More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0399 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0399  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
254 aa  509  1e-143  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0496  phosphomethylpyrimidine kinase  46.5 
 
 
244 aa  227  2e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0011  phosphomethylpyrimidine kinase superfamily protein  45.71 
 
 
244 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  42.41 
 
 
263 aa  169  3e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  39.69 
 
 
262 aa  162  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  39.75 
 
 
268 aa  156  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  39.75 
 
 
268 aa  155  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  38.4 
 
 
268 aa  155  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  38.4 
 
 
281 aa  154  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
269 aa  154  2e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  38.52 
 
 
265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  39.2 
 
 
271 aa  152  7e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  36.96 
 
 
264 aa  151  8e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  40.32 
 
 
267 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  38.82 
 
 
266 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  40.17 
 
 
271 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  38.76 
 
 
269 aa  150  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  38 
 
 
270 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 
266 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  36.26 
 
 
271 aa  148  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  36.11 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  36.36 
 
 
267 aa  146  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  33.72 
 
 
265 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  36.61 
 
 
267 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  36.29 
 
 
288 aa  145  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  39.68 
 
 
269 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  37.65 
 
 
290 aa  144  9e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  35.97 
 
 
267 aa  144  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  37.71 
 
 
264 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  35.86 
 
 
282 aa  142  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  35.77 
 
 
264 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  35.66 
 
 
267 aa  142  6e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  39.83 
 
 
268 aa  142  7e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  38.02 
 
 
492 aa  142  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  33.06 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  36.29 
 
 
531 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  38.86 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  36.47 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  37.79 
 
 
490 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  37.6 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  37.65 
 
 
260 aa  138  7e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  33.85 
 
 
264 aa  138  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  40.17 
 
 
260 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  36.05 
 
 
266 aa  138  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  35.77 
 
 
266 aa  138  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  34.78 
 
 
266 aa  138  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  36.71 
 
 
268 aa  137  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  34.34 
 
 
288 aa  137  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  34.34 
 
 
288 aa  137  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  35.41 
 
 
518 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000135123 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  33.59 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  33.59 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  36.1 
 
 
497 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  33.59 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  33.59 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  33.59 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  34.24 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  33.59 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1636  phosphomethylpyrimidine kinase  36.33 
 
 
499 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431333  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  38.37 
 
 
278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  37.39 
 
 
295 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  33.59 
 
 
266 aa  135  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  33.08 
 
 
266 aa  136  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  33.59 
 
 
266 aa  135  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  32.22 
 
 
265 aa  135  5e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  34.51 
 
 
267 aa  135  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  35.78 
 
 
285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  40.3 
 
 
497 aa  135  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  34.24 
 
 
266 aa  135  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  35.86 
 
 
286 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  34.24 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  34.7 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  37.08 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  34.5 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  34.57 
 
 
494 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  31.79 
 
 
510 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  32.55 
 
 
432 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  35.1 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  35.71 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  32.94 
 
 
267 aa  133  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  34.68 
 
 
269 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  33.59 
 
 
266 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  33.59 
 
 
266 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  36.43 
 
 
285 aa  132  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  36.43 
 
 
266 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0042  phosphomethylpyrimidine kinase  39.41 
 
 
284 aa  131  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0834315  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  33.98 
 
 
266 aa  131  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  32.68 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2132  phosphomethylpyrimidine kinase  41.34 
 
 
282 aa  130  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.588203  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  41.39 
 
 
269 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  37.24 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  41.8 
 
 
269 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  36.48 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  41.8 
 
 
269 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  41.8 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  33.59 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2484  phosphomethylpyrimidine kinase  34.84 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  33.59 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  35.22 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  41.39 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>