73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1931 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009727  CBUD_1931  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase family protein  100 
 
 		 412 aa  853    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.808673  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2884  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  51.92 
 
 		 419 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5295  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  50.95 
 
 		 417 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0778158  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2595  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  48.66 
 
 		 413 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1418  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  50 
 
 		 420 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2613  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  48.81 
 
 		 419 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.457692  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1384  putative polyketide biosynthesis protein pksG  48.81 
 
 		 419 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1470  putative polyketide biosynthesis protein pksG  48.81 
 
 		 419 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0349844  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1670  polyketide biosynthesis protein  47.72 
 
 		 418 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.130518  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1212  polyketide biosynthesis protein, interruption-N  51.62 
 
 		 389 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.737994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2601  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  44.17 
 
 		 424 aa  363  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.914531 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2518  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  36.39 
 
 		 412 aa  260  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2608  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  36.39 
 
 		 412 aa  260  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2969  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  36.55 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  hitchhiker  0.0000211937 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1179  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  33.25 
 
 		 407 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1719  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  32.69 
 
 		 389 aa  203  5e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.396765  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8252  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  31.39 
 
 		 396 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1291  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  35.66 
 
 		 383 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0676  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  34.25 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000283469  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1316  HMG-CoA synthase  33.43 
 
 		 390 aa  159  6e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.717019  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2122  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  30.51 
 
 		 388 aa  159  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2622  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  31.48 
 
 		 388 aa  156  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2569  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  31.48 
 
 		 388 aa  156  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1666  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  30.93 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.696762  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1184  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  33.33 
 
 		 385 aa  152  7e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.298537  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0968  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  34.35 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0621  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase (HMG-CoA synthase)  33.33 
 
 		 391 aa  144  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000102903  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1372  3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA synthase  32.15 
 
 		 387 aa  143  5e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.998569  hitchhiker  0.00000000102593 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0359  putative hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  30.45 
 
 		 437 aa  140  3e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2313  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  28.71 
 
 		 447 aa  140  6e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.859835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2310  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.96 
 
 		 445 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2766  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  28.02 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0401  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  28.02 
 
 		 445 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1739  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  27.4 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4396  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  29.12 
 
 		 369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0133862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0703  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  28.88 
 
 		 407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04923  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, expressed (Eurofung)  28.17 
 
 		 459 aa  109  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000140052  normal  0.183137 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_83020  predicted protein  27.92 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0678  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.22 
 
 		 453 aa  88.6  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0215835  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02670  conserved hypothetical protein  24.75 
 
 		 492 aa  88.2  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.250048  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16649  predicted protein  25.95 
 
 		 461 aa  80.9  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24052  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05080  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, putative  23 
 
 		 498 aa  79.7  0.00000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0146937  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0828  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.01 
 
 		 464 aa  79  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0208074 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1142  hypothetical protein  25.07 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448183  hitchhiker  0.000356194 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0811  hypothetical protein  21.73 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.836821  hitchhiker  0.000111453 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1082  hypothetical protein  22.74 
 
 		 350 aa  55.5  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0551  hypothetical protein  25.08 
 
 		 349 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0526  hypothetical protein  25.17 
 
 		 349 aa  52.8  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0379  hypothetical protein  24.33 
 
 		 349 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0458  hypothetical protein  24.02 
 
 		 349 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.288502  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1607  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.06 
 
 		 350 aa  50.4  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1461  hypothetical protein  24.33 
 
 		 349 aa  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0793  hypothetical protein  23.27 
 
 		 349 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2176  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.49 
 
 		 317 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00253287  hitchhiker  0.000000000000149939 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1993  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.49 
 
 		 317 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302649  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1263  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.49 
 
 		 317 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00141014  normal  0.134616 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1307  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.49 
 
 		 317 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0184872  hitchhiker  0.000000000000113023 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1292  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.49 
 
 		 317 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000523087  hitchhiker  2.7964e-16 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1585  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  30.92 
 
 		 316 aa  47.4  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421947  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3869  hypothetical protein  23.28 
 
 		 348 aa  46.6  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1646  hypothetical protein  24.12 
 
 		 348 aa  46.6  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1212  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.57 
 
 		 317 aa  46.6  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1470  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.57 
 
 		 317 aa  46.6  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000946289  hitchhiker  0.00000000000127697 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2233  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.57 
 
 		 317 aa  46.6  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000918964  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2036  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.57 
 
 		 317 aa  46.6  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000955089  decreased coverage  0.000000634537 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2556  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  28.57 
 
 		 317 aa  46.6  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000231699  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0020  hypothetical protein  21.15 
 
 		 348 aa  45.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17460  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  33.33 
 
 		 343 aa  45.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.352579  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01095  hypothetical protein  31.25 
 
 		 317 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000485703  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2510  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  31.25 
 
 		 317 aa  43.9  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000101658  hitchhiker  0.0000844737 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1213  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  31.25 
 
 		 317 aa  43.9  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.16382e-21  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01087  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase  31.25 
 
 		 317 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000578388  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0602  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.97 
 
 		 319 aa  43.1  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000174189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>