289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1755 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1755  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  305  1.0000000000000001e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000000961242  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0940  hypothetical protein  80.79 
 
 
151 aa  258  2e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0536  hypothetical protein  65.33 
 
 
151 aa  197  5e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0250  hypothetical protein  64.24 
 
 
149 aa  187  5e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.18043  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0533  protein of unknown function DUF163  51.66 
 
 
151 aa  168  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000694235  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0161  hypothetical protein  47.68 
 
 
149 aa  148  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.366222  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0139  hypothetical protein  47.68 
 
 
149 aa  148  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.500957  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0213  conserved hypothetical protein (DUF163 domain protein)  46.36 
 
 
151 aa  147  4e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0121  hypothetical protein  47.02 
 
 
153 aa  147  6e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1172  hypothetical protein  41.45 
 
 
152 aa  124  5e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  30.32 
 
 
153 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  35.9 
 
 
152 aa  89.4  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  44.83 
 
 
156 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  32.91 
 
 
155 aa  86.3  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  43.53 
 
 
153 aa  84.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  31.21 
 
 
157 aa  82  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  29.03 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  32.72 
 
 
160 aa  80.1  0.000000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  31.61 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2439  hypothetical protein  40 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  27.74 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  30.32 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  27.74 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  32.48 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0024  hypothetical protein  30.77 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.820161  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  43.18 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1183  hypothetical protein  32.89 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0747  protein of unknown function DUF163  39.58 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1551  hypothetical protein  39.08 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1342  rRNA large subunit methyltransferase  39.53 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  32.08 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1512  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000386318  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  28.57 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  30 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0544  protein of unknown function DUF163  37.65 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  27.74 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  41.3 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2393  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147472  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2080  rRNA large subunit methyltransferase  41.86 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1993  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350093  normal  0.83098 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  36.05 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  36.05 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  36.05 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  37.21 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0613  rRNA large subunit methyltransferase  28.85 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1242  rRNA large subunit methyltransferase  36.05 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  36.05 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  36.05 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  36.05 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  36.05 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  37.21 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  37.21 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  36.05 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  37.21 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  37.21 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  29.01 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  37.21 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  29.01 
 
 
159 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3014  rRNA large subunit methyltransferase  28.05 
 
 
160 aa  73.6  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0634983  normal  0.903693 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  29.27 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2517  rRNA large subunit methyltransferase  40.7 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148651  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  26.45 
 
 
157 aa  73.6  0.0000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2139  hypothetical protein  32.58 
 
 
154 aa  73.6  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.895316  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  36.05 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0164  rRNA large subunit methyltransferase  38.89 
 
 
160 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2291  hypothetical protein  37.93 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  37.21 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  38.64 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  36.05 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  30 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  37.21 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  37.21 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  29.01 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  27.95 
 
 
159 aa  72  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  29.01 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  29.01 
 
 
159 aa  72  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  29.01 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1773  rRNA large subunit methyltransferase  29.41 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  29.01 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0362  hypothetical protein  29.75 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  29.38 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  29.01 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  27.95 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1420  hypothetical protein  37.21 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  30.06 
 
 
159 aa  72  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  29.01 
 
 
159 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1840  rRNA large subunit methyltransferase  29.71 
 
 
174 aa  72  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09251  hypothetical protein  38.55 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  29.56 
 
 
159 aa  72  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2526  rRNA large subunit methyltransferase  38.82 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.631198  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  30.49 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  29.01 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3525  rRNA large subunit methyltransferase  36.78 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144296  normal  0.0487834 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  27.95 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2688  rRNA large subunit methyltransferase  36.47 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169878  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1082  protein of unknown function DUF163  37.08 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  28.48 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  30.19 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  40.23 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>