More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0460 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0460  TatD family hydrolase  100 
 
 
261 aa  527  1e-149  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1985  glyoxalase II  81.82 
 
 
253 aa  421  1e-117  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1192  YabD  64.2 
 
 
254 aa  333  1e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.937754  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0653  TatD-related deoxyribonuclease  62.5 
 
 
265 aa  316  2e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0953194  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0747  TatD family hydrolase  61.09 
 
 
271 aa  311  4.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1355  TatD family hydrolase  60.31 
 
 
271 aa  311  7.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.300834  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0672  TatD family hydrolase  60.7 
 
 
271 aa  311  9e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0660  hydrolase, TatD family  57.59 
 
 
266 aa  301  8.000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0516456  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0299  putative deoxyribonuclease Sll1786  61.15 
 
 
256 aa  294  8e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.858826  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1083  TatD-related deoxyribonuclease  56.42 
 
 
258 aa  265  7e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.634743  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  44.44 
 
 
255 aa  204  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  40.61 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  41.38 
 
 
256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  41.22 
 
 
255 aa  193  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  39.46 
 
 
457 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  40.84 
 
 
255 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  40.84 
 
 
255 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  40.84 
 
 
255 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  40.84 
 
 
255 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  40.46 
 
 
255 aa  191  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  40.46 
 
 
255 aa  191  9e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  40.46 
 
 
255 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  41 
 
 
257 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  39.69 
 
 
256 aa  190  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  39.31 
 
 
256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  40.46 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  40.84 
 
 
255 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  39.69 
 
 
255 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  39.39 
 
 
257 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  39.39 
 
 
257 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  38.7 
 
 
255 aa  186  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  40.68 
 
 
256 aa  185  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  39 
 
 
256 aa  185  6e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  40.84 
 
 
606 aa  185  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  41 
 
 
256 aa  184  9e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  37.4 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  39 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  37.74 
 
 
259 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  41.15 
 
 
255 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  39.23 
 
 
264 aa  183  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  40.84 
 
 
251 aa  183  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  39.39 
 
 
256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  40.23 
 
 
262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  37.02 
 
 
258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  36.88 
 
 
464 aa  181  7e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  38.02 
 
 
255 aa  181  8.000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  38.02 
 
 
255 aa  181  9.000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  37.4 
 
 
255 aa  180  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  39.85 
 
 
283 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  39.46 
 
 
280 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  39.85 
 
 
283 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  39.85 
 
 
283 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  39.08 
 
 
458 aa  180  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  39.08 
 
 
458 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  38.31 
 
 
262 aa  179  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  38.85 
 
 
256 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  36.78 
 
 
268 aa  178  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  38.78 
 
 
462 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  38.93 
 
 
261 aa  177  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  36.84 
 
 
262 aa  177  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  39.54 
 
 
262 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  38.55 
 
 
262 aa  177  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  37.22 
 
 
262 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  38.64 
 
 
263 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  39.85 
 
 
266 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  38.93 
 
 
262 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  38.7 
 
 
262 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  37.4 
 
 
461 aa  176  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1769  TatD family hydrolase  39.46 
 
 
266 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.655605 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  40.3 
 
 
256 aa  175  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2068  TatD-related deoxyribonuclease  37.64 
 
 
262 aa  175  8e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  39.23 
 
 
257 aa  175  8e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  36.02 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1739  TatD family hydrolase  39.46 
 
 
274 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.50309  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  36.5 
 
 
273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  37.02 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  38.93 
 
 
264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  38.08 
 
 
462 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  37.79 
 
 
262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  36.15 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  38.08 
 
 
258 aa  172  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1926  TatD family hydrolase  37.16 
 
 
262 aa  172  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  38.17 
 
 
263 aa  172  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  36.78 
 
 
262 aa  171  9e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2265  TatD family hydrolase  36.36 
 
 
266 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  37.16 
 
 
253 aa  170  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  38.11 
 
 
260 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  38.17 
 
 
263 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  36.74 
 
 
263 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16771  TatD family deoxyribonuclease  36.64 
 
 
264 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  38.55 
 
 
265 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  37.55 
 
 
263 aa  170  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  35.25 
 
 
255 aa  169  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  37.84 
 
 
257 aa  169  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  36.64 
 
 
258 aa  169  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  35.77 
 
 
259 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5191  TatD-related deoxyribonuclease  35.38 
 
 
259 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  34.85 
 
 
263 aa  169  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  35.77 
 
 
259 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  35.77 
 
 
259 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>