72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04145 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_02230  metalloprotease, putative  56.84 
 
 
927 aa  1060    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493351  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04145  metalloprotease, putative  100 
 
 
935 aa  1909    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.18498  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  41.28 
 
 
887 aa  632  1e-180  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  34.04 
 
 
1393 aa  253  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  33.68 
 
 
1393 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3767  protease domain-containing protein  35.11 
 
 
1311 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363962 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2937  protease-associated PA  35.47 
 
 
730 aa  221  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3130  peptidase M36 fungalysin  34.55 
 
 
730 aa  199  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146648  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3023  protease-associated PA domain protein  34.55 
 
 
730 aa  197  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0449431  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1217  metalloprotease, putative  41.86 
 
 
839 aa  172  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000727805  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01650  Extracellular elastinolytic metalloproteinase precursor, putative  34.04 
 
 
831 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.462944  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2538  coagulation factor 5/8 type-like protein  33.5 
 
 
1043 aa  82.8  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3035  protease domain-containing protein  34.19 
 
 
1053 aa  75.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559762  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1810  peptidase M36, fungalysin  29.96 
 
 
1146 aa  73.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3266  peptidase M36 fungalysin  27.85 
 
 
1168 aa  67.8  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0508645  normal  0.0224871 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0669  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.14 
 
 
728 aa  66.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5348  peptidase M36 fungalysin  36.23 
 
 
950 aa  66.6  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  36.56 
 
 
617 aa  65.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  38.2 
 
 
1220 aa  65.1  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0492  peptidase M36 fungalysin  31.52 
 
 
1147 aa  65.1  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.921805 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01825  hypothetical protein  41.11 
 
 
654 aa  63.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.38 
 
 
891 aa  59.3  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3304  protease-associated PA domain protein  43.18 
 
 
567 aa  59.3  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150395  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3188  protease-associated PA  44.71 
 
 
567 aa  58.5  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  40.45 
 
 
1093 aa  57.4  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  32.82 
 
 
1406 aa  57.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  32.06 
 
 
1407 aa  55.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3909  serine protease  40 
 
 
1042 aa  55.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  37.21 
 
 
1407 aa  55.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  37.21 
 
 
1407 aa  55.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.26 
 
 
1323 aa  55.1  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1915  serine protease  32.41 
 
 
1300 aa  54.7  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.2 
 
 
1212 aa  53.9  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  37.5 
 
 
365 aa  53.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16187  predicted protein  34.15 
 
 
501 aa  51.6  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03265  hypothetical protein  31.4 
 
 
528 aa  51.6  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0507671  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  41.77 
 
 
1215 aa  51.6  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0547  hypothetical protein  35.06 
 
 
112 aa  51.2  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2849  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.75 
 
 
1160 aa  51.2  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00446023  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.8 
 
 
1776 aa  50.8  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 
1212 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05520  hypothetical protein  35.42 
 
 
742 aa  49.7  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.53 
 
 
1283 aa  49.7  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3313  cold-active alkaline serine protease  35.23 
 
 
514 aa  49.7  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  30.56 
 
 
1300 aa  49.7  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1052  hypothetical protein  29.33 
 
 
827 aa  48.9  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.255534 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  34.67 
 
 
669 aa  48.9  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  27.78 
 
 
2239 aa  48.5  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2028  neutral metalloprotease  29.08 
 
 
503 aa  48.1  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12889  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3585  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 
1212 aa  48.1  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2183  neutral metalloprotease  29.08 
 
 
503 aa  48.1  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17749  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.44 
 
 
1293 aa  48.1  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  40.96 
 
 
548 aa  48.1  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3517  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 
1212 aa  47.8  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.183545 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01630  aminopeptidase Y  42.5 
 
 
509 aa  47.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.777606  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  33.33 
 
 
614 aa  47.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  34.88 
 
 
513 aa  47.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2562  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.76 
 
 
1049 aa  47.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.236427  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2202  putative neutral metalloprotease  29.08 
 
 
503 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000414955 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1996  bacillolysin  29.08 
 
 
503 aa  47.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2324  putative neutral metalloprotease  27.92 
 
 
503 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000332319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1978  bacillolysin  27.92 
 
 
503 aa  47  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2242  neutral metalloprotease, putative  27.92 
 
 
503 aa  47  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.848329  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4089  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  39.47 
 
 
720 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.498931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  26.12 
 
 
491 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3130  putative neutral metalloprotease  26.94 
 
 
503 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0709705  normal  0.0367114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1621  peptidase  27.92 
 
 
502 aa  46.2  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.379555  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2189  putative neutral metalloprotease  26.94 
 
 
503 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2185  beta and gamma crystallin  28.38 
 
 
483 aa  45.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421381  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  28.78 
 
 
510 aa  44.7  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06200  YurI  29.03 
 
 
657 aa  44.7  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2017  peptidase  28.06 
 
 
503 aa  44.7  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0329262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>