235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0629 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0629  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  470  1e-132  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.41007  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0498  Methyltransferase type 11  40.09 
 
 
229 aa  155  4e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216878  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0890  hypothetical protein  35.37 
 
 
227 aa  129  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  30.14 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  30.54 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  31.9 
 
 
266 aa  68.6  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.56 
 
 
259 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  29.41 
 
 
239 aa  62.8  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  23.47 
 
 
240 aa  62.4  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  30.1 
 
 
237 aa  62  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  33.06 
 
 
269 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0753  Methyltransferase type 11  32.24 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  27.03 
 
 
258 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  25.31 
 
 
259 aa  58.9  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  27.65 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  30 
 
 
232 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  30.07 
 
 
237 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  26.62 
 
 
238 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  26.62 
 
 
238 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  36.27 
 
 
296 aa  56.6  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  25 
 
 
249 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  29.41 
 
 
237 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  28.95 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  28.95 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  31.76 
 
 
275 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  25.93 
 
 
442 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
195 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  29.41 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
220 aa  53.5  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  30.72 
 
 
237 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  32.98 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  29.41 
 
 
239 aa  53.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  29.69 
 
 
254 aa  53.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4536  methyltransferase type 11  30.28 
 
 
259 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  25.99 
 
 
247 aa  52.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3410  Methyltransferase type 11  34.09 
 
 
254 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.611266  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  32.24 
 
 
248 aa  52.4  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  32.24 
 
 
248 aa  52.4  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  30.57 
 
 
233 aa  52.4  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3350  methyltransferase type 11  35.05 
 
 
267 aa  52  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  30.91 
 
 
251 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  30.41 
 
 
276 aa  51.6  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 
244 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  30.19 
 
 
256 aa  51.2  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  28.38 
 
 
249 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1296  hypothetical protein  34.23 
 
 
248 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0615608  normal  0.430138 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  28.38 
 
 
249 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4608  methyltransferase type 11  22.64 
 
 
242 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  33.03 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  30.41 
 
 
260 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2042  methyltransferase type 11  36.7 
 
 
256 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646082  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  30.36 
 
 
436 aa  50.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  25.33 
 
 
250 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1643  Methyltransferase type 11  25.47 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  28.38 
 
 
249 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  28.38 
 
 
249 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  30.77 
 
 
201 aa  50.1  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  27.7 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  28.38 
 
 
249 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  28.38 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  28.38 
 
 
249 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  26.06 
 
 
201 aa  49.7  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  28.1 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0061  Orf34  25.81 
 
 
246 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1240  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 
242 aa  49.3  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1474  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.81 
 
 
246 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0302671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  27.7 
 
 
249 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 
252 aa  48.9  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1936  methyltransferase type 11  27.5 
 
 
213 aa  48.9  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227883  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1102  methyltransferase type 11  30.47 
 
 
249 aa  48.9  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.27 
 
 
302 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  25.37 
 
 
442 aa  48.5  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.27 
 
 
300 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.27 
 
 
300 aa  48.5  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.27 
 
 
300 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.27 
 
 
300 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.27 
 
 
300 aa  48.5  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.27 
 
 
300 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0078  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
273 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682251  hitchhiker  0.000120825 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0919  chromosome segregation ATPase  25.9 
 
 
646 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.446373  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7150  methyltransferase  29.33 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4011  methyltransferase type 12  30.48 
 
 
317 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.550687  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  29.31 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  28.7 
 
 
291 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3485  Methyltransferase type 11  26.96 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  30.19 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1193  Methyltransferase type 11  35.56 
 
 
215 aa  48.5  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0170367  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1562  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.2 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  25.26 
 
 
341 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0477  Methyltransferase type 11  26.02 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3603  hypothetical protein  32.41 
 
 
246 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.879922  normal  0.0916284 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  29.25 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4122  methyltransferase type 11  23.13 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  25.47 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  25.54 
 
 
192 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  26.36 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.09 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1380  putative methylase  34.19 
 
 
178 aa  47  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>