
 
 		 356 aa  466  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  65.49 
 
 		 363 aa  464  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  68.71 
 
 		 361 aa  464  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  67.65 
 
 		 357 aa  466  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5503  recA protein  70.52 
 
 		 363 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  67.58 
 
 		 360 aa  466  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0291  recA protein  70.21 
 
 		 363 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0355806  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  68.4 
 
 		 362 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  64.01 
 
 		 347 aa  462  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  68.1 
 
 		 361 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  66.17 
 
 		 345 aa  462  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  69.33 
 
 		 357 aa  464  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  65.71 
 
 		 363 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  66.17 
 
 		 345 aa  462  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  69.84 
 
 		 365 aa  459  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  66.67 
 
 		 347 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2629  recA protein  68.9 
 
 		 366 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  64 
 
 		 362 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  63.37 
 
 		 347 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  67.8 
 
 		 336 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  64.57 
 
 		 364 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2228  recA protein  66.57 
 
 		 363 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  62.76 
 
 		 348 aa  460  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  64.86 
 
 		 363 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  65.38 
 
 		 360 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  65.24 
 
 		 347 aa  457  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2824  recA protein  69.51 
 
 		 366 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217843  normal  0.126726 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2601  recA protein  69.51 
 
 		 366 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  67.18 
 
 		 343 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  67.79 
 
 		 347 aa  458  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  65.24 
 
 		 347 aa  457  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  64.6 
 
 		 362 aa  460  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  65.54 
 
 		 383 aa  454  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  63.43 
 
 		 362 aa  457  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  66.36 
 
 		 348 aa  456  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  64.57 
 
 		 363 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  67.69 
 
 		 359 aa  455  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  66.97 
 
 		 361 aa  454  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  65.79 
 
 		 356 aa  456  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  66.06 
 
 		 349 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  63.71 
 
 		 362 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  64.64 
 
 		 348 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  65.35 
 
 		 384 aa  451  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  62.82 
 
 		 349 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1629  recombinase A  65.14 
 
 		 355 aa  447  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.849206  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1643  recombinase A  70.55 
 
 		 355 aa  448  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.883064  decreased coverage  0.00000000000602005 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0100  recombinase A  62.43 
 
 		 347 aa  449  1e-125  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4088  recombinase A  65.14 
 
 		 355 aa  447  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1231  recombinase A  65.14 
 
 		 355 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000176903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17530  recombinase A  62.1 
 
 		 346 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  64.76 
 
 		 379 aa  450  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  62.1 
 
 		 346 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  65.44 
 
 		 347 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_002978  WD1050  recombinase A  62.14 
 
 		 355 aa  445  1.0000000000000001e-124  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0086  recombinase A  61.85 
 
 		 347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000139683  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  65.65 
 
 		 356 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  66.88 
 
 		 358 aa  447  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  65.65 
 
 		 356 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  65.65 
 
 		 356 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  64.74 
 
 		 345 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  62.91 
 
 		 341 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  65.65 
 
 		 356 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  66.26 
 
 		 338 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  65.65 
 
 		 356 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4030  recombinase A  65.14 
 
 		 355 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104307  unclonable  0.0000000000000597568 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  65.35 
 
 		 359 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00149  recombinase A  62.21 
 
 		 344 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.781257  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  63.95 
 
 		 344 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  63.58 
 
 		 352 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  63.58 
 
 		 352 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  65.65 
 
 		 356 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  65.35 
 
 		 359 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  66.26 
 
 		 338 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  65.64 
 
 		 358 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  65.65 
 
 		 356 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  64.46 
 
 		 358 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  67.2 
 
 		 377 aa  442  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  64.26 
 
 		 358 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2014  recombinase A  62.86 
 
 		 352 aa  442  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.306298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>